More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hoch_5061 on replicon NC_013440
Organism: Haliangium ochraceum DSM 14365



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007760  Adeh_0397  thimet oligopeptidase  54.89 
 
 
648 aa  635    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0425  Thimet oligopeptidase  54.72 
 
 
648 aa  649    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5061  Thimet oligopeptidase  100 
 
 
655 aa  1357    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0426  Thimet oligopeptidase  54.4 
 
 
648 aa  630  1e-179  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4180  thimet oligopeptidase  53.63 
 
 
644 aa  603  1.0000000000000001e-171  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4613  thimet oligopeptidase  48.47 
 
 
641 aa  561  1e-158  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.910564  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2026  tetraacyldisaccharide-1-P 4'-kinase  45.13 
 
 
697 aa  553  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0253758  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  31.96 
 
 
675 aa  324  3e-87  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  32.45 
 
 
676 aa  314  3.9999999999999997e-84  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  31.99 
 
 
692 aa  311  2.9999999999999997e-83  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  32.47 
 
 
683 aa  310  6.999999999999999e-83  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  32.46 
 
 
683 aa  309  1.0000000000000001e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  31.07 
 
 
679 aa  308  2.0000000000000002e-82  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  31.22 
 
 
685 aa  301  3e-80  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  30.79 
 
 
704 aa  300  4e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  30.15 
 
 
681 aa  300  7e-80  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  30.99 
 
 
660 aa  298  1e-79  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  31.79 
 
 
695 aa  299  1e-79  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  30.06 
 
 
680 aa  298  2e-79  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  30.87 
 
 
676 aa  298  2e-79  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1779  thimet oligopeptidase  34.37 
 
 
677 aa  298  3e-79  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.117155 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  29.91 
 
 
680 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  29.91 
 
 
682 aa  297  4e-79  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  32.42 
 
 
692 aa  296  7e-79  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  30.56 
 
 
706 aa  296  1e-78  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  32.31 
 
 
681 aa  295  2e-78  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  31.63 
 
 
695 aa  294  3e-78  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  31.18 
 
 
671 aa  293  5e-78  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  30.96 
 
 
704 aa  293  5e-78  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  30.9 
 
 
680 aa  294  5e-78  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2167  Oligopeptidase A  31.66 
 
 
700 aa  293  5e-78  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.803751  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  31.63 
 
 
683 aa  293  8e-78  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  30.89 
 
 
694 aa  292  1e-77  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  31.63 
 
 
695 aa  292  1e-77  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  30.97 
 
 
682 aa  291  2e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  30.5 
 
 
709 aa  291  2e-77  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  30.66 
 
 
679 aa  290  4e-77  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  30.23 
 
 
680 aa  290  4e-77  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  30.73 
 
 
679 aa  290  7e-77  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  29.47 
 
 
680 aa  290  7e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  30.68 
 
 
679 aa  288  2e-76  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  28.87 
 
 
681 aa  288  2.9999999999999996e-76  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  287  4e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  287  4e-76  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  287  4e-76  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  287  4e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  287  4e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  287  5e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  286  9e-76  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  30.51 
 
 
680 aa  286  9e-76  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  30.12 
 
 
680 aa  286  9e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  31.48 
 
 
678 aa  286  9e-76  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  27.19 
 
 
674 aa  286  1.0000000000000001e-75  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  30.39 
 
 
680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  30.24 
 
 
680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  30.51 
 
 
680 aa  286  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  30.38 
 
 
692 aa  285  2.0000000000000002e-75  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  28.27 
 
 
683 aa  284  3.0000000000000004e-75  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  31.6 
 
 
681 aa  284  4.0000000000000003e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  30.38 
 
 
679 aa  283  5.000000000000001e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  28.84 
 
 
677 aa  283  6.000000000000001e-75  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  31.02 
 
 
682 aa  283  7.000000000000001e-75  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  28.84 
 
 
677 aa  283  8.000000000000001e-75  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  31.6 
 
 
681 aa  282  1e-74  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  30.63 
 
 
679 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  30.48 
 
 
679 aa  282  2e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  30.63 
 
 
679 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  30.48 
 
 
679 aa  281  2e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  29.69 
 
 
680 aa  282  2e-74  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0768  Thimet oligopeptidase  30.06 
 
 
701 aa  281  2e-74  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.484964  normal  0.0509225 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  30.23 
 
 
679 aa  281  2e-74  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  28.28 
 
 
680 aa  282  2e-74  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  30.53 
 
 
679 aa  280  5e-74  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  27.9 
 
 
680 aa  280  7e-74  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  28.99 
 
 
695 aa  279  1e-73  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  29.33 
 
 
680 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  29.33 
 
 
680 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  29.33 
 
 
680 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  29.33 
 
 
680 aa  279  1e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  30.13 
 
 
679 aa  277  4e-73  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  29.19 
 
 
680 aa  277  5e-73  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  28.03 
 
 
683 aa  276  1.0000000000000001e-72  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  29.91 
 
 
686 aa  275  1.0000000000000001e-72  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  30.4 
 
 
679 aa  276  1.0000000000000001e-72  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  29.27 
 
 
679 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  28.51 
 
 
685 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  29.3 
 
 
679 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  29.53 
 
 
679 aa  274  3e-72  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  31.5 
 
 
674 aa  274  3e-72  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  32.34 
 
 
677 aa  273  6e-72  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  28.01 
 
 
683 aa  273  8.000000000000001e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  29.14 
 
 
683 aa  272  2e-71  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  30.97 
 
 
678 aa  270  5.9999999999999995e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  28.21 
 
 
679 aa  268  2e-70  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  28.72 
 
 
679 aa  268  2e-70  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  30.23 
 
 
695 aa  268  2e-70  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  28.88 
 
 
716 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  31.01 
 
 
682 aa  266  8.999999999999999e-70  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  29.83 
 
 
700 aa  265  2e-69  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  32.1 
 
 
676 aa  265  2e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>