More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1586 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  60.52 
 
 		 725 aa  885    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  58.79 
 
 		 734 aa  882    Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  58.79 
 
 		 734 aa  882    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  62.7 
 
 		 729 aa  894    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.54 
 
 		 726 aa  873    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  61.07 
 
 		 726 aa  907    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.61 
 
 		 714 aa  733    Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 		 736 aa  1526    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  58.9 
 
 		 742 aa  885    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  58.76 
 
 		 742 aa  877    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  56.2 
 
 		 727 aa  883    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  59.17 
 
 		 734 aa  886    Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  50.44 
 
 		 848 aa  691    Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  59.04 
 
 		 742 aa  886    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  58.93 
 
 		 734 aa  882    Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  58.47 
 
 		 730 aa  863    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  59.45 
 
 		 726 aa  911    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.05 
 
 		 723 aa  624  1e-177  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  46 
 
 		 709 aa  619  1e-176  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.37 
 
 		 723 aa  614  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.57 
 
 		 712 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.87 
 
 		 683 aa  607  9.999999999999999e-173  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.02 
 
 		 718 aa  605  9.999999999999999e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  46.31 
 
 		 722 aa  603  1.0000000000000001e-171  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.82 
 
 		 718 aa  603  1.0000000000000001e-171  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.02 
 
 		 717 aa  600  1e-170  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.88 
 
 		 712 aa  599  1e-170  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.92 
 
 		 716 aa  596  1e-169  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.53 
 
 		 716 aa  592  1e-168  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.02 
 
 		 714 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.45 
 
 		 720 aa  593  1e-168  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.29 
 
 		 689 aa  593  1e-168  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.23 
 
 		 689 aa  592  1e-168  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.14 
 
 		 711 aa  587  1e-166  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.27 
 
 		 733 aa  586  1e-166  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.51 
 
 		 716 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.51 
 
 		 716 aa  586  1e-166  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.44 
 
 		 716 aa  584  1.0000000000000001e-165  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.85 
 
 		 716 aa  585  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.7 
 
 		 716 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.36 
 
 		 716 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.13 
 
 		 718 aa  584  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.85 
 
 		 716 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0429  oligopeptidase A  45.66 
 
 		 675 aa  579  1e-164  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.735767  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.48 
 
 		 689 aa  581  1e-164  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.11 
 
 		 722 aa  582  1e-164  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.76 
 
 		 717 aa  580  1e-164  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.56 
 
 		 716 aa  578  1.0000000000000001e-163  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.76 
 
 		 717 aa  578  1.0000000000000001e-163  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  43.82 
 
 		 685 aa  578  1.0000000000000001e-163  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.52 
 
 		 716 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.88 
 
 		 687 aa  569  1e-161  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.29 
 
 		 711 aa  570  1e-161  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.4 
 
 		 695 aa  568  1e-160  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.5 
 
 		 680 aa  568  1e-160  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.69 
 
 		 699 aa  566  1e-160  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.82 
 
 		 699 aa  563  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.12 
 
 		 682 aa  565  1.0000000000000001e-159  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.77 
 
 		 699 aa  559  1e-158  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  41 
 
 		 682 aa  560  1e-158  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  40.92 
 
 		 694 aa  560  1e-158  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.86 
 
 		 733 aa  559  1e-158  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.49 
 
 		 696 aa  561  1e-158  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.68 
 
 		 718 aa  561  1e-158  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.51 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.51 
 
 		 714 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.43 
 
 		 694 aa  558  1e-157  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.51 
 
 		 714 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.51 
 
 		 683 aa  556  1e-157  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.36 
 
 		 714 aa  556  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.13 
 
 		 714 aa  554  1e-156  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1608  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.42 
 
 		 687 aa  550  1e-155  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000301747  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.82 
 
 		 681 aa  551  1e-155  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.06 
 
 		 696 aa  552  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.68 
 
 		 681 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01497  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.82 
 
 		 681 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000554972  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2107  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.82 
 
 		 681 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100258  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.75 
 
 		 691 aa  546  1e-154  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1747  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.53 
 
 		 681 aa  545  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000176461  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2154  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.82 
 
 		 681 aa  548  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  40.82 
 
 		 681 aa  548  1e-154  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.43 
 
 		 726 aa  546  1e-154  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.53 
 
 		 681 aa  546  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40 
 
 		 695 aa  546  1e-154  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.13 
 
 		 677 aa  542  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.76 
 
 		 697 aa  542  1e-153  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.95 
 
 		 715 aa  545  1e-153  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.81 
 
 		 715 aa  545  1e-153  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.81 
 
 		 715 aa  545  1e-153  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1627  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.23 
 
 		 681 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000101595  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.15 
 
 		 695 aa  540  9.999999999999999e-153  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_05555  peptidyl-dipeptidase  42.42 
 
 		 674 aa  539  9.999999999999999e-153  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.54 
 
 		 696 aa  542  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  43 
 
 		 693 aa  540  9.999999999999999e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.46 
 
 		 659 aa  540  9.999999999999999e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  44.19 
 
 		 692 aa  538  1e-151  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.06 
 
 		 681 aa  536  1e-151  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1683  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.27 
 
 		 680 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.897722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1624  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.62 
 
 		 680 aa  533  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1615  dipeptidyl carboxypeptidase II  40.41 
 
 		 680 aa  532  1e-150  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.418466  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>