More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Fjoh_0429 on replicon NC_009441
Organism: Flavobacterium johnsoniae UW101



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.43 
 
 		 729 aa  658    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  48.96 
 
 		 714 aa  651    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.28 
 
 		 725 aa  649    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  65 
 
 		 674 aa  859    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  58.96 
 
 		 709 aa  820    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.73 
 
 		 726 aa  663    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.98 
 
 		 734 aa  642    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.98 
 
 		 734 aa  642    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.27 
 
 		 726 aa  652    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.64 
 
 		 726 aa  657    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  100 
 
 		 675 aa  1391    Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.33 
 
 		 742 aa  655    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1271  Oligopeptidase A  57.25 
 
 		 671 aa  790    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.18 
 
 		 742 aa  653    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.73 
 
 		 727 aa  654    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.83 
 
 		 734 aa  640    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.18 
 
 		 742 aa  654    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.68 
 
 		 734 aa  639    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.43 
 
 		 730 aa  638    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.25 
 
 		 848 aa  612  9.999999999999999e-175  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.66 
 
 		 736 aa  575  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1789  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.51 
 
 		 678 aa  561  1e-158  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  41.59 
 
 		 680 aa  535  1e-150  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  40.65 
 
 		 694 aa  530  1e-149  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  41.59 
 
 		 680 aa  527  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  41.45 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  41.3 
 
 		 680 aa  524  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  41.45 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  41.45 
 
 		 680 aa  525  1e-147  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  41.3 
 
 		 680 aa  519  1e-146  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  40.9 
 
 		 680 aa  520  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  41.39 
 
 		 682 aa  516  1.0000000000000001e-145  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.27 
 
 		 687 aa  518  1.0000000000000001e-145  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.63 
 
 		 696 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.87 
 
 		 689 aa  518  1.0000000000000001e-145  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.74 
 
 		 696 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  41.65 
 
 		 722 aa  516  1.0000000000000001e-145  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  40.27 
 
 		 680 aa  514  1e-144  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  40.87 
 
 		 695 aa  513  1e-144  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.59 
 
 		 694 aa  513  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  41.15 
 
 		 680 aa  515  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  512  1e-144  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.79 
 
 		 689 aa  514  1e-144  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  513  1e-144  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  41 
 
 		 680 aa  511  1e-143  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.12 
 
 		 695 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  40.12 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.28 
 
 		 695 aa  510  1e-143  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  41.81 
 
 		 676 aa  509  1e-143  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.68 
 
 		 683 aa  511  1e-143  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  40.86 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  511  1e-143  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  41.17 
 
 		 681 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  40.72 
 
 		 680 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  40.12 
 
 		 680 aa  507  9.999999999999999e-143  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.99 
 
 		 712 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  40.09 
 
 		 680 aa  507  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  40 
 
 		 717 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.56 
 
 		 716 aa  503  1e-141  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  40.44 
 
 		 693 aa  504  1e-141  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  39.7 
 
 		 680 aa  503  1e-141  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  41.02 
 
 		 680 aa  504  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  40 
 
 		 679 aa  499  1e-140  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.66 
 
 		 711 aa  500  1e-140  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.48 
 
 		 723 aa  499  1e-140  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.26 
 
 		 716 aa  502  1e-140  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  40 
 
 		 696 aa  501  1e-140  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.26 
 
 		 716 aa  501  1e-140  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  41.1 
 
 		 683 aa  501  1e-140  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.43 
 
 		 716 aa  498  1e-139  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.11 
 
 		 716 aa  498  1e-139  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.85 
 
 		 696 aa  497  1e-139  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.43 
 
 		 716 aa  495  1e-139  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.58 
 
 		 716 aa  497  1e-139  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  39.46 
 
 		 679 aa  496  1e-139  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.18 
 
 		 723 aa  498  1e-139  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.58 
 
 		 716 aa  495  1e-139  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  42.3 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2211  Oligopeptidase A  40 
 
 		 675 aa  495  9.999999999999999e-139  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  39.1 
 
 		 682 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  39.2 
 
 		 683 aa  495  9.999999999999999e-139  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  40.6 
 
 		 679 aa  493  9.999999999999999e-139  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  39.34 
 
 		 686 aa  494  9.999999999999999e-139  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  39.25 
 
 		 679 aa  495  9.999999999999999e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  40 
 
 		 679 aa  490  1e-137  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.67 
 
 		 682 aa  490  1e-137  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  38.8 
 
 		 679 aa  491  1e-137  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.27 
 
 		 722 aa  489  1e-137  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  39.31 
 
 		 683 aa  486  1e-136  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.12 
 
 		 714 aa  485  1e-136  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.69 
 
 		 711 aa  488  1e-136  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.24 
 
 		 718 aa  486  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.96 
 
 		 718 aa  487  1e-136  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  38.81 
 
 		 714 aa  487  1e-136  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  39.61 
 
 		 679 aa  484  1e-135  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.72 
 
 		 716 aa  485  1e-135  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>