More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SO_3142 on replicon NC_004347
Organism: Shewanella oneidensis MR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
CP001509  ECD_01497  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.58 
 
 		 681 aa  652    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000554972  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1636  peptidyl-dipeptidase Dcp  47.02 
 
 		 718 aa  667    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.919214  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2107  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.58 
 
 		 681 aa  652    Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000100258  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  93.01 
 
 		 716 aa  1397    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  93.41 
 
 		 717 aa  1400    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1747  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.58 
 
 		 681 aa  653    Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000176461  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  100 
 
 		 716 aa  1490    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.06 
 
 		 716 aa  807    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1683  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.49 
 
 		 680 aa  647    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.897722  normal  1 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1028  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.32 
 
 		 723 aa  750    Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.317856  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0817  Peptidyl-dipeptidase Dcp  48.15 
 
 		 726 aa  657    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.480968  normal  0.163451 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  52.87 
 
 		 720 aa  788    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1262  peptidyl-dipeptidase Dcp  49.22 
 
 		 716 aa  709    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.776976  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1940  dipeptidyl carboxypeptidase II  46.89 
 
 		 679 aa  640    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.244675  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1659  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.66 
 
 		 680 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.037506  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  56.82 
 
 		 714 aa  789    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19990  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.78 
 
 		 683 aa  697    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.813325  hitchhiker  0.000902932 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  92.87 
 
 		 716 aa  1396    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  51.63 
 
 		 722 aa  747    Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1624  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.8 
 
 		 680 aa  652    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2306  peptidyl-dipeptidase Dcp  48.77 
 
 		 733 aa  707    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.283841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  80.72 
 
 		 711 aa  1174    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1628  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.58 
 
 		 681 aa  651    Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000356686  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1889  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.53 
 
 		 680 aa  657    Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.994052  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  56.82 
 
 		 714 aa  788    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  92.45 
 
 		 716 aa  1387    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  78.85 
 
 		 714 aa  1184    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  51.33 
 
 		 718 aa  719    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3306  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.49 
 
 		 711 aa  768    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2661  Peptidyl-dipeptidase Dcp  50.8 
 
 		 712 aa  704    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.678732  normal  0.107916 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01508  hypothetical protein  45.58 
 
 		 681 aa  652    Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000866306  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2120  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.58 
 
 		 681 aa  653    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000189096  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  54.71 
 
 		 714 aa  789    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  53.4 
 
 		 712 aa  801    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1627  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.58 
 
 		 681 aa  649    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000101595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  55.68 
 
 		 714 aa  806    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  96.77 
 
 		 716 aa  1445    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.12 
 
 		 715 aa  782    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0904  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.32 
 
 		 723 aa  753    Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  96.91 
 
 		 716 aa  1447    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.42 
 
 		 715 aa  786    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1615  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.66 
 
 		 680 aa  651    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.418466  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  51.25 
 
 		 718 aa  755    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2154  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.72 
 
 		 681 aa  653    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000542867  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  77.7 
 
 		 722 aa  1200    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  93 
 
 		 716 aa  1395    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  97.05 
 
 		 716 aa  1447    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  57.27 
 
 		 715 aa  783    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1172  peptidyl-dipeptidase Dcp  76.74 
 
 		 718 aa  1131    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1702  dipeptidyl carboxypeptidase II  45.43 
 
 		 681 aa  649    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0043073  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  56.45 
 
 		 714 aa  793    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  45.27 
 
 		 695 aa  630  1e-179  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2302  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.07 
 
 		 742 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000226304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2372  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.66 
 
 		 742 aa  626  1e-178  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00637637  normal  0.641493 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2492  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.66 
 
 		 742 aa  625  1e-178  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000562002  normal  0.0797641 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1054  Peptidyl-dipeptidase Dcp  46.01 
 
 		 655 aa  621  1e-176  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.391003  normal  0.428625 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1724  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.13 
 
 		 734 aa  616  1e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.00000140268  hitchhiker  0.0039604 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2739  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.86 
 
 		 734 aa  618  1e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000196014  normal  0.488715 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2692  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.51 
 
 		 726 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.00136088  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2627  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.72 
 
 		 734 aa  615  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0147146  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2661  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.58 
 
 		 734 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000935257  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.99 
 
 		 727 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1597  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.61 
 
 		 726 aa  611  1e-173  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  unclonable  0.0000000288176  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1857  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.87 
 
 		 729 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000553999  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1927  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.02 
 
 		 725 aa  605  1.0000000000000001e-171  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.00000906587  normal  0.0591624 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2161  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.08 
 
 		 726 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000156598  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8022  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.72 
 
 		 659 aa  600  1e-170  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5541  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.1 
 
 		 677 aa  598  1e-170  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.481391 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  43.03 
 
 		 730 aa  601  1e-170  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4856  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.14 
 
 		 691 aa  598  1e-169  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112436  normal  0.639922 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0938  Peptidyl-dipeptidase Dcp  45.61 
 
 		 687 aa  591  1e-167  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.964054  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0934  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.51 
 
 		 714 aa  588  1e-166  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  44.99 
 
 		 697 aa  588  1e-166  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2039  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.79 
 
 		 670 aa  568  1e-161  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000153602 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5074  Peptidyl-dipeptidase Dcp  43.92 
 
 		 679 aa  571  1e-161  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.53 
 
 		 736 aa  566  1e-160  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153146  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2313  peptidyl-dipeptidase Dcp  44.08 
 
 		 670 aa  563  1.0000000000000001e-159  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0197787  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2254  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.3 
 
 		 708 aa  561  1e-158  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1191  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.67 
 
 		 705 aa  557  1e-157  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.130613  normal  0.0642672 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3616  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.65 
 
 		 682 aa  552  1e-155  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.751531  normal  0.0161998 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21040  peptidyl-dipeptidase Dcp  42.84 
 
 		 699 aa  546  1e-154  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.547895  normal  0.690567 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  40.75 
 
 		 694 aa  535  1e-151  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  40.96 
 
 		 693 aa  537  1e-151  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.98 
 
 		 694 aa  538  1e-151  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.76 
 
 		 687 aa  536  1e-151  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.18 
 
 		 689 aa  533  1e-150  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.13 
 
 		 689 aa  530  1e-149  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.8 
 
 		 696 aa  529  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  40.06 
 
 		 696 aa  531  1e-149  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  41.1 
 
 		 696 aa  528  1e-148  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5800  Peptidyl-dipeptidase Dcp  42.25 
 
 		 848 aa  527  1e-148  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.882586 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1473  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.63 
 
 		 675 aa  524  1e-147  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.383758  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.82 
 
 		 716 aa  524  1e-147  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.97 
 
 		 717 aa  525  1e-147  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  40.23 
 
 		 696 aa  523  1e-147  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3302  Peptidyl-dipeptidase Dcp  39.68 
 
 		 717 aa  521  1e-146  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.335869  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  39.34 
 
 		 682 aa  517  1.0000000000000001e-145  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2784  Peptidyl-dipeptidase Dcp  41.69 
 
 		 676 aa  512  1e-144  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  38.23 
 
 		 709 aa  510  1e-143  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  40.73 
 
 		 692 aa  508  9.999999999999999e-143  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>