More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_0446 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  59.56 
 
 
689 aa  799    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  60.55 
 
 
689 aa  794    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  56.34 
 
 
687 aa  735    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  54.69 
 
 
682 aa  717    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0483  Peptidyl-dipeptidase Dcp  93.56 
 
 
699 aa  1284    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  75.15 
 
 
685 aa  1004    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  54.05 
 
 
693 aa  703    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0446  Peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 
699 aa  1392    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.428364  normal  0.240346 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  54.76 
 
 
692 aa  669    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  49.85 
 
 
717 aa  635    Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  55.14 
 
 
696 aa  706    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.1 
 
 
672 aa  654    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  53.77 
 
 
695 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0332  M3 family peptidase  51.12 
 
 
674 aa  664    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.71 
 
 
716 aa  640    Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.97 
 
 
694 aa  712    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0912  peptidyl-dipeptidase Dcp  56.57 
 
 
674 aa  683    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.22 
 
 
696 aa  699    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.22 
 
 
696 aa  708    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  53.77 
 
 
695 aa  688    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.46 
 
 
696 aa  702    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0514  peptidyl-dipeptidase Dcp  54.95 
 
 
672 aa  663    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408972  normal  0.0574959 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.39 
 
 
672 aa  657    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.79 
 
 
671 aa  678    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  54.4 
 
 
681 aa  687    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2973  peptidyl-dipeptidase  54.34 
 
 
673 aa  643    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  80.56 
 
 
689 aa  1078    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  54.55 
 
 
733 aa  715    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  55.15 
 
 
694 aa  740    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.8 
 
 
682 aa  717    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  75.33 
 
 
683 aa  947    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0413  peptidyl-dipeptidase Dcp  98.71 
 
 
699 aa  1373    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.689859 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  49.85 
 
 
717 aa  633  1e-180  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1048  peptidyl-dipeptidase Dcp  50 
 
 
687 aa  620  1e-176  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.23 
 
 
726 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.18 
 
 
678 aa  608  9.999999999999999e-173  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.23 
 
 
729 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.03 
 
 
725 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.99 
 
 
726 aa  600  1e-170  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1608  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.47 
 
 
687 aa  602  1e-170  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.000301747  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.29 
 
 
734 aa  595  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.93 
 
 
726 aa  597  1e-169  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.08 
 
 
742 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.93 
 
 
742 aa  598  1e-169  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.18 
 
 
727 aa  598  1e-169  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.93 
 
 
742 aa  596  1e-169  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.15 
 
 
734 aa  594  1e-168  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.29 
 
 
734 aa  595  1e-168  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.15 
 
 
734 aa  593  1e-168  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.26 
 
 
730 aa  587  1e-166  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  46.6 
 
 
780 aa  568  1e-160  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.86 
 
 
714 aa  568  1e-160  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.84 
 
 
848 aa  557  1e-157  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.49 
 
 
736 aa  549  1e-155  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.34 
 
 
718 aa  541  9.999999999999999e-153  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0143  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.44 
 
 
734 aa  529  1e-149  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.62915  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.92 
 
 
728 aa  523  1e-147  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.75 
 
 
717 aa  520  1e-146  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.49 
 
 
683 aa  520  1e-146  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.69 
 
 
716 aa  521  1e-146  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4267  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.98 
 
 
746 aa  517  1.0000000000000001e-145  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.726891  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.6 
 
 
716 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.9 
 
 
716 aa  515  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.15 
 
 
733 aa  515  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.17 
 
 
716 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.75 
 
 
716 aa  517  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  41.64 
 
 
722 aa  514  1e-144  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.6 
 
 
729 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.45 
 
 
716 aa  513  1e-144  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.6 
 
 
716 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.17 
 
 
716 aa  513  1e-144  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.57 
 
 
712 aa  509  1e-143  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  40.4 
 
 
709 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.33 
 
 
712 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.45 
 
 
723 aa  504  1e-141  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.6 
 
 
718 aa  503  1e-141  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.35 
 
 
714 aa  503  1e-141  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.09 
 
 
711 aa  502  1e-141  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.34 
 
 
722 aa  500  1e-140  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.05 
 
 
718 aa  502  1e-140  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.82 
 
 
723 aa  500  1e-140  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.16 
 
 
695 aa  495  9.999999999999999e-139  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.67 
 
 
720 aa  489  1e-137  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.51 
 
 
677 aa  490  1e-137  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.73 
 
 
716 aa  487  1e-136  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.65 
 
 
718 aa  487  1e-136  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.82 
 
 
714 aa  482  1e-134  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.82 
 
 
714 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.67 
 
 
714 aa  480  1e-134  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.61 
 
 
714 aa  481  1e-134  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.82 
 
 
714 aa  481  1e-134  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.12 
 
 
726 aa  480  1e-134  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2039  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.81 
 
 
670 aa  472  1e-132  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153602 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1054  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.81 
 
 
655 aa  474  1e-132  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.391003  normal  0.428625 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.37 
 
 
716 aa  473  1e-132  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  38.81 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1624  dipeptidyl carboxypeptidase II  41.64 
 
 
680 aa  469  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1659  dipeptidyl carboxypeptidase II  41.64 
 
 
680 aa  471  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1615  dipeptidyl carboxypeptidase II  41.64 
 
 
680 aa  470  1.0000000000000001e-131  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.418466  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.46 
 
 
715 aa  469  9.999999999999999e-131  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.6132 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>