80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VEA_000887 on replicon NC_013457
Organism: Vibrio sp. Ex25



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  100 
 
 		 615 aa  1288    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  55.52 
 
 		 622 aa  706    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  56.03 
 
 		 622 aa  708    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  55.28 
 
 		 621 aa  686    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  54.89 
 
 		 619 aa  696    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  54.83 
 
 		 618 aa  675    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  91.22 
 
 		 615 aa  1186    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  75.57 
 
 		 615 aa  996    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  40.95 
 
 		 624 aa  421  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0604  hypothetical protein  24.86 
 
 		 507 aa  66.2  0.000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  26.67 
 
 		 569 aa  62.8  0.00000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.43 
 
 		 729 aa  59.7  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  23.71 
 
 		 676 aa  58.9  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  30.06 
 
 		 749 aa  57  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  24.21 
 
 		 682 aa  54.7  0.000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  23.08 
 
 		 528 aa  52.8  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  25.1 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.14 
 
 		 685 aa  51.6  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.77 
 
 		 714 aa  51.6  0.00005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  25.1 
 
 		 563 aa  51.2  0.00006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  25.45 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  23.36 
 
 		 548 aa  49.7  0.0001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  25.45 
 
 		 563 aa  49.7  0.0001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  24.62 
 
 		 679 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0781  hypothetical protein  27.06 
 
 		 504 aa  49.7  0.0001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  21.32 
 
 		 683 aa  49.7  0.0002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  25.36 
 
 		 563 aa  48.5  0.0004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  25.65 
 
 		 625 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  25.81 
 
 		 507 aa  48.1  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.86 
 
 		 716 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.86 
 
 		 716 aa  47.8  0.0005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.86 
 
 		 716 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.86 
 
 		 716 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.86 
 
 		 716 aa  47.8  0.0006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.93 
 
 		 626 aa  47.8  0.0006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.38 
 
 		 716 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.94 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.38 
 
 		 716 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.38 
 
 		 716 aa  46.6  0.001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.94 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.94 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  25.23 
 
 		 548 aa  47  0.001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.49 
 
 		 689 aa  46.6  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.86 
 
 		 717 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.88 
 
 		 598 aa  47  0.001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.14 
 
 		 716 aa  46.6  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.94 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  21.43 
 
 		 579 aa  46.2  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_002950  PG1789  peptidyl-dipeptidase Dcp  27.98 
 
 		 678 aa  45.1  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  25.63 
 
 		 577 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  23.77 
 
 		 677 aa  45.4  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21040  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.11 
 
 		 699 aa  45.4  0.003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.547895  normal  0.690567 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2001  oligoendopeptidase F, putative  26.09 
 
 		 597 aa  45.8  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0875927  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.29 
 
 		 716 aa  45.4  0.003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2040  Oligopeptidase A  28.12 
 
 		 726 aa  45.1  0.004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328478  hitchhiker  0.00152686 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.92 
 
 		 632 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.52 
 
 		 678 aa  45.1  0.004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  20.56 
 
 		 680 aa  44.7  0.005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  22.06 
 
 		 683 aa  44.7  0.005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.52 
 
 		 728 aa  44.3  0.006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.41 
 
 		 626 aa  44.3  0.006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.41 
 
 		 610 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  22.38 
 
 		 676 aa  44.3  0.006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  25.33 
 
 		 563 aa  44.3  0.007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  22.78 
 
 		 572 aa  44.3  0.007  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.2 
 
 		 671 aa  44.3  0.007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  22.26 
 
 		 681 aa  44.3  0.008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  30.09 
 
 		 695 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.7 
 
 		 720 aa  43.9  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1473  Peptidyl-dipeptidase Dcp  24.74 
 
 		 675 aa  43.9  0.009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383758  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  26.25 
 
 		 563 aa  43.9  0.009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.41 
 
 		 714 aa  43.9  0.009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  23 
 
 		 733 aa  43.9  0.009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.57 
 
 		 711 aa  43.9  0.009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4682  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  27.78 
 
 		 606 aa  43.9  0.009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  20.71 
 
 		 671 aa  43.5  0.01  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  19.9 
 
 		 680 aa  43.9  0.01  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_625  predicted protein  26.55 
 
 		 657 aa  43.9  0.01  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1167  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  26.06 
 
 		 593 aa  43.9  0.01  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4665  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  27.41 
 
 		 638 aa  43.5  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>