More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3689 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008816  A9601_06491  M3 family peptidase  43.33 
 
 		 695 aa  644    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2913  Oligopeptidase A  57.14 
 
 		 694 aa  819    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0029  peptidase family M3  45.53 
 
 		 703 aa  646    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  54.47 
 
 		 702 aa  775    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0859  Oligopeptidase A  55.24 
 
 		 694 aa  804    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0930  oligopeptidase A  50.07 
 
 		 700 aa  666    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1029  oligopeptidase A  49.07 
 
 		 700 aa  657    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0593  peptidase family M3  44.98 
 
 		 695 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.604836  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1708  oligopeptidase A  60.15 
 
 		 675 aa  653    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0475458  normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8670  predicted protein  47.15 
 
 		 726 aa  673    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06191  M3 family peptidase  44.33 
 
 		 695 aa  647    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3689  Oligopeptidase A  100 
 
 		 694 aa  1436    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10571  M3 family peptidase  45.01 
 
 		 705 aa  642    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  55.52 
 
 		 694 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0500  Oligopeptidase A  55.57 
 
 		 701 aa  772    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  50.22 
 
 		 694 aa  694    Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  55.07 
 
 		 701 aa  778    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06581  M3 family peptidase  44.72 
 
 		 700 aa  639    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06491  M3 family peptidase  45.25 
 
 		 703 aa  645    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172258  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  55.33 
 
 		 700 aa  813    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18561  M3 family peptidase  48.15 
 
 		 715 aa  646    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  43.58 
 
 		 682 aa  590  1e-167  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  44.62 
 
 		 676 aa  585  1.0000000000000001e-165  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  44.16 
 
 		 679 aa  575  1.0000000000000001e-163  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  43.86 
 
 		 679 aa  574  1.0000000000000001e-162  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  43.95 
 
 		 679 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  43.33 
 
 		 686 aa  574  1.0000000000000001e-162  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  43.66 
 
 		 679 aa  573  1.0000000000000001e-162  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  43.47 
 
 		 679 aa  570  1e-161  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  43.43 
 
 		 679 aa  568  1e-161  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  43.8 
 
 		 679 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  43.8 
 
 		 679 aa  570  1e-161  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  43.5 
 
 		 679 aa  570  1e-161  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  43.63 
 
 		 679 aa  569  1e-161  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  42.12 
 
 		 683 aa  566  1e-160  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  43.29 
 
 		 679 aa  566  1e-160  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  42.84 
 
 		 683 aa  568  1e-160  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  41.81 
 
 		 679 aa  568  1e-160  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  43.23 
 
 		 679 aa  565  1e-160  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  43.8 
 
 		 679 aa  568  1e-160  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  44.68 
 
 		 683 aa  565  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  42.47 
 
 		 679 aa  564  1.0000000000000001e-159  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  44.68 
 
 		 695 aa  563  1.0000000000000001e-159  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  43.78 
 
 		 704 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  42.14 
 
 		 679 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  43.5 
 
 		 678 aa  563  1.0000000000000001e-159  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  44.05 
 
 		 682 aa  561  1e-158  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  43.14 
 
 		 679 aa  561  1e-158  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  43.08 
 
 		 680 aa  561  1e-158  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  44.54 
 
 		 695 aa  560  1e-158  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  43.1 
 
 		 680 aa  559  1e-158  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  42.16 
 
 		 680 aa  561  1e-158  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  41.79 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  41.79 
 
 		 680 aa  557  1e-157  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 682 aa  555  1e-156  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  42.65 
 
 		 682 aa  553  1e-156  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  43.22 
 
 		 699 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  43.94 
 
 		 683 aa  551  1e-155  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  43.22 
 
 		 699 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  43.79 
 
 		 683 aa  550  1e-155  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  43.16 
 
 		 699 aa  549  1e-155  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  44.11 
 
 		 695 aa  551  1e-155  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  43.22 
 
 		 699 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  43.22 
 
 		 699 aa  550  1e-155  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  40.49 
 
 		 680 aa  549  1e-155  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  43.22 
 
 		 699 aa  548  1e-155  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  44.46 
 
 		 681 aa  551  1e-155  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  41.92 
 
 		 704 aa  546  1e-154  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  44.02 
 
 		 692 aa  546  1e-154  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  42.19 
 
 		 716 aa  547  1e-154  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  42.49 
 
 		 679 aa  545  1e-154  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  44.17 
 
 		 681 aa  546  1e-154  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  43.22 
 
 		 699 aa  548  1e-154  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  41.98 
 
 		 704 aa  547  1e-154  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  40.29 
 
 		 695 aa  547  1e-154  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  42.12 
 
 		 706 aa  545  1e-153  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  42.05 
 
 		 692 aa  542  1e-153  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  42.74 
 
 		 700 aa  543  1e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  42.57 
 
 		 700 aa  543  1e-153  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  40.78 
 
 		 680 aa  545  1e-153  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  41.71 
 
 		 680 aa  542  1e-153  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  42.31 
 
 		 702 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  41.14 
 
 		 680 aa  540  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4479  oligopeptidase A  41.21 
 
 		 680 aa  539  9.999999999999999e-153  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  43.49 
 
 		 695 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  41.64 
 
 		 680 aa  540  9.999999999999999e-153  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  41.86 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  539  9.999999999999999e-153  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  41.64 
 
 		 680 aa  542  9.999999999999999e-153  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  43.63 
 
 		 695 aa  540  9.999999999999999e-153  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4196  oligopeptidase A  41.5 
 
 		 680 aa  541  9.999999999999999e-153  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  539  9.999999999999999e-153  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  40.98 
 
 		 679 aa  538  1e-151  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  41 
 
 		 680 aa  538  1e-151  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>