More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeh_0397 on replicon NC_007760
Organism: Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  100 
 
 
648 aa  1291    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  97.38 
 
 
648 aa  1217    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  81.09 
 
 
644 aa  1013    Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  98.3 
 
 
648 aa  1272    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  53.47 
 
 
655 aa  659    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4613  thimet oligopeptidase  55.85 
 
 
641 aa  633  1e-180  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.910564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  46.46 
 
 
697 aa  572  1.0000000000000001e-162  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1779  thimet oligopeptidase  38.71 
 
 
677 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  33.72 
 
 
660 aa  342  9e-93  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  33.17 
 
 
676 aa  311  2e-83  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  31.13 
 
 
685 aa  307  4.0000000000000004e-82  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  30.8 
 
 
683 aa  304  4.0000000000000003e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0768  Thimet oligopeptidase  32.11 
 
 
701 aa  299  9e-80  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.484964  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  31.25 
 
 
848 aa  295  2e-78  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  31.59 
 
 
683 aa  294  3e-78  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  29.9 
 
 
676 aa  292  1e-77  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  30.46 
 
 
709 aa  292  1e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  31.94 
 
 
680 aa  292  2e-77  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  31.59 
 
 
683 aa  290  4e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  31.95 
 
 
680 aa  290  5.0000000000000004e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  30.62 
 
 
683 aa  290  8e-77  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  30.39 
 
 
681 aa  289  9e-77  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  31.49 
 
 
680 aa  288  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  31.49 
 
 
680 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  31.49 
 
 
680 aa  288  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  32.72 
 
 
680 aa  288  2e-76  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  31.49 
 
 
680 aa  288  2e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  31.49 
 
 
680 aa  288  2e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  31.49 
 
 
680 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  31.49 
 
 
680 aa  288  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  31.49 
 
 
680 aa  287  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  31.34 
 
 
680 aa  287  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  31.42 
 
 
695 aa  286  9e-76  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  31.63 
 
 
694 aa  286  1.0000000000000001e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  31.59 
 
 
695 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  34.19 
 
 
682 aa  285  2.0000000000000002e-75  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  31.55 
 
 
680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  31.59 
 
 
681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  31.42 
 
 
695 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  32.01 
 
 
680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  32.46 
 
 
679 aa  284  4.0000000000000003e-75  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  31.76 
 
 
692 aa  283  5.000000000000001e-75  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  31.59 
 
 
681 aa  283  6.000000000000001e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  31.33 
 
 
680 aa  283  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  31.33 
 
 
680 aa  283  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  31.33 
 
 
680 aa  283  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  31.33 
 
 
680 aa  283  9e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  31.33 
 
 
680 aa  282  2e-74  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  31.26 
 
 
683 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  32.75 
 
 
726 aa  280  6e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  29.24 
 
 
683 aa  280  7e-74  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  31.91 
 
 
729 aa  279  1e-73  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  30.98 
 
 
680 aa  278  2e-73  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  31.98 
 
 
682 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  31.98 
 
 
680 aa  278  2e-73  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  31.82 
 
 
679 aa  278  3e-73  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  32.42 
 
 
692 aa  278  3e-73  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  33.84 
 
 
685 aa  277  3e-73  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  31.6 
 
 
726 aa  276  7e-73  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  31.96 
 
 
675 aa  276  1.0000000000000001e-72  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  30.37 
 
 
682 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  29.75 
 
 
714 aa  275  2.0000000000000002e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0712  oligopeptidase A  27.88 
 
 
649 aa  275  2.0000000000000002e-72  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.83416  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  30.08 
 
 
727 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  30.82 
 
 
681 aa  275  2.0000000000000002e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  30.77 
 
 
725 aa  274  3e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  31.23 
 
 
742 aa  274  5.000000000000001e-72  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  29.93 
 
 
680 aa  273  6e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  31 
 
 
680 aa  273  7e-72  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  32.64 
 
 
679 aa  272  2e-71  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3984  oligopeptidase A  32.48 
 
 
682 aa  272  2e-71  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199844  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  31.1 
 
 
734 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  32.38 
 
 
716 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  32.26 
 
 
679 aa  270  4e-71  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.92 
 
 
734 aa  270  5e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  30.92 
 
 
742 aa  270  7e-71  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  30.92 
 
 
742 aa  270  7e-71  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  34.3 
 
 
676 aa  269  1e-70  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  29.85 
 
 
681 aa  268  2e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2167  Oligopeptidase A  30.38 
 
 
700 aa  268  2e-70  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.803751  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  29.75 
 
 
734 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  29.75 
 
 
734 aa  268  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  28.68 
 
 
680 aa  268  2.9999999999999995e-70  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  35.23 
 
 
690 aa  267  4e-70  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.82 
 
 
681 aa  267  4e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  29.69 
 
 
678 aa  267  4e-70  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1923  oligopeptidase A  32.06 
 
 
679 aa  267  5e-70  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0492523 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  33.89 
 
 
674 aa  267  5e-70  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.58 
 
 
696 aa  265  1e-69  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  32.13 
 
 
706 aa  264  3e-69  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  32.6 
 
 
720 aa  264  4e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  31.87 
 
 
692 aa  264  4e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2129  oligopeptidase A  32.27 
 
 
677 aa  263  8e-69  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.228019 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  30.91 
 
 
679 aa  263  8e-69  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  30.26 
 
 
679 aa  262  1e-68  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  34.37 
 
 
677 aa  262  1e-68  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  33.7 
 
 
696 aa  262  1e-68  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  29.25 
 
 
679 aa  262  1e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  30.58 
 
 
679 aa  261  2e-68  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  28.55 
 
 
679 aa  261  2e-68  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>