More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rfer_2208 on replicon NC_007908
Organism: Rhodoferax ferrireducens T118



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2458  oligopeptidase A  81.36 
 
 		 679 aa  1122    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.105429  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2614  oligopeptidase A  78.1 
 
 		 685 aa  1098    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  49.27 
 
 		 683 aa  644    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  49.27 
 
 		 695 aa  640    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0730  oligopeptidase A  53.45 
 
 		 708 aa  695    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  50.44 
 
 		 682 aa  652    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  58.22 
 
 		 706 aa  768    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  47.59 
 
 		 695 aa  636    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  59.77 
 
 		 699 aa  806    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  49.41 
 
 		 683 aa  645    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  59.91 
 
 		 699 aa  807    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  50.73 
 
 		 686 aa  669    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  49.56 
 
 		 683 aa  644    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3646  oligopeptidase A  57.6 
 
 		 684 aa  734    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0702  Oligopeptidase A  52.51 
 
 		 712 aa  688    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.713847  normal  0.266777 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  58.06 
 
 		 692 aa  768    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  58.07 
 
 		 701 aa  759    Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  59.91 
 
 		 699 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  59.91 
 
 		 699 aa  807    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  58.37 
 
 		 695 aa  759    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0089  oligopeptidase A  54.17 
 
 		 674 aa  693    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0104  oligopeptidase A  53.88 
 
 		 674 aa  692    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  59.24 
 
 		 695 aa  783    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  52.5 
 
 		 703 aa  694    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  59.97 
 
 		 700 aa  812    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  47.88 
 
 		 680 aa  640    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  59.97 
 
 		 695 aa  788    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2208  oligopeptidase A  100 
 
 		 679 aa  1397    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.696851  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2129  oligopeptidase A  79.59 
 
 		 677 aa  1100    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.228019 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  56.14 
 
 		 679 aa  764    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2855  oligopeptidase A  76.82 
 
 		 687 aa  1077    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  58.26 
 
 		 716 aa  790    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  49.85 
 
 		 681 aa  637    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3493  Oligopeptidase A  56.68 
 
 		 676 aa  708    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.161675  normal  0.315797 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  51.47 
 
 		 682 aa  670    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  57.56 
 
 		 704 aa  763    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  67.69 
 
 		 677 aa  913    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  58.64 
 
 		 714 aa  749    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  57.5 
 
 		 700 aa  746    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  49.27 
 
 		 695 aa  645    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  57.7 
 
 		 704 aa  765    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3984  oligopeptidase A  79.26 
 
 		 682 aa  1112    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.199844  normal  0.049802 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  59.24 
 
 		 695 aa  784    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  59.1 
 
 		 695 aa  785    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  56.14 
 
 		 674 aa  732    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  59.51 
 
 		 704 aa  795    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  59.91 
 
 		 699 aa  807    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  58.03 
 
 		 702 aa  771    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  50.95 
 
 		 681 aa  651    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  49.93 
 
 		 679 aa  654    Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2158  Oligopeptidase A  78.79 
 
 		 685 aa  1077    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  49.27 
 
 		 695 aa  645    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  48.62 
 
 		 680 aa  642    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  59.1 
 
 		 695 aa  785    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  49.56 
 
 		 681 aa  645    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  49.18 
 
 		 676 aa  660    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  59.24 
 
 		 695 aa  784    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  59.91 
 
 		 699 aa  807    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  59.77 
 
 		 699 aa  805    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  48.54 
 
 		 680 aa  637    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1653  Oligopeptidase A  79.59 
 
 		 677 aa  1102    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1923  oligopeptidase A  76.44 
 
 		 679 aa  1055    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0492523 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  65.54 
 
 		 676 aa  877    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  47.96 
 
 		 680 aa  634  1e-180  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  49.05 
 
 		 679 aa  632  1e-180  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  48.68 
 
 		 692 aa  630  1e-179  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  48.03 
 
 		 679 aa  629  1e-179  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  48.91 
 
 		 679 aa  629  1e-179  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  49.05 
 
 		 679 aa  628  1e-178  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  48.76 
 
 		 679 aa  626  1e-178  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  46.66 
 
 		 679 aa  627  1e-178  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  48.76 
 
 		 679 aa  627  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  48.91 
 
 		 679 aa  628  1e-178  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  46.87 
 
 		 683 aa  624  1e-177  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  48.76 
 
 		 679 aa  624  1e-177  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  47.16 
 
 		 683 aa  622  1e-177  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  48.4 
 
 		 685 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  48.25 
 
 		 679 aa  623  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  48.91 
 
 		 679 aa  624  1e-177  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  48.76 
 
 		 679 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  48.76 
 
 		 679 aa  624  1e-177  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  48.25 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  48.25 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  47.38 
 
 		 680 aa  620  1e-176  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  48.25 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  47.38 
 
 		 680 aa  621  1e-176  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  48.25 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  47.51 
 
 		 679 aa  622  1e-176  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  48.25 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  47.3 
 
 		 680 aa  619  1e-176  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  48.61 
 
 		 678 aa  619  1e-176  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  48.1 
 
 		 680 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  47.22 
 
 		 682 aa  616  1e-175  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  47.38 
 
 		 680 aa  618  1e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  47.38 
 
 		 679 aa  618  1e-175  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  46.86 
 
 		 679 aa  617  1e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  47.67 
 
 		 680 aa  612  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  48.68 
 
 		 680 aa  612  9.999999999999999e-175  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  46.94 
 
 		 680 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  47.52 
 
 		 680 aa  610  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>