More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_2026 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  100 
 
 		 697 aa  1457    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  46.13 
 
 		 648 aa  566  1e-160  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  46.46 
 
 		 648 aa  560  1e-158  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  46.46 
 
 		 648 aa  558  1e-157  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  46.23 
 
 		 644 aa  553  1e-156  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  45.13 
 
 		 655 aa  553  1e-156  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4613  thimet oligopeptidase  44.26 
 
 		 641 aa  537  1e-151  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.910564  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  34.7 
 
 		 676 aa  304  4.0000000000000003e-81  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  31.66 
 
 		 681 aa  286  7e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1779  thimet oligopeptidase  32.56 
 
 		 677 aa  286  1.0000000000000001e-75  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  29.45 
 
 		 660 aa  280  6e-74  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  28.96 
 
 		 679 aa  261  4e-68  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  30.53 
 
 		 692 aa  257  5e-67  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28404  saccharolysin (oligopeptidase)  30.65 
 
 		 687 aa  254  4.0000000000000004e-66  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  28.41 
 
 		 675 aa  254  5.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  28.55 
 
 		 683 aa  253  9.000000000000001e-66  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  28.55 
 
 		 695 aa  253  1e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  28.39 
 
 		 695 aa  252  2e-65  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  28.93 
 
 		 714 aa  251  2e-65  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1923  oligopeptidase A  29.06 
 
 		 679 aa  252  2e-65  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0492523 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  28.71 
 
 		 676 aa  251  3e-65  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  28.9 
 
 		 676 aa  251  3e-65  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  29.18 
 
 		 679 aa  250  6e-65  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  28.9 
 
 		 680 aa  250  7e-65  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  28.93 
 
 		 680 aa  248  2e-64  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  28.93 
 
 		 679 aa  248  4e-64  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  28.62 
 
 		 681 aa  247  4e-64  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  27.02 
 
 		 709 aa  248  4e-64  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  29.28 
 
 		 677 aa  247  4.9999999999999997e-64  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  28.46 
 
 		 683 aa  246  9e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  28.77 
 
 		 702 aa  245  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  28.88 
 
 		 692 aa  245  3e-63  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  28.08 
 
 		 694 aa  245  3e-63  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_625  predicted protein  29.02 
 
 		 657 aa  244  3.9999999999999997e-63  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  28.25 
 
 		 683 aa  244  3.9999999999999997e-63  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  28.08 
 
 		 695 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  27.89 
 
 		 682 aa  244  3.9999999999999997e-63  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.66 
 
 		 734 aa  244  5e-63  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  28.05 
 
 		 695 aa  244  5e-63  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.66 
 
 		 734 aa  243  6e-63  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  27.46 
 
 		 734 aa  243  7e-63  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  26.66 
 
 		 734 aa  243  9e-63  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  29.43 
 
 		 690 aa  243  9e-63  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  28.03 
 
 		 681 aa  243  1e-62  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  28.41 
 
 		 685 aa  242  2e-62  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  28.01 
 
 		 680 aa  242  2e-62  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  28.83 
 
 		 674 aa  242  2e-62  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  28.39 
 
 		 680 aa  241  2e-62  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  28.35 
 
 		 694 aa  240  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  26.85 
 
 		 683 aa  240  6.999999999999999e-62  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  28 
 
 		 683 aa  239  8e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  27.92 
 
 		 680 aa  239  1e-61  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  27.92 
 
 		 680 aa  239  1e-61  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  27.92 
 
 		 680 aa  239  1e-61  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  27.92 
 
 		 680 aa  239  1e-61  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  29.07 
 
 		 680 aa  239  1e-61  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  28.3 
 
 		 749 aa  239  1e-61  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2158  Oligopeptidase A  29.58 
 
 		 685 aa  239  1e-61  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  27.92 
 
 		 680 aa  239  2e-61  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  26.91 
 
 		 679 aa  238  2e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  28.96 
 
 		 678 aa  238  2e-61  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  27.92 
 
 		 680 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2129  oligopeptidase A  29.23 
 
 		 677 aa  237  4e-61  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228019 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  28.22 
 
 		 680 aa  238  4e-61  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  27.92 
 
 		 680 aa  237  4e-61  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  27.77 
 
 		 680 aa  237  5.0000000000000005e-61  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1653  Oligopeptidase A  29.18 
 
 		 677 aa  237  5.0000000000000005e-61  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  27.15 
 
 		 679 aa  237  6e-61  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  29.48 
 
 		 675 aa  237  6e-61  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0141  oligopeptidase A  27.2 
 
 		 689 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0166271  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  28.85 
 
 		 683 aa  236  9e-61  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  29.61 
 
 		 702 aa  236  9e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  26.96 
 
 		 679 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  27.75 
 
 		 716 aa  236  1.0000000000000001e-60  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.79 
 
 		 726 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  27.45 
 
 		 679 aa  236  1.0000000000000001e-60  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  26.84 
 
 		 679 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  28.33 
 
 		 683 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  26.99 
 
 		 679 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.31 
 
 		 729 aa  234  3e-60  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1650  oligopeptidase A  27.06 
 
 		 689 aa  234  3e-60  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  30.52 
 
 		 701 aa  234  3e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  27.99 
 
 		 658 aa  234  4.0000000000000004e-60  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  28 
 
 		 681 aa  234  4.0000000000000004e-60  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  27.33 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  27.33 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  28.25 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  27.33 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  28.68 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  27.33 
 
 		 680 aa  234  5e-60  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  28.25 
 
 		 682 aa  234  5e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  27.66 
 
 		 680 aa  233  8.000000000000001e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2167  Oligopeptidase A  27.9 
 
 		 700 aa  233  9e-60  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  27.55 
 
 		 681 aa  233  1e-59  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  28.5 
 
 		 679 aa  233  1e-59  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  27.17 
 
 		 680 aa  232  1e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  27.76 
 
 		 680 aa  232  2e-59  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  26.86 
 
 		 679 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.57 
 
 		 725 aa  232  2e-59  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  28.17 
 
 		 695 aa  231  2e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>