More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Synpcc7942_1708 on replicon NC_007604
Organism: Synechococcus elongatus PCC 7942



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0859  Oligopeptidase A  72.14 
 
 
694 aa  807    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0500  Oligopeptidase A  69.01 
 
 
701 aa  741    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.452158  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2626  Oligopeptidase A  71.54 
 
 
700 aa  789    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.762505  normal  0.694049 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0885  Oligopeptidase A  72.33 
 
 
694 aa  808    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4484  oligopeptidase A  69.47 
 
 
702 aa  751    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18561  M3 family peptidase  59.77 
 
 
715 aa  635    Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0930  oligopeptidase A  62.1 
 
 
700 aa  662    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1029  oligopeptidase A  61.55 
 
 
700 aa  662    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.434971  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1708  oligopeptidase A  100 
 
 
675 aa  1385    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0475458  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3689  Oligopeptidase A  60.15 
 
 
694 aa  665    Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2913  Oligopeptidase A  71.95 
 
 
694 aa  775    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4649  oligopeptidase A  70.21 
 
 
701 aa  765    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.621087  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06491  M3 family peptidase  54.61 
 
 
703 aa  615  1e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.172258  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0029  peptidase family M3  54.43 
 
 
703 aa  613  9.999999999999999e-175  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06491  M3 family peptidase  51.89 
 
 
695 aa  605  1.0000000000000001e-171  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06581  M3 family peptidase  52.26 
 
 
700 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10571  M3 family peptidase  53.86 
 
 
705 aa  601  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0593  peptidase family M3  51.7 
 
 
695 aa  600  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.604836  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06191  M3 family peptidase  51.32 
 
 
695 aa  599  1e-170  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_8670  predicted protein  54.28 
 
 
726 aa  588  1e-167  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1228  Oligopeptidase A  55.53 
 
 
694 aa  587  1e-166  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.470047  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0320  oligopeptidase A  49.91 
 
 
676 aa  505  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  49.25 
 
 
679 aa  488  1e-136  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  47.73 
 
 
686 aa  488  1e-136  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4699  oligopeptidase A  48.96 
 
 
679 aa  481  1e-134  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  45.8 
 
 
683 aa  481  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  50.75 
 
 
694 aa  481  1e-134  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  46.8 
 
 
680 aa  479  1e-134  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4256  oligopeptidase A  49.06 
 
 
679 aa  478  1e-133  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01090  oligopeptidase A  50.65 
 
 
681 aa  478  1e-133  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  48.21 
 
 
679 aa  479  1e-133  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3842  oligopeptidase A  48.59 
 
 
679 aa  477  1e-133  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3935  oligopeptidase A  48.4 
 
 
679 aa  476  1e-133  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4051  oligopeptidase A  48.59 
 
 
679 aa  477  1e-133  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  47.26 
 
 
682 aa  474  1e-132  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4392  oligopeptidase A  48.97 
 
 
679 aa  475  1e-132  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00790  oligopeptidase A  49.81 
 
 
681 aa  472  1e-132  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.983257  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  49.62 
 
 
682 aa  473  1e-132  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0045  oligopeptidase A  49.53 
 
 
683 aa  472  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0090  oligopeptidase A  49.72 
 
 
692 aa  469  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0124  oligopeptidase A  47.65 
 
 
679 aa  469  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0087  oligopeptidase A  48.59 
 
 
679 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3874  oligopeptidase A  46.69 
 
 
679 aa  472  1.0000000000000001e-131  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4217  Oligopeptidase A  48.02 
 
 
679 aa  471  1.0000000000000001e-131  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0067  oligopeptidase A  49.81 
 
 
681 aa  467  9.999999999999999e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0144  oligopeptidase A  48.96 
 
 
683 aa  466  9.999999999999999e-131  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  47.09 
 
 
679 aa  468  9.999999999999999e-131  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2235  oligopeptidase A  47.19 
 
 
699 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4986  oligopeptidase A  44.19 
 
 
683 aa  464  1e-129  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  47.19 
 
 
699 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1726  oligopeptidase A  47.19 
 
 
699 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.328644  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2750  oligopeptidase A  47.19 
 
 
699 aa  463  1e-129  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1860  oligopeptidase A  47.4 
 
 
700 aa  465  1e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.709239  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3084  oligopeptidase A  47.19 
 
 
699 aa  463  1e-129  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3657  oligopeptidase A  47.56 
 
 
679 aa  463  1e-129  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.601769 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  47.93 
 
 
679 aa  464  1e-129  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  47.19 
 
 
699 aa  464  1e-129  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0212  oligopeptidase A  47.17 
 
 
683 aa  464  1e-129  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0096  oligopeptidase A  48.78 
 
 
683 aa  461  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.32998  hitchhiker  0.00599775 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0111  oligopeptidase A  48.78 
 
 
695 aa  460  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0111  oligopeptidase A  48.78 
 
 
695 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000602107 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0791  oligopeptidase A  45.95 
 
 
679 aa  462  9.999999999999999e-129  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1623  Oligopeptidase A  47.58 
 
 
704 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.932062 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2674  oligopeptidase A  47 
 
 
699 aa  462  9.999999999999999e-129  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.295345  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  47.46 
 
 
678 aa  461  9.999999999999999e-129  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2597  Oligopeptidase A  45.72 
 
 
702 aa  456  1e-127  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.219931  normal  0.0217228 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1951  Oligopeptidase A  47.01 
 
 
704 aa  456  1e-127  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.844627  normal  0.0899993 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1298  oligopeptidase A  46.93 
 
 
692 aa  457  1e-127  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.757231  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0114  oligopeptidase A  48.4 
 
 
695 aa  457  1e-127  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.357976  normal  0.13234 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0208  oligopeptidase A  46.42 
 
 
679 aa  456  1e-127  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  45.91 
 
 
716 aa  458  1e-127  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4086  oligopeptidase A  47.18 
 
 
680 aa  456  1e-127  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.902618 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2433  oligopeptidase A  46.73 
 
 
701 aa  452  1.0000000000000001e-126  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0116  oligopeptidase A  47.18 
 
 
680 aa  455  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03492  oligopeptidase A  45.95 
 
 
678 aa  453  1.0000000000000001e-126  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3595  oligopeptidase A  45.86 
 
 
679 aa  454  1.0000000000000001e-126  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4047  oligopeptidase A  46.99 
 
 
682 aa  453  1.0000000000000001e-126  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.980043  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  46.82 
 
 
706 aa  450  1e-125  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0150  oligopeptidase A  46.9 
 
 
679 aa  449  1e-125  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0372443 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2051  oligopeptidase A  46.84 
 
 
695 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.347537  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2483  oligopeptidase A  45.16 
 
 
703 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1476  oligopeptidase A  45.52 
 
 
704 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0816638  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0702  Oligopeptidase A  46.86 
 
 
712 aa  446  1.0000000000000001e-124  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.713847  normal  0.266777 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2159  oligopeptidase A  46.28 
 
 
695 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5936  oligopeptidase A  46.65 
 
 
695 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00788443  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0007  oligopeptidase A  45.01 
 
 
680 aa  443  1e-123  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.73797  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2178  oligopeptidase A  46.84 
 
 
695 aa  445  1e-123  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.61297  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2141  oligopeptidase A  46.65 
 
 
695 aa  444  1e-123  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.388715  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1129  oligopeptidase A  46.93 
 
 
695 aa  443  1e-123  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.60188  normal  0.628312 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0031  oligopeptidase A  45.23 
 
 
685 aa  439  9.999999999999999e-123  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1191  oligopeptidase A  45.25 
 
 
700 aa  439  9.999999999999999e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00600265  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  44.63 
 
 
680 aa  441  9.999999999999999e-123  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  45.49 
 
 
680 aa  439  1e-121  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5447  oligopeptidase A  46.17 
 
 
695 aa  437  1e-121  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0730  oligopeptidase A  47.34 
 
 
708 aa  437  1e-121  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  44.82 
 
 
680 aa  436  1e-121  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4701  oligopeptidase A  45.01 
 
 
680 aa  438  1e-121  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00526  Zn-dependent oligopeptidase  45.11 
 
 
695 aa  436  1e-121  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0054  oligopeptidase A  45.66 
 
 
681 aa  439  1e-121  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0345207  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0156  oligopeptidase A  42.34 
 
 
683 aa  433  1e-120  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>