More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dbac_1228 on replicon NC_013173
Organism: Desulfomicrobium baculatum DSM 4028



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3689  Oligopeptidase A  50.22 
 
 
694 aa  694    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  53.12 
 
 
700 aa  731    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2913  Oligopeptidase A  51.81 
 
 
694 aa  722    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  53.19 
 
 
702 aa  721    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  52.11 
 
 
694 aa  727    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  100 
 
 
694 aa  1425    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0500  Oligopeptidase A  53.26 
 
 
701 aa  726    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0859  Oligopeptidase A  52.11 
 
 
694 aa  729    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  51.32 
 
 
701 aa  701    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06191  M3 family peptidase  44.04 
 
 
695 aa  632  1e-180  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8670  predicted protein  44.61 
 
 
726 aa  629  1e-179  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0930  oligopeptidase A  49.43 
 
 
700 aa  631  1e-179  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1029  oligopeptidase A  48.29 
 
 
700 aa  627  1e-178  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06581  M3 family peptidase  43.75 
 
 
700 aa  627  1e-178  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06491  M3 family peptidase  43.9 
 
 
695 aa  626  1e-178  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10571  M3 family peptidase  44.73 
 
 
705 aa  622  1e-177  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18561  M3 family peptidase  47.01 
 
 
715 aa  617  1e-175  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0593  peptidase family M3  43.27 
 
 
695 aa  610  1e-173  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.604836  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06491  M3 family peptidase  42.96 
 
 
703 aa  605  9.999999999999999e-173  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172258  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0029  peptidase family M3  42.67 
 
 
703 aa  602  1e-170  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1708  oligopeptidase A  55.53 
 
 
675 aa  576  1.0000000000000001e-163  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0475458  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  40.87 
 
 
683 aa  545  1e-154  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  41.01 
 
 
679 aa  541  9.999999999999999e-153  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  41.62 
 
 
676 aa  538  1e-151  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  40.23 
 
 
679 aa  536  1e-151  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  41.91 
 
 
682 aa  533  1e-150  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  535  1e-150  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  40.37 
 
 
680 aa  532  1e-150  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  40.72 
 
 
679 aa  534  1e-150  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  40.52 
 
 
679 aa  531  1e-149  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  41.1 
 
 
679 aa  529  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  39.8 
 
 
679 aa  531  1e-149  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  40.96 
 
 
679 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  41.1 
 
 
679 aa  528  1e-148  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  41.1 
 
 
679 aa  527  1e-148  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  41.51 
 
 
704 aa  526  1e-148  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  43.31 
 
 
682 aa  527  1e-148  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  40.96 
 
 
679 aa  526  1e-148  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  41.24 
 
 
679 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  41.24 
 
 
679 aa  527  1e-148  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  42.71 
 
 
679 aa  525  1e-148  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  40.96 
 
 
681 aa  528  1e-148  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  38.76 
 
 
683 aa  525  1e-147  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  38.64 
 
 
680 aa  523  1e-147  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  40.81 
 
 
679 aa  524  1e-147  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  38.93 
 
 
695 aa  524  1e-147  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  40.43 
 
 
686 aa  520  1e-146  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  41.07 
 
 
679 aa  521  1e-146  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  40.14 
 
 
678 aa  519  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  38.73 
 
 
679 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  42.31 
 
 
700 aa  514  1e-144  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  40.34 
 
 
685 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  40.14 
 
 
680 aa  513  1e-144  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  39.62 
 
 
678 aa  514  1e-144  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  40.49 
 
 
683 aa  511  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  39.57 
 
 
680 aa  509  1e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  40.43 
 
 
683 aa  510  1e-143  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  40.09 
 
 
695 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  39.57 
 
 
680 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  40.23 
 
 
680 aa  510  1e-143  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  40.52 
 
 
681 aa  511  1e-143  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  40.43 
 
 
695 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  39.71 
 
 
683 aa  507  9.999999999999999e-143  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  40.43 
 
 
695 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  39.6 
 
 
682 aa  507  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  38.78 
 
 
679 aa  506  9.999999999999999e-143  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  41.1 
 
 
694 aa  507  9.999999999999999e-143  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  40.09 
 
 
681 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  40 
 
 
682 aa  506  9.999999999999999e-143  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  38.96 
 
 
683 aa  507  9.999999999999999e-143  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  41.56 
 
 
699 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  41.56 
 
 
699 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  41.56 
 
 
699 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  41.56 
 
 
699 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  40.52 
 
 
692 aa  504  1e-141  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2397  oligopeptidase A  43.42 
 
 
685 aa  504  1e-141  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  40.78 
 
 
703 aa  503  1e-141  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  39.77 
 
 
679 aa  503  1e-141  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  41.56 
 
 
699 aa  503  1e-141  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  41.56 
 
 
699 aa  502  1e-141  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  41.42 
 
 
699 aa  503  1e-141  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  502  1e-140  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  39.22 
 
 
680 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  39.22 
 
 
680 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  40.17 
 
 
716 aa  500  1e-140  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  39.22 
 
 
680 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  39.22 
 
 
680 aa  501  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  39.07 
 
 
680 aa  499  1e-140  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  39.65 
 
 
680 aa  501  1e-140  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  40 
 
 
680 aa  498  1e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  40.62 
 
 
695 aa  498  1e-139  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  40.28 
 
 
695 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  40.43 
 
 
695 aa  498  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>