More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9902_0930 on replicon NC_007513
Organism: Synechococcus sp. CC9902



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  55.79 
 
 
700 aa  786    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  53.92 
 
 
694 aa  759    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  49.43 
 
 
694 aa  649    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0029  peptidase family M3  60.83 
 
 
703 aa  917    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  53.22 
 
 
702 aa  729    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06491  M3 family peptidase  60.98 
 
 
703 aa  923    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172258  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2913  Oligopeptidase A  53.72 
 
 
694 aa  748    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0930  oligopeptidase A  100 
 
 
700 aa  1429    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1029  oligopeptidase A  80.06 
 
 
700 aa  1126    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0593  peptidase family M3  55.25 
 
 
695 aa  802    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.604836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1708  oligopeptidase A  62.1 
 
 
675 aa  671    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0475458  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8670  predicted protein  46.62 
 
 
726 aa  660    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06191  M3 family peptidase  53.7 
 
 
695 aa  801    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18561  M3 family peptidase  70.1 
 
 
715 aa  988    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10571  M3 family peptidase  58.72 
 
 
705 aa  896    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  54.36 
 
 
701 aa  728    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0859  Oligopeptidase A  53.93 
 
 
694 aa  757    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0500  Oligopeptidase A  54.22 
 
 
701 aa  742    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06491  M3 family peptidase  54.14 
 
 
695 aa  805    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3689  Oligopeptidase A  50.07 
 
 
694 aa  686    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06581  M3 family peptidase  54.37 
 
 
700 aa  809    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  44.29 
 
 
686 aa  572  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  42.82 
 
 
676 aa  556  1e-157  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  41.55 
 
 
680 aa  540  9.999999999999999e-153  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  41.77 
 
 
679 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  43.16 
 
 
682 aa  532  1e-150  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  43.95 
 
 
694 aa  528  1e-148  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  41.31 
 
 
681 aa  523  1e-147  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  40.03 
 
 
683 aa  523  1e-147  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  41.84 
 
 
679 aa  520  1e-146  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  40.06 
 
 
680 aa  519  1e-146  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  41.68 
 
 
678 aa  519  1e-146  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  41.7 
 
 
679 aa  522  1e-146  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  41.43 
 
 
679 aa  521  1e-146  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  40.92 
 
 
679 aa  520  1e-146  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  41.77 
 
 
679 aa  520  1e-146  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  43.08 
 
 
679 aa  522  1e-146  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  40.92 
 
 
679 aa  521  1e-146  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  41.55 
 
 
683 aa  519  1e-146  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  41.23 
 
 
682 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  41.9 
 
 
679 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  41.83 
 
 
699 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  41.56 
 
 
679 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  42.45 
 
 
700 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  41.56 
 
 
679 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  40.92 
 
 
680 aa  518  1.0000000000000001e-145  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  41.69 
 
 
699 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  41.9 
 
 
679 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  39.91 
 
 
695 aa  516  1.0000000000000001e-145  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  41.69 
 
 
699 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  42.05 
 
 
679 aa  518  1.0000000000000001e-145  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  41.77 
 
 
678 aa  516  1.0000000000000001e-145  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  41.69 
 
 
699 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  41.69 
 
 
699 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  41.56 
 
 
679 aa  514  1e-144  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  42.29 
 
 
682 aa  513  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  41.69 
 
 
699 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  42.43 
 
 
680 aa  514  1e-144  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  41.71 
 
 
679 aa  514  1e-144  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  41.69 
 
 
699 aa  515  1e-144  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  41.34 
 
 
685 aa  513  1e-144  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  40.14 
 
 
679 aa  512  1e-144  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  42.43 
 
 
680 aa  515  1e-144  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  41.76 
 
 
679 aa  514  1e-144  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  42.02 
 
 
681 aa  514  1e-144  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  41.85 
 
 
692 aa  510  1e-143  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  41.87 
 
 
704 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  42.7 
 
 
706 aa  508  9.999999999999999e-143  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  41.67 
 
 
704 aa  507  9.999999999999999e-143  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  39.46 
 
 
679 aa  506  9.999999999999999e-143  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  42.31 
 
 
681 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  41.54 
 
 
681 aa  503  1e-141  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  40.77 
 
 
680 aa  504  1e-141  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  41.56 
 
 
704 aa  504  1e-141  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  42.57 
 
 
695 aa  501  1e-140  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  42.57 
 
 
695 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  40.77 
 
 
682 aa  502  1e-140  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  42.57 
 
 
695 aa  500  1e-140  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  41.53 
 
 
695 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  40.88 
 
 
716 aa  498  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  42.15 
 
 
695 aa  498  1e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  41.53 
 
 
695 aa  496  1e-139  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  39.63 
 
 
680 aa  494  9.999999999999999e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  37.89 
 
 
683 aa  493  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  40.46 
 
 
679 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  40.9 
 
 
700 aa  494  9.999999999999999e-139  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  38.68 
 
 
712 aa  494  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  39.77 
 
 
680 aa  493  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  40.71 
 
 
683 aa  489  1e-137  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  40.43 
 
 
683 aa  491  1e-137  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  40.66 
 
 
692 aa  489  1e-137  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  41.22 
 
 
702 aa  491  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  40.71 
 
 
695 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0122  oligopeptidase A  39.91 
 
 
680 aa  486  1e-136  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0702  Oligopeptidase A  39.66 
 
 
712 aa  488  1e-136  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.713847  normal  0.266777 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0084  oligopeptidase A  41.21 
 
 
731 aa  488  1e-136  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.611624  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  40.71 
 
 
695 aa  488  1e-136  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0730  oligopeptidase A  40.87 
 
 
708 aa  484  1e-135  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2132  oligopeptidase A  42.05 
 
 
677 aa  484  1e-135  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0694294  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  39.06 
 
 
680 aa  482  1e-135  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>