More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4613 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_4613  thimet oligopeptidase  100 
 
 		 641 aa  1275    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.910564  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  56.58 
 
 		 648 aa  624  1e-177  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  56.74 
 
 		 648 aa  604  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  56.58 
 
 		 648 aa  602  1e-170  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  54.82 
 
 		 644 aa  571  1e-161  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  48.47 
 
 		 655 aa  564  1.0000000000000001e-159  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  44.26 
 
 		 697 aa  540  9.999999999999999e-153  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  32.42 
 
 		 660 aa  301  2e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  33.05 
 
 		 676 aa  285  1.0000000000000001e-75  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  30.89 
 
 		 683 aa  285  2.0000000000000002e-75  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  32.96 
 
 		 694 aa  285  2.0000000000000002e-75  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  31.81 
 
 		 681 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  31.21 
 
 		 685 aa  284  3.0000000000000004e-75  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  30.18 
 
 		 676 aa  283  9e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1779  thimet oligopeptidase  35.09 
 
 		 677 aa  279  9e-74  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  31.37 
 
 		 681 aa  278  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  30.26 
 
 		 680 aa  270  4e-71  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  29.65 
 
 		 683 aa  270  5e-71  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  31.25 
 
 		 681 aa  268  2e-70  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  30.48 
 
 		 681 aa  265  2e-69  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  30.76 
 
 		 683 aa  265  2e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  30.73 
 
 		 683 aa  263  6.999999999999999e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  30.75 
 
 		 695 aa  261  3e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  30.75 
 
 		 683 aa  260  4e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  30.89 
 
 		 695 aa  260  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  30.75 
 
 		 695 aa  260  6e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  30.19 
 
 		 692 aa  259  9e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  29.19 
 
 		 679 aa  259  1e-67  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  30.28 
 
 		 675 aa  258  2e-67  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  28.74 
 
 		 679 aa  257  6e-67  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  29.42 
 
 		 682 aa  256  6e-67  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  28.93 
 
 		 679 aa  256  7e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  28.89 
 
 		 679 aa  256  9e-67  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  28.87 
 
 		 679 aa  255  1.0000000000000001e-66  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  28.74 
 
 		 681 aa  254  3e-66  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  29.17 
 
 		 678 aa  254  3e-66  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  28.74 
 
 		 679 aa  253  7e-66  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  28.99 
 
 		 680 aa  251  2e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  29.03 
 
 		 695 aa  251  3e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  32.26 
 
 		 690 aa  251  4e-65  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  28.02 
 
 		 679 aa  249  8e-65  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  27.31 
 
 		 683 aa  249  1e-64  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  28.42 
 
 		 679 aa  249  1e-64  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  29.2 
 
 		 678 aa  249  1e-64  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  29.17 
 
 		 679 aa  249  1e-64  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  28.7 
 
 		 679 aa  249  1e-64  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  29.04 
 
 		 679 aa  248  3e-64  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  247  4e-64  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  28.29 
 
 		 679 aa  247  4e-64  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  247  4e-64  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  247  4e-64  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  247  4e-64  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  246  6e-64  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  29.54 
 
 		 680 aa  246  6.999999999999999e-64  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0768  Thimet oligopeptidase  28.55 
 
 		 701 aa  246  8e-64  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.484964  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  246  8e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  29.19 
 
 		 679 aa  246  8e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  29.54 
 
 		 680 aa  246  9e-64  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0712  oligopeptidase A  27.43 
 
 		 649 aa  246  9.999999999999999e-64  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.83416  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  29.07 
 
 		 680 aa  246  9.999999999999999e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  31.42 
 
 		 682 aa  245  1.9999999999999999e-63  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  30.25 
 
 		 679 aa  245  1.9999999999999999e-63  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  28.37 
 
 		 709 aa  244  5e-63  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  27.22 
 
 		 679 aa  243  9e-63  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  31.02 
 
 		 692 aa  242  1e-62  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  30.39 
 
 		 679 aa  242  1e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  29.09 
 
 		 680 aa  241  4e-62  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  26.51 
 
 		 679 aa  239  1e-61  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  31.47 
 
 		 679 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  28.41 
 
 		 680 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  28.41 
 
 		 680 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  28.41 
 
 		 680 aa  238  2e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  28.41 
 
 		 680 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  28.41 
 
 		 680 aa  238  3e-61  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  29.04 
 
 		 682 aa  238  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  29.04 
 
 		 680 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  27.79 
 
 		 680 aa  235  2.0000000000000002e-60  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0730  oligopeptidase A  29.37 
 
 		 708 aa  234  3e-60  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  28.89 
 
 		 680 aa  234  4.0000000000000004e-60  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  30.05 
 
 		 700 aa  233  1e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  31.24 
 
 		 700 aa  233  1e-59  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_28404  saccharolysin (oligopeptidase)  28.24 
 
 		 687 aa  233  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  27.89 
 
 		 680 aa  232  2e-59  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  30.24 
 
 		 686 aa  232  2e-59  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  29.61 
 
 		 714 aa  231  3e-59  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  26.99 
 
 		 695 aa  231  3e-59  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  28.1 
 
 		 680 aa  231  4e-59  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3984  oligopeptidase A  30.45 
 
 		 682 aa  230  6e-59  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199844  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  32.68 
 
 		 676 aa  230  7e-59  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  30.64 
 
 		 704 aa  230  8e-59  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  29.06 
 
 		 680 aa  230  8e-59  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  31.01 
 
 		 706 aa  229  1e-58  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  30.02 
 
 		 848 aa  229  1e-58  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  27.89 
 
 		 680 aa  229  2e-58  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  30.18 
 
 		 685 aa  228  3e-58  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  28.96 
 
 		 658 aa  228  3e-58  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  32.72 
 
 		 674 aa  228  4e-58  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  27.7 
 
 		 679 aa  227  4e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  30.47 
 
 		 704 aa  226  1e-57  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>