More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMN2A_0029 on replicon NC_007335
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL2A



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008817  P9515_06581  M3 family peptidase  56.9 
 
 		 700 aa  807    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  49.79 
 
 		 700 aa  705    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0029  peptidase family M3  100 
 
 		 703 aa  1450    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  49.29 
 
 		 702 aa  688    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0859  Oligopeptidase A  51.06 
 
 		 694 aa  724    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0500  Oligopeptidase A  50.28 
 
 		 701 aa  689    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0930  oligopeptidase A  60.83 
 
 		 700 aa  897    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1029  oligopeptidase A  61.17 
 
 		 700 aa  892    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.434971  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0593  peptidase family M3  57.25 
 
 		 695 aa  806    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.604836  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18561  M3 family peptidase  61.48 
 
 		 715 aa  918    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06491  M3 family peptidase  57.39 
 
 		 695 aa  813    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10571  M3 family peptidase  61.54 
 
 		 705 aa  916    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2913  Oligopeptidase A  49.44 
 
 		 694 aa  696    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8670  predicted protein  46.39 
 
 		 726 aa  659    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3689  Oligopeptidase A  45.53 
 
 		 694 aa  646    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  50.71 
 
 		 701 aa  685    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06191  M3 family peptidase  57.82 
 
 		 695 aa  815    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  51.35 
 
 		 694 aa  727    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06491  M3 family peptidase  98.29 
 
 		 703 aa  1426    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172258  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1708  oligopeptidase A  54.43 
 
 		 675 aa  604  1.0000000000000001e-171  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0475458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  42.67 
 
 		 694 aa  602  1e-170  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  41.31 
 
 		 686 aa  562  1.0000000000000001e-159  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  42.22 
 
 		 676 aa  564  1.0000000000000001e-159  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  40.71 
 
 		 679 aa  539  9.999999999999999e-153  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  40.23 
 
 		 679 aa  538  1e-151  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  40.37 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  39.51 
 
 		 680 aa  535  1e-151  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  40.51 
 
 		 679 aa  536  1e-151  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  40.65 
 
 		 679 aa  538  1e-151  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  40.65 
 
 		 679 aa  537  1e-151  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  40.43 
 
 		 679 aa  535  1e-150  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  40.43 
 
 		 679 aa  534  1e-150  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  39.94 
 
 		 679 aa  532  1e-150  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  40.28 
 
 		 679 aa  530  1e-149  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  40.14 
 
 		 679 aa  529  1e-149  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  39.75 
 
 		 682 aa  529  1e-149  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  40.28 
 
 		 679 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  40.94 
 
 		 679 aa  528  1e-148  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  40.03 
 
 		 679 aa  527  1e-148  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  40.37 
 
 		 679 aa  523  1e-147  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  40.23 
 
 		 679 aa  524  1e-147  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  40.09 
 
 		 681 aa  522  1e-147  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  41.12 
 
 		 683 aa  522  1e-147  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  40.79 
 
 		 681 aa  520  1e-146  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  39.94 
 
 		 683 aa  520  1e-146  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  39.66 
 
 		 679 aa  519  1e-146  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  39.74 
 
 		 678 aa  521  1e-146  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  40.91 
 
 		 694 aa  518  1.0000000000000001e-145  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  40.23 
 
 		 681 aa  517  1.0000000000000001e-145  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  40.85 
 
 		 683 aa  512  1e-144  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 699 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  39.83 
 
 		 679 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  39.66 
 
 		 683 aa  509  1e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  40.03 
 
 		 678 aa  510  1e-143  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  40.84 
 
 		 700 aa  511  1e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  40.09 
 
 		 681 aa  511  1e-143  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 699 aa  510  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  39.83 
 
 		 695 aa  510  1e-143  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  39.94 
 
 		 680 aa  511  1e-143  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  40.76 
 
 		 699 aa  511  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  40.62 
 
 		 680 aa  509  1e-143  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  39.69 
 
 		 695 aa  508  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  40.28 
 
 		 716 aa  508  9.999999999999999e-143  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  40.62 
 
 		 680 aa  508  9.999999999999999e-143  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  40.66 
 
 		 682 aa  506  9.999999999999999e-143  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  37.85 
 
 		 683 aa  502  1e-141  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  38.98 
 
 		 680 aa  503  1e-141  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  40.57 
 
 		 683 aa  504  1e-141  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  40.62 
 
 		 704 aa  505  1e-141  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  39.42 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  39.42 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  39.42 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  39.4 
 
 		 695 aa  500  1e-140  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  39.42 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  39.42 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  39.42 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  39.42 
 
 		 680 aa  499  1e-140  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  39.28 
 
 		 680 aa  498  1e-139  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  39.32 
 
 		 692 aa  498  1e-139  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  38.94 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  39.28 
 
 		 680 aa  498  1e-139  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  40.28 
 
 		 702 aa  496  1e-139  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  38.8 
 
 		 680 aa  496  1e-139  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  38.37 
 
 		 680 aa  497  1e-139  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  41.1 
 
 		 695 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  36.66 
 
 		 682 aa  493  9.999999999999999e-139  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  40.23 
 
 		 706 aa  495  9.999999999999999e-139  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  37.84 
 
 		 680 aa  493  9.999999999999999e-139  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  38.66 
 
 		 680 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  39.03 
 
 		 680 aa  495  9.999999999999999e-139  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  38.66 
 
 		 680 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  38.37 
 
 		 680 aa  494  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2240  oligopeptidase A  38.5 
 
 		 712 aa  493  9.999999999999999e-139  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  38.66 
 
 		 680 aa  493  9.999999999999999e-139  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  40.68 
 
 		 695 aa  489  1e-137  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  39.34 
 
 		 704 aa  490  1e-137  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.932062 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>