More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Slin_1858 on replicon NC_013730
Organism: Spirosoma linguale DSM 74



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  49.57 
 
 		 714 aa  666    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.12 
 
 		 726 aa  647    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  58.96 
 
 		 675 aa  791    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  52.79 
 
 		 674 aa  687    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  50.74 
 
 		 671 aa  689    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.74 
 
 		 734 aa  656    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.78 
 
 		 734 aa  655    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.74 
 
 		 734 aa  656    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  100 
 
 		 709 aa  1466    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.91 
 
 		 726 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.99 
 
 		 734 aa  657    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.93 
 
 		 742 aa  663    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.48 
 
 		 725 aa  642    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.93 
 
 		 742 aa  662    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  48.82 
 
 		 848 aa  642    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.78 
 
 		 742 aa  663    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.13 
 
 		 730 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.74 
 
 		 729 aa  629  1e-179  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.24 
 
 		 726 aa  621  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.72 
 
 		 727 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  46 
 
 		 736 aa  589  1e-167  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1789  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.87 
 
 		 678 aa  560  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  43.94 
 
 		 722 aa  543  1e-153  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.45 
 
 		 683 aa  538  1e-151  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  42.88 
 
 		 693 aa  529  1e-149  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.46 
 
 		 696 aa  525  1e-148  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.71 
 
 		 687 aa  527  1e-148  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.1 
 
 		 723 aa  526  1e-148  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.31 
 
 		 733 aa  526  1e-148  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.19 
 
 		 696 aa  521  1e-146  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.38 
 
 		 723 aa  518  1.0000000000000001e-145  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.19 
 
 		 694 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  39.71 
 
 		 694 aa  517  1.0000000000000001e-145  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.94 
 
 		 716 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.59 
 
 		 718 aa  516  1.0000000000000001e-145  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.5 
 
 		 689 aa  515  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  514  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.89 
 
 		 718 aa  514  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.03 
 
 		 695 aa  509  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.12 
 
 		 682 aa  511  1e-143  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.23 
 
 		 716 aa  510  1e-143  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  41.3 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.12 
 
 		 716 aa  511  1e-143  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  41.45 
 
 		 680 aa  511  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.47 
 
 		 717 aa  510  1e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.12 
 
 		 689 aa  511  1e-143  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.76 
 
 		 696 aa  511  1e-143  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  41.3 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.03 
 
 		 681 aa  511  1e-143  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  41.3 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.37 
 
 		 716 aa  509  1e-143  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.5 
 
 		 716 aa  511  1e-143  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.91 
 
 		 716 aa  509  1e-143  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.5 
 
 		 716 aa  509  1e-143  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.46 
 
 		 695 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  41.16 
 
 		 680 aa  508  9.999999999999999e-143  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.68 
 
 		 716 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.86 
 
 		 674 aa  508  9.999999999999999e-143  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.47 
 
 		 696 aa  508  9.999999999999999e-143  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  41.01 
 
 		 680 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.28 
 
 		 722 aa  507  9.999999999999999e-143  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.8 
 
 		 689 aa  504  1e-141  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  41.68 
 
 		 682 aa  504  1e-141  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  41.35 
 
 		 680 aa  504  1e-141  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.54 
 
 		 699 aa  503  1e-141  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.49 
 
 		 712 aa  504  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.68 
 
 		 716 aa  504  1e-141  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  40.91 
 
 		 680 aa  500  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  41.5 
 
 		 692 aa  499  1e-140  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  39.62 
 
 		 675 aa  499  1e-140  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.56 
 
 		 671 aa  499  1e-140  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.28 
 
 		 712 aa  500  1e-140  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 680 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  40.18 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  40.14 
 
 		 680 aa  497  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  40.14 
 
 		 680 aa  498  1e-139  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  39.88 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 680 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.33 
 
 		 711 aa  495  1e-139  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  38.96 
 
 		 683 aa  494  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.12 
 
 		 682 aa  492  9.999999999999999e-139  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.4 
 
 		 699 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.11 
 
 		 691 aa  494  9.999999999999999e-139  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  39.31 
 
 		 682 aa  491  1e-137  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  40.9 
 
 		 676 aa  489  1e-137  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  40.03 
 
 		 680 aa  491  1e-137  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  40.5 
 
 		 679 aa  490  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.97 
 
 		 733 aa  489  1e-137  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.77 
 
 		 720 aa  491  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  39.74 
 
 		 679 aa  491  1e-137  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.26 
 
 		 699 aa  488  1e-136  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  39.15 
 
 		 682 aa  486  1e-136  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>