More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sros_8022 on replicon NC_013595
Organism: Streptosporangium roseum DSM 43021



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013757  Gobs_0938  Peptidyl-dipeptidase Dcp  55.07 
 
 
687 aa  651    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964054  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1054  Peptidyl-dipeptidase Dcp  68.84 
 
 
655 aa  932    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.391003  normal  0.428625 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  57.46 
 
 
677 aa  732    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  55.85 
 
 
691 aa  706    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2254  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.95 
 
 
708 aa  649    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 
659 aa  1340    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.5 
 
 
718 aa  754    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2039  Peptidyl-dipeptidase Dcp  53.36 
 
 
670 aa  684    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153602 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  54.56 
 
 
697 aa  661    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21040  peptidyl-dipeptidase Dcp  54.4 
 
 
699 aa  666    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.547895  normal  0.690567 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  52.99 
 
 
712 aa  719    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.35 
 
 
683 aa  728    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5074  Peptidyl-dipeptidase Dcp  52.98 
 
 
679 aa  636    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.23 
 
 
716 aa  701    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2313  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.16 
 
 
670 aa  688    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0197787  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1191  Peptidyl-dipeptidase Dcp  48.41 
 
 
705 aa  630  1e-179  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.130613  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  48.23 
 
 
722 aa  631  1e-179  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1473  Peptidyl-dipeptidase Dcp  52.44 
 
 
675 aa  625  1e-178  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383758  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.85 
 
 
712 aa  626  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.22 
 
 
718 aa  628  1e-178  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3616  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.03 
 
 
682 aa  624  1e-177  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.751531  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.88 
 
 
720 aa  619  1e-176  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.56 
 
 
723 aa  621  1e-176  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.56 
 
 
723 aa  620  1e-176  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.72 
 
 
716 aa  617  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.66 
 
 
716 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.58 
 
 
717 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.51 
 
 
716 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.36 
 
 
716 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.23 
 
 
716 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.13 
 
 
722 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  47.64 
 
 
718 aa  611  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.37 
 
 
711 aa  610  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.43 
 
 
716 aa  611  1e-173  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.93 
 
 
716 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.85 
 
 
716 aa  607  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.36 
 
 
716 aa  599  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.51 
 
 
714 aa  601  1e-170  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.95 
 
 
715 aa  598  1e-170  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.14 
 
 
714 aa  600  1e-170  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.98 
 
 
714 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.13 
 
 
714 aa  598  1e-169  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.81 
 
 
715 aa  596  1e-169  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.99 
 
 
714 aa  597  1e-169  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.48 
 
 
711 aa  592  1e-168  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.4 
 
 
714 aa  592  1e-168  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.78 
 
 
726 aa  593  1e-168  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.51 
 
 
733 aa  592  1e-168  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  46.81 
 
 
715 aa  594  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.92 
 
 
718 aa  588  1e-167  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.44 
 
 
725 aa  569  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.07 
 
 
680 aa  569  1e-161  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.51 
 
 
742 aa  566  1e-160  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.51 
 
 
742 aa  568  1e-160  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.36 
 
 
734 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.07 
 
 
726 aa  562  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.49 
 
 
742 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2784  Peptidyl-dipeptidase Dcp  49.71 
 
 
676 aa  561  1e-158  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.07 
 
 
734 aa  560  1e-158  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3176  Peptidyl-dipeptidase Dcp  48.25 
 
 
690 aa  555  1e-157  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.78 
 
 
734 aa  557  1e-157  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.07 
 
 
726 aa  556  1e-157  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.9 
 
 
727 aa  558  1e-157  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.92 
 
 
734 aa  558  1e-157  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.84 
 
 
695 aa  554  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1940  dipeptidyl carboxypeptidase II  46.15 
 
 
679 aa  555  1e-156  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244675  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01497  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.1 
 
 
681 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000554972  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  44.1 
 
 
681 aa  548  1e-155  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.05 
 
 
729 aa  550  1e-155  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.1 
 
 
681 aa  549  1e-155  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.51 
 
 
730 aa  551  1e-155  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.1 
 
 
681 aa  547  1e-154  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2107  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.1 
 
 
681 aa  548  1e-154  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100258  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1627  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.1 
 
 
681 aa  547  1e-154  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000101595  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.75 
 
 
726 aa  546  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1747  dipeptidyl carboxypeptidase II  44.1 
 
 
681 aa  548  1e-154  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000176461  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.95 
 
 
681 aa  545  1e-154  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2154  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.95 
 
 
681 aa  546  1e-154  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000542867  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.38 
 
 
736 aa  530  1e-149  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1624  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.17 
 
 
680 aa  526  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1659  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.02 
 
 
680 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037506  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1615  dipeptidyl carboxypeptidase II  43.02 
 
 
680 aa  525  1e-148  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.418466  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1683  dipeptidyl carboxypeptidase II  42.73 
 
 
680 aa  520  1e-146  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.897722  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.92 
 
 
714 aa  511  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12920  Zn-dependent oligopeptidase  44.82 
 
 
697 aa  501  1e-140  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.69603  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.81 
 
 
689 aa  499  1e-140  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.17 
 
 
848 aa  491  1e-137  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.04 
 
 
689 aa  485  1e-135  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.44 
 
 
689 aa  481  1e-134  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.29 
 
 
694 aa  481  1e-134  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  40.53 
 
 
693 aa  476  1e-133  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  42.39 
 
 
685 aa  476  1e-133  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.14 
 
 
696 aa  474  1e-132  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.12 
 
 
696 aa  473  1e-132  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.9 
 
 
683 aa  469  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.41 
 
 
717 aa  463  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.12 
 
 
716 aa  462  1e-129  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.18 
 
 
696 aa  462  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.18 
 
 
696 aa  462  1e-129  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.29 
 
 
687 aa  463  1e-129  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>