145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2396 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  83.14 
 
 		 621 aa  1044    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 619 aa  1286    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  55.12 
 
 		 615 aa  708    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  55.19 
 
 		 615 aa  690    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  54.07 
 
 		 615 aa  694    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  73.94 
 
 		 618 aa  941    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  76.82 
 
 		 622 aa  1010    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  77.15 
 
 		 622 aa  995    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  39.07 
 
 		 624 aa  418  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  26.06 
 
 		 528 aa  72.8  0.00000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4545  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.73 
 
 		 694 aa  69.3  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.757808 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.63 
 
 		 716 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  22.45 
 
 		 579 aa  66.2  0.000000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.38 
 
 		 716 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.38 
 
 		 716 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.38 
 
 		 716 aa  66.2  0.000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.33 
 
 		 714 aa  64.7  0.000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.57 
 
 		 716 aa  63.9  0.000000007  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.81 
 
 		 717 aa  64.3  0.000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0940  Peptidyl-dipeptidase Dcp  23.68 
 
 		 696 aa  64.3  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131573  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.57 
 
 		 716 aa  63.9  0.000000008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0926  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  24.32 
 
 		 692 aa  63.5  0.00000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.12 
 
 		 681 aa  63.5  0.00000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.01 
 
 		 685 aa  62.8  0.00000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3302  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.42 
 
 		 682 aa  62.8  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423656  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.32 
 
 		 716 aa  62  0.00000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  24.03 
 
 		 680 aa  62  0.00000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3532  oligoendopeptidase, M3 family  28.62 
 
 		 577 aa  61.6  0.00000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.387362 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.32 
 
 		 716 aa  60.8  0.00000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0858  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.27 
 
 		 696 aa  60.5  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.556421 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4158  peptidyl-dipeptidase  23.45 
 
 		 694 aa  59.3  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.964957  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  21.56 
 
 		 683 aa  58.9  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  24.24 
 
 		 682 aa  59.3  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1351  peptidyl-dipeptidase  22.86 
 
 		 693 aa  58.2  0.0000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.394273 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0399  oligopeptidase A  24.17 
 
 		 694 aa  57.8  0.0000007  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.905041  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0011  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.48 
 
 		 683 aa  57.4  0.0000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.100519 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0878  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.81 
 
 		 682 aa  56.6  0.000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  24.19 
 
 		 679 aa  57  0.000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  27.44 
 
 		 580 aa  56.6  0.000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2334  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.65 
 
 		 727 aa  55.8  0.000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00135351  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1858  Oligopeptidase A  21.55 
 
 		 709 aa  55.8  0.000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.375638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0823  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.09 
 
 		 733 aa  56.2  0.000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1448  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.58 
 
 		 722 aa  55.8  0.000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0138668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  25.61 
 
 		 689 aa  55.5  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.26 
 
 		 689 aa  55.1  0.000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  26.42 
 
 		 569 aa  54.3  0.000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3980  oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  54.3  0.000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3417  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.9 
 
 		 696 aa  53.5  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.8 
 
 		 678 aa  53.5  0.00001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3797  oligopeptidase A  22.58 
 
 		 680 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2053  thimet oligopeptidase  23.04 
 
 		 660 aa  53.5  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.499816  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  19.62 
 
 		 711 aa  53.5  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  23.51 
 
 		 680 aa  53.5  0.00001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3787  oligopeptidase A  22.58 
 
 		 680 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3613  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.08 
 
 		 718 aa  52.8  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000460509  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3907  oligopeptidase A  22.58 
 
 		 680 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3968  oligopeptidase A  22.58 
 
 		 680 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3864  oligopeptidase A  22.58 
 
 		 680 aa  52.4  0.00002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1565  oligoendopeptidase F  26.17 
 
 		 566 aa  52  0.00003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.435983  normal  0.359191 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0534  oligoendopeptidase, M3 family  26.11 
 
 		 577 aa  52.4  0.00003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3546  oligopeptidase A  22.54 
 
 		 678 aa  52  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2249  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.29 
 
 		 672 aa  52  0.00003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0488613  normal  0.482949 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  22.05 
 
 		 676 aa  51.6  0.00004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.66 
 
 		 695 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2786  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.83 
 
 		 712 aa  51.2  0.00005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.0046774  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.35 
 
 		 695 aa  51.2  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1481  Oligopeptidase A  22.71 
 
 		 714 aa  51.2  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1253  oligopeptidase A  19.95 
 
 		 682 aa  50.8  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0010  oligopeptidase A  22.99 
 
 		 680 aa  50.8  0.00006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0604  hypothetical protein  22.77 
 
 		 507 aa  50.4  0.00009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.05 
 
 		 714 aa  50.1  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0596  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.04 
 
 		 672 aa  50.4  0.0001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  22.59 
 
 		 749 aa  50.4  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0006  Oligopeptidase A  21.73 
 
 		 686 aa  49.7  0.0001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.63 
 
 		 716 aa  49.3  0.0002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.77 
 
 		 714 aa  49.7  0.0002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.77 
 
 		 714 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.14 
 
 		 714 aa  49.3  0.0002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.85 
 
 		 720 aa  48.9  0.0003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0514  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.36 
 
 		 672 aa  48.9  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0408972  normal  0.0574959 
 
 
-
 
NC_011684  PHATRDRAFT_48190  predicted protein  21.75 
 
 		 780 aa  48.9  0.0003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2754  pepF/M3 family oligoendopeptidase  24.91 
 
 		 625 aa  48.9  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0054  oligopeptidase A  20.83 
 
 		 695 aa  48.5  0.0004  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1564  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.05 
 
 		 730 aa  48.5  0.0004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3177  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.84 
 
 		 687 aa  48.1  0.0004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1268  thimet oligopeptidase  20.66 
 
 		 681 aa  48.5  0.0004  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.000110784  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2981  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  24.91 
 
 		 625 aa  47.8  0.0006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.54197  normal  0.947222 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4839  peptidyl-dipeptidase Dcp  22.68 
 
 		 696 aa  47.4  0.0007  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2618  oligopeptidase A  20.88 
 
 		 699 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1595  oligopeptidase A  21.78 
 
 		 706 aa  47.4  0.0008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  20.63 
 
 		 716 aa  47.4  0.0008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1507  oligopeptidase A  20.88 
 
 		 699 aa  46.6  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3217  Peptidyl-dipeptidase Dcp  20.27 
 
 		 717 aa  47  0.001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.738556  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>