More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_28404 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009068  PICST_28404  saccharolysin (oligopeptidase)  100 
 
 		 687 aa  1422    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.0460468 
 
 
-
 
NC_009068  PICST_51091  saccharolysin (oligopeptidase)  50.52 
 
 		 658 aa  683    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  36.76 
 
 		 676 aa  356  8.999999999999999e-97  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  30.53 
 
 		 660 aa  318  2e-85  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  29.91 
 
 		 681 aa  317  7e-85  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  30.26 
 
 		 679 aa  303  8.000000000000001e-81  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  30.37 
 
 		 679 aa  300  8e-80  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  32.2 
 
 		 681 aa  300  8e-80  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  29.97 
 
 		 680 aa  299  9e-80  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  33.82 
 
 		 676 aa  300  9e-80  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  29.45 
 
 		 692 aa  298  2e-79  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  31.81 
 
 		 671 aa  297  4e-79  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  28.8 
 
 		 682 aa  293  7e-78  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2158  Oligopeptidase A  32.82 
 
 		 685 aa  290  5.0000000000000004e-77  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  29.67 
 
 		 683 aa  290  6e-77  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  31.3 
 
 		 709 aa  290  8e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  29.91 
 
 		 680 aa  288  2e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  29.85 
 
 		 680 aa  287  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  29.85 
 
 		 680 aa  287  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  29.85 
 
 		 680 aa  287  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  29.85 
 
 		 680 aa  287  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0768  Thimet oligopeptidase  30.3 
 
 		 701 aa  286  7e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.484964  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  29.57 
 
 		 683 aa  286  7e-76  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  29.85 
 
 		 680 aa  286  7e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  27.92 
 
 		 682 aa  286  8e-76  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  30.87 
 
 		 702 aa  286  9e-76  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  29.85 
 
 		 680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  29.85 
 
 		 680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  31.09 
 
 		 680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  31.52 
 
 		 716 aa  286  1.0000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  29.86 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  32.65 
 
 		 679 aa  286  1.0000000000000001e-75  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  30.14 
 
 		 676 aa  285  2.0000000000000002e-75  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  30.21 
 
 		 680 aa  285  2.0000000000000002e-75  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  30.77 
 
 		 678 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  30.46 
 
 		 680 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  30.46 
 
 		 680 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  30.46 
 
 		 680 aa  284  3.0000000000000004e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  30.46 
 
 		 680 aa  284  4.0000000000000003e-75  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  29.7 
 
 		 680 aa  284  5.000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  30.8 
 
 		 674 aa  283  6.000000000000001e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  29.91 
 
 		 680 aa  283  8.000000000000001e-75  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  27.47 
 
 		 683 aa  283  1e-74  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  27.47 
 
 		 695 aa  282  1e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  28.66 
 
 		 681 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  31.95 
 
 		 704 aa  282  2e-74  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3984  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 682 aa  281  2e-74  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199844  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  27.47 
 
 		 695 aa  281  2e-74  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  31.63 
 
 		 679 aa  281  2e-74  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  27.92 
 
 		 695 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  29.75 
 
 		 680 aa  281  3e-74  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 699 aa  281  3e-74  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  29.39 
 
 		 694 aa  281  3e-74  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  29.42 
 
 		 679 aa  281  4e-74  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  30.73 
 
 		 678 aa  280  9e-74  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 699 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 699 aa  279  1e-73  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 699 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 699 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 699 aa  279  1e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  28.08 
 
 		 680 aa  278  2e-73  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  28.92 
 
 		 681 aa  279  2e-73  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  29.33 
 
 		 695 aa  279  2e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  29.75 
 
 		 680 aa  279  2e-73  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 699 aa  278  2e-73  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  30.02 
 
 		 679 aa  275  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  32.37 
 
 		 695 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  30.85 
 
 		 704 aa  275  2.0000000000000002e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  30.85 
 
 		 700 aa  275  2.0000000000000002e-72  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  28.77 
 
 		 680 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  31.1 
 
 		 677 aa  274  3e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  28.53 
 
 		 682 aa  274  3e-72  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  32.37 
 
 		 695 aa  274  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1653  Oligopeptidase A  31.58 
 
 		 677 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  28.85 
 
 		 677 aa  274  4.0000000000000004e-72  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  30.37 
 
 		 681 aa  274  4.0000000000000004e-72  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2129  oligopeptidase A  31.58 
 
 		 677 aa  273  5.000000000000001e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228019 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  29.55 
 
 		 703 aa  273  5.000000000000001e-72  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 695 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  28.85 
 
 		 677 aa  274  5.000000000000001e-72  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 695 aa  273  5.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  31.76 
 
 		 695 aa  273  6e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  28.7 
 
 		 679 aa  273  6e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  28.61 
 
 		 679 aa  273  7e-72  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  28.76 
 
 		 714 aa  273  7e-72  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  31.05 
 
 		 692 aa  271  2e-71  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  32.43 
 
 		 695 aa  271  2.9999999999999997e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  28.22 
 
 		 679 aa  271  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  30.65 
 
 		 697 aa  271  2.9999999999999997e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  29.9 
 
 		 712 aa  271  4e-71  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  28.53 
 
 		 679 aa  271  4e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  29.18 
 
 		 680 aa  271  4e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  30.68 
 
 		 704 aa  270  5.9999999999999995e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  27.36 
 
 		 680 aa  270  5.9999999999999995e-71  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  30 
 
 		 685 aa  270  7e-71  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2614  oligopeptidase A  28.63 
 
 		 685 aa  269  1e-70  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  28.35 
 
 		 679 aa  269  1e-70  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  28.9 
 
 		 685 aa  269  1e-70  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  28.4 
 
 		 679 aa  269  1e-70  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  29.53 
 
 		 683 aa  269  1e-70  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>