More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dgeo_0948 on replicon NC_008025
Organism: Deinococcus geothermalis DSM 11300



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  58.26 
 
 		 675 aa  775    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3492  oligopeptidase A  50.43 
 
 		 692 aa  663    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.865718  normal  0.378526 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0948  oligopeptidase A  100 
 
 		 690 aa  1395    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.613607  normal  0.240038 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2167  Oligopeptidase A  45.65 
 
 		 700 aa  589  1e-167  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.803751  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  43.55 
 
 		 679 aa  510  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  41.45 
 
 		 682 aa  498  1e-139  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  42.03 
 
 		 681 aa  489  1e-137  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  42.11 
 
 		 679 aa  485  1e-135  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  41.98 
 
 		 694 aa  485  1e-135  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  40.47 
 
 		 679 aa  474  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  42.07 
 
 		 682 aa  473  1e-132  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  40.62 
 
 		 680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  40.53 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  40.53 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  41.05 
 
 		 681 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  40.53 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  40.53 
 
 		 680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  38.95 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  40.9 
 
 		 681 aa  470  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  40.53 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  40.62 
 
 		 680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  40.03 
 
 		 679 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  40.53 
 
 		 680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  40.47 
 
 		 680 aa  468  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  38.37 
 
 		 709 aa  468  9.999999999999999e-131  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  40.32 
 
 		 686 aa  467  9.999999999999999e-131  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  40.53 
 
 		 680 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  40.32 
 
 		 680 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  39.39 
 
 		 695 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  40.32 
 
 		 680 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  40.32 
 
 		 680 aa  466  9.999999999999999e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  40.32 
 
 		 680 aa  467  9.999999999999999e-131  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  39.39 
 
 		 695 aa  468  9.999999999999999e-131  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  39.21 
 
 		 679 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  39.88 
 
 		 679 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  40.32 
 
 		 680 aa  466  9.999999999999999e-131  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  39.88 
 
 		 679 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  41.37 
 
 		 685 aa  466  9.999999999999999e-131  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  39.88 
 
 		 679 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  39.39 
 
 		 695 aa  465  1e-129  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  40.18 
 
 		 680 aa  465  1e-129  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  40.41 
 
 		 680 aa  463  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  39.74 
 
 		 679 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  39.88 
 
 		 679 aa  464  1e-129  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  39.13 
 
 		 683 aa  463  1e-129  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  38.25 
 
 		 695 aa  465  1e-129  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  37.83 
 
 		 679 aa  465  1e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  40.03 
 
 		 679 aa  465  1e-129  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  39.19 
 
 		 683 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  38.01 
 
 		 681 aa  461  9.999999999999999e-129  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  39.19 
 
 		 692 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  39.59 
 
 		 679 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  40.41 
 
 		 680 aa  462  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  38.78 
 
 		 676 aa  459  9.999999999999999e-129  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  39.59 
 
 		 679 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  40.26 
 
 		 682 aa  459  9.999999999999999e-129  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  37.79 
 
 		 680 aa  460  9.999999999999999e-129  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  38.62 
 
 		 679 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  38.46 
 
 		 683 aa  456  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1642  oligopeptidase A  41.69 
 
 		 676 aa  456  1e-127  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.257802 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  40.2 
 
 		 680 aa  459  1e-127  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  38.17 
 
 		 679 aa  456  1e-127  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  38.62 
 
 		 679 aa  457  1e-127  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  38.82 
 
 		 678 aa  457  1e-127  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  39.5 
 
 		 682 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  39.86 
 
 		 700 aa  454  1.0000000000000001e-126  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  38.33 
 
 		 679 aa  455  1.0000000000000001e-126  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  38.32 
 
 		 683 aa  449  1e-125  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  38.99 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  38.54 
 
 		 678 aa  451  1e-125  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  38.85 
 
 		 700 aa  449  1e-125  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  38.4 
 
 		 716 aa  449  1e-125  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  38.99 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  38.99 
 
 		 695 aa  449  1e-125  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  39.14 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  39.63 
 
 		 701 aa  449  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  38.94 
 
 		 704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  38.82 
 
 		 699 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  37.44 
 
 		 679 aa  447  1.0000000000000001e-124  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  37.04 
 
 		 680 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  39.45 
 
 		 695 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  38.82 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  38.82 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  38.82 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  38.93 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  39.8 
 
 		 695 aa  445  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  39.77 
 
 		 704 aa  443  1e-123  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03135  oligopeptidase A  40.29 
 
 		 674 aa  444  1e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  41.12 
 
 		 677 aa  442  1e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  38.82 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  38.82 
 
 		 699 aa  444  1e-123  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  38.27 
 
 		 683 aa  445  1e-123  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  35.09 
 
 		 683 aa  439  9.999999999999999e-123  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  39.04 
 
 		 680 aa  442  9.999999999999999e-123  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  39.91 
 
 		 704 aa  442  9.999999999999999e-123  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  39.74 
 
 		 706 aa  438  1e-121  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  38.34 
 
 		 675 aa  436  1e-121  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  38.56 
 
 		 680 aa  438  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  38.7 
 
 		 695 aa  439  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  38.65 
 
 		 680 aa  439  1e-121  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>