More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3492 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  50.29 
 
 
675 aa  647    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  100 
 
 
692 aa  1406    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  50.43 
 
 
690 aa  646    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2167  Oligopeptidase A  50.21 
 
 
700 aa  712    Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.803751  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  43.31 
 
 
679 aa  525  1e-147  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  41.04 
 
 
686 aa  509  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  38.47 
 
 
680 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  40.46 
 
 
679 aa  508  9.999999999999999e-143  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  39.88 
 
 
676 aa  505  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  39.97 
 
 
682 aa  502  1e-141  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  41.34 
 
 
681 aa  504  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  40.17 
 
 
679 aa  499  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  40.32 
 
 
679 aa  500  1e-140  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  40.32 
 
 
679 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  39.45 
 
 
679 aa  501  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  39.6 
 
 
679 aa  499  1e-140  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  40.26 
 
 
678 aa  499  1e-140  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  39.86 
 
 
679 aa  497  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  40.46 
 
 
679 aa  498  1e-139  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  39.45 
 
 
679 aa  496  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  39.6 
 
 
679 aa  498  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  39.6 
 
 
679 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  40.2 
 
 
683 aa  489  1e-137  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  39.8 
 
 
679 aa  490  1e-137  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  39.36 
 
 
680 aa  489  1e-137  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  40.17 
 
 
692 aa  486  1e-136  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  40.26 
 
 
695 aa  487  1e-136  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  38.35 
 
 
679 aa  487  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  38.18 
 
 
679 aa  487  1e-136  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  39.83 
 
 
681 aa  487  1e-136  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  40.06 
 
 
681 aa  488  1e-136  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  38.64 
 
 
679 aa  486  1e-136  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  41.32 
 
 
685 aa  482  1e-135  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  40.9 
 
 
706 aa  485  1e-135  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  40.06 
 
 
683 aa  484  1e-135  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  39.91 
 
 
695 aa  484  1e-135  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  39.77 
 
 
695 aa  483  1e-135  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  38.38 
 
 
683 aa  484  1e-135  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  39.77 
 
 
683 aa  481  1e-134  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  39.37 
 
 
682 aa  482  1e-134  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  38.35 
 
 
679 aa  481  1e-134  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  38.73 
 
 
679 aa  480  1e-134  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  39.51 
 
 
679 aa  480  1e-134  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  38.78 
 
 
680 aa  481  1e-134  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  35.21 
 
 
683 aa  476  1e-133  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  38.21 
 
 
680 aa  477  1e-133  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  38.21 
 
 
680 aa  478  1e-133  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  38.64 
 
 
680 aa  478  1e-133  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  39.97 
 
 
704 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  39.38 
 
 
716 aa  478  1e-133  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  39.75 
 
 
704 aa  478  1e-133  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  38.64 
 
 
682 aa  478  1e-133  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  40.2 
 
 
695 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  37.72 
 
 
680 aa  473  1e-132  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  39.12 
 
 
704 aa  475  1e-132  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  38.18 
 
 
678 aa  473  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  39.31 
 
 
694 aa  473  1e-132  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  40.06 
 
 
695 aa  473  1e-132  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  37.82 
 
 
681 aa  473  1e-132  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  36.94 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  37.7 
 
 
695 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  39.49 
 
 
695 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  466  9.999999999999999e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  39.77 
 
 
695 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  39.77 
 
 
695 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  39.77 
 
 
695 aa  468  9.999999999999999e-131  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  38.31 
 
 
682 aa  463  1e-129  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  462  1e-129  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2040  Oligopeptidase A  37.73 
 
 
726 aa  465  1e-129  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328478  hitchhiker  0.00152686 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  38.81 
 
 
700 aa  463  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  37.2 
 
 
680 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  37.79 
 
 
680 aa  464  1e-129  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  37.95 
 
 
680 aa  463  1e-129  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  37.79 
 
 
680 aa  465  1e-129  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  37.2 
 
 
680 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  37.2 
 
 
680 aa  462  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  37.34 
 
 
680 aa  464  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  36.91 
 
 
680 aa  459  9.999999999999999e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  38.28 
 
 
702 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  38.32 
 
 
692 aa  459  9.999999999999999e-129  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  39.63 
 
 
695 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  38.64 
 
 
699 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  37 
 
 
683 aa  458  1e-127  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0141  oligopeptidase A  37.44 
 
 
685 aa  457  1e-127  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  38.66 
 
 
699 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  37.7 
 
 
683 aa  456  1e-127  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  37.24 
 
 
703 aa  458  1e-127  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  38.64 
 
 
699 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  37.28 
 
 
680 aa  456  1e-127  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  38.64 
 
 
699 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  38.64 
 
 
699 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  38.64 
 
 
699 aa  457  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  38.64 
 
 
699 aa  457  1e-127  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0159  oligopeptidase A  35.19 
 
 
677 aa  452  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2166  oligopeptidase A  35.34 
 
 
677 aa  454  1.0000000000000001e-126  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>