120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_1468 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  77 
 
 		 621 aa  963    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  78.96 
 
 		 622 aa  1012    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  55.07 
 
 		 615 aa  682    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  55.56 
 
 		 615 aa  688    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  54.34 
 
 		 615 aa  679    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 618 aa  1279    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  73.94 
 
 		 619 aa  936    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  77.65 
 
 		 622 aa  1023    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  38.93 
 
 		 624 aa  430  1e-119  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  24.07 
 
 		 528 aa  69.7  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.49 
 
 		 682 aa  62  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  25.28 
 
 		 689 aa  62  0.00000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  26.67 
 
 		 577 aa  58.2  0.0000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.21 
 
 		 681 aa  57.8  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  21.91 
 
 		 579 aa  55.8  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  23.15 
 
 		 780 aa  55.5  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.45 
 
 		 694 aa  54.7  0.000005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  22.99 
 
 		 694 aa  54.3  0.000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  22.07 
 
 		 694 aa  54.3  0.000006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.33 
 
 		 682 aa  53.9  0.000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  25 
 
 		 685 aa  53.5  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.18 
 
 		 727 aa  53.1  0.00001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.33 
 
 		 733 aa  53.5  0.00001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  22.99 
 
 		 683 aa  52.8  0.00002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  26.42 
 
 		 569 aa  52.8  0.00002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  31.07 
 
 		 697 aa  51.6  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  26.64 
 
 		 548 aa  51.6  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  24.11 
 
 		 696 aa  51.6  0.00004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.89 
 
 		 695 aa  51.6  0.00004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.97 
 
 		 689 aa  51.6  0.00005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  27.1 
 
 		 580 aa  50.8  0.00006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.61 
 
 		 696 aa  50.8  0.00007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  23.81 
 
 		 680 aa  50.4  0.00009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  27.11 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.59 
 
 		 695 aa  50.4  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.96 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  23.65 
 
 		 693 aa  50.4  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.96 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  50.1  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  49.7  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.96 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0141  oligopeptidase A  23.2 
 
 		 689 aa  48.9  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0166271  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1650  oligopeptidase A  23.2 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  27.09 
 
 		 563 aa  49.7  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  22.74 
 
 		 660 aa  49.3  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.96 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  22.01 
 
 		 749 aa  49.7  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.34 
 
 		 716 aa  48.9  0.0003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1232  oligopeptidase A  22.84 
 
 		 693 aa  48.9  0.0003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.966663  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.31 
 
 		 716 aa  48.9  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  27.14 
 
 		 679 aa  48.5  0.0003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.58 
 
 		 678 aa  48.5  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  21.8 
 
 		 676 aa  48.9  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  23.85 
 
 		 692 aa  48.5  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  26.88 
 
 		 680 aa  48.5  0.0004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  23.74 
 
 		 712 aa  48.1  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  25.19 
 
 		 680 aa  48.1  0.0005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.88 
 
 		 726 aa  46.6  0.001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.99 
 
 		 671 aa  47  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  27.06 
 
 		 566 aa  46.6  0.001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.77 
 
 		 715 aa  47  0.001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.15 
 
 		 730 aa  47  0.001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.9 
 
 		 672 aa  47  0.001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.95 
 
 		 734 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_625  predicted protein  22.8 
 
 		 657 aa  47  0.001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.87 
 
 		 714 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.95 
 
 		 734 aa  46.6  0.001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  22.95 
 
 		 682 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.95 
 
 		 734 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  22.95 
 
 		 680 aa  47  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  22.95 
 
 		 680 aa  47  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  20.84 
 
 		 717 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.95 
 
 		 734 aa  47  0.001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.77 
 
 		 715 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.77 
 
 		 715 aa  46.2  0.002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  20.35 
 
 		 658 aa  46.2  0.002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.33 
 
 		 714 aa  46.2  0.002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.04 
 
 		 687 aa  45.8  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  24.19 
 
 		 563 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.53 
 
 		 672 aa  45.4  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  26.24 
 
 		 548 aa  45.1  0.003  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  24.19 
 
 		 563 aa  45.8  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.3 
 
 		 674 aa  45.1  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0084  oligopeptidase A  22.71 
 
 		 731 aa  45.1  0.004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.611624  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  20.22 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  22.17 
 
 		 712 aa  45.1  0.004  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.48 
 
 		 683 aa  45.1  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  22.09 
 
 		 714 aa  45.1  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  24.65 
 
 		 563 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  24.65 
 
 		 563 aa  44.7  0.005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>