65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VC0395_A1568 on replicon NC_009457
Organism: Vibrio cholerae O395



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  75.57 
 
 
615 aa  996    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  56.12 
 
 
622 aa  699    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  56.63 
 
 
622 aa  700    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  55.68 
 
 
621 aa  678    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  54.89 
 
 
619 aa  678    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  100 
 
 
615 aa  1291    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  76.22 
 
 
615 aa  1008    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  55.41 
 
 
618 aa  678    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  39.37 
 
 
624 aa  399  9.999999999999999e-111  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0604  hypothetical protein  23.74 
 
 
507 aa  67.4  0.0000000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  25.54 
 
 
682 aa  61.2  0.00000005  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  23.51 
 
 
676 aa  60.8  0.00000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  25.37 
 
 
679 aa  59.3  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  30.97 
 
 
749 aa  58.5  0.0000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.44 
 
 
716 aa  57.8  0.0000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.56 
 
 
714 aa  54.3  0.000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.56 
 
 
714 aa  53.9  0.000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.35 
 
 
714 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.56 
 
 
714 aa  53.9  0.000009  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  24.63 
 
 
528 aa  53.5  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  28.9 
 
 
695 aa  51.6  0.00004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.56 
 
 
715 aa  49.7  0.0001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  25.2 
 
 
569 aa  49.3  0.0002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  23.44 
 
 
563 aa  49.7  0.0002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_625  predicted protein  21.78 
 
 
657 aa  49.7  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  22.04 
 
 
579 aa  49.3  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1586  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.56 
 
 
715 aa  49.3  0.0002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.6132 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1525  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.56 
 
 
715 aa  48.9  0.0002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.11 
 
 
714 aa  48.1  0.0004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4207  oligopeptidase A  22.67 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2570  oligopeptidase A  21.27 
 
 
680 aa  48.1  0.0005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  23.69 
 
 
563 aa  47.4  0.0008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  23.69 
 
 
563 aa  47.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  23.44 
 
 
563 aa  47.4  0.0008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.38 
 
 
714 aa  47.4  0.0008  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4461  oligopeptidase A  24.19 
 
 
682 aa  47  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  23.05 
 
 
563 aa  47  0.001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  27.4 
 
 
681 aa  46.6  0.001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2040  Oligopeptidase A  28.12 
 
 
726 aa  47  0.001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328478  hitchhiker  0.00152686 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2902  oligoendopeptidase F, putative  23.74 
 
 
527 aa  45.8  0.002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000435555  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.38 
 
 
716 aa  46.2  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001952  oligopeptidase A  20.76 
 
 
680 aa  46.2  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0781  hypothetical protein  33.09 
 
 
504 aa  46.2  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2917  peptidase, family M3  22.75 
 
 
527 aa  46.2  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.496699  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02761  peptidyl-dipeptidase dcp  35.16 
 
 
722 aa  45.8  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.538923  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  22.57 
 
 
679 aa  46.2  0.002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.22 
 
 
689 aa  45.4  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  28.79 
 
 
577 aa  45.4  0.003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.27 
 
 
729 aa  45.1  0.004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4613  thimet oligopeptidase  23.53 
 
 
641 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.910564  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.9 
 
 
716 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.9 
 
 
716 aa  45.1  0.004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.29 
 
 
625 aa  44.7  0.005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.9 
 
 
716 aa  44.7  0.005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2676  peptidase  21.4 
 
 
394 aa  44.7  0.005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000426358  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1534  oligopeptidase A  23.1 
 
 
716 aa  44.3  0.006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.122877 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.78 
 
 
712 aa  44.7  0.006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.81 
 
 
718 aa  44.3  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.9 
 
 
716 aa  44.3  0.007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  25.19 
 
 
563 aa  44.3  0.007  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2874  peptidase, family M3  21.05 
 
 
527 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000399677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2638  hypothetical protein  25.19 
 
 
563 aa  44.3  0.007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000945895  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2628  oligoendopeptidase F  21.8 
 
 
527 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000191518  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.29 
 
 
626 aa  43.9  0.008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2599  oligoendopeptidase F  22.73 
 
 
527 aa  43.5  0.01  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.013987  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>