85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene VIBHAR_06870 on replicon NC_009784
Organism: Vibrio harveyi ATCC BAA-1116



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  54.17 
 
 		 618 aa  671    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  100 
 
 		 615 aa  1288    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  76.22 
 
 		 615 aa  1008    Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  54.07 
 
 		 619 aa  685    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  54.56 
 
 		 621 aa  677    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  55.21 
 
 		 622 aa  707    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  91.22 
 
 		 615 aa  1186    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  54.63 
 
 		 622 aa  700    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  40.95 
 
 		 624 aa  422  1e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1536  thimet oligopeptidase  23.94 
 
 		 676 aa  63.9  0.000000008  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.100985  unclonable  4.6585e-19 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0604  hypothetical protein  22.83 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0006  Oligopeptidase A  23.34 
 
 		 682 aa  59.7  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.322163  normal  0.727066 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0146  M3 family oligoendopeptidase  26.3 
 
 		 569 aa  58.9  0.0000003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00338849  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00465  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.55 
 
 		 729 aa  58.9  0.0000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0349623  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_46518  predicted protein  23.43 
 
 		 579 aa  57  0.000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.189751  normal  0.0234668 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  23.47 
 
 		 528 aa  55.5  0.000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  30.19 
 
 		 749 aa  54.7  0.000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  24.56 
 
 		 563 aa  54.3  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3258  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.69 
 
 		 689 aa  53.5  0.00001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.703837  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  24.46 
 
 		 563 aa  52.8  0.00002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2581  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.31 
 
 		 714 aa  52  0.00003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.416327  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0781  hypothetical protein  27.21 
 
 		 504 aa  51.6  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  24.37 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  24.37 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1944  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.92 
 
 		 678 aa  50.1  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.357111  normal  0.0103926 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0993  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.09 
 
 		 625 aa  49.7  0.0001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  24.27 
 
 		 563 aa  50.1  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2533  oligopeptidase A  24.48 
 
 		 679 aa  50.1  0.0001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.437216  normal  0.440356 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2934  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.89 
 
 		 689 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.667939  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2629  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.62 
 
 		 714 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0454075  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2743  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.62 
 
 		 714 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.811217 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1720  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.62 
 
 		 714 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.159822  hitchhiker  0.00025314 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2664  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.62 
 
 		 714 aa  48.5  0.0003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.136894  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2844  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.46 
 
 		 716 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.835993  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2863  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.46 
 
 		 716 aa  48.1  0.0004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1225  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  26.09 
 
 		 626 aa  48.1  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.100343  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2992  peptidyl-dipeptidase Dcp  25.46 
 
 		 716 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1514  Peptidyl-dipeptidase Dcp  25.46 
 
 		 716 aa  48.1  0.0005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0465  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.47 
 
 		 671 aa  47.4  0.0007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1301  carboxypeptidase Taq  25.81 
 
 		 507 aa  47  0.001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3142  peptidyl-dipeptidase Dcp  25 
 
 		 716 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0016  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.4 
 
 		 685 aa  46.6  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3564  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.7 
 
 		 716 aa  47  0.001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2508  peptidyl-dipeptidase Dcp  26.48 
 
 		 717 aa  47  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000000673549  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1612  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.33 
 
 		 714 aa  46.6  0.001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.922334  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4065  oligopeptidase A  22.61 
 
 		 679 aa  47  0.001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5185  oligoendopeptidase, M3 family  27.06 
 
 		 580 aa  47  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.554474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3911  oligopeptidase A  20 
 
 		 680 aa  45.8  0.002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3687  Peptidyl-dipeptidase Dcp  24.04 
 
 		 689 aa  45.8  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.115326 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1827  M3 family oligoendopeptidase  23.05 
 
 		 548 aa  46.2  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585252  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0127  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.69 
 
 		 681 aa  45.8  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1841  M3 family oligoendopeptidase  25 
 
 		 563 aa  45.8  0.003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000188451  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3161  peptidyl-dipeptidase Dcp  25 
 
 		 728 aa  45.4  0.003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1355  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.43 
 
 		 716 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0122052 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1420  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.43 
 
 		 716 aa  45.4  0.003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.712278  normal  0.509514 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1408  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.54 
 
 		 716 aa  45.8  0.003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.289641  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03300  hypothetical protein  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.762273  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0217  Oligopeptidase A  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3711  Peptidyl-dipeptidase Dcp  30.09 
 
 		 695 aa  45.1  0.004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4845  oligopeptidase A  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.88545 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3824  oligopeptidase A  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3787  oligopeptidase A  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.894892 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0218  oligopeptidase A  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03347  oligopeptidase A  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.642114  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0758  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.91 
 
 		 695 aa  45.1  0.004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.703412 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3698  oligopeptidase A  21.14 
 
 		 680 aa  45.1  0.004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2040  Oligopeptidase A  28.12 
 
 		 726 aa  44.7  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0328478  hitchhiker  0.00152686 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0124  oligopeptidase A  22.26 
 
 		 679 aa  44.7  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3108  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.26 
 
 		 716 aa  44.7  0.005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1411  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.92 
 
 		 632 aa  44.7  0.005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.249086  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2016  Peptidyl-dipeptidase Dcp  22.04 
 
 		 697 aa  44.3  0.006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0435226  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0067  oligopeptidase A  21.28 
 
 		 683 aa  44.7  0.006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1431  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  26.75 
 
 		 610 aa  44.7  0.006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.838587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0856  oligoendopeptidase, pepF/M3 family  32.19 
 
 		 598 aa  44.3  0.006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2158  Oligopeptidase A  23.4 
 
 		 685 aa  44.3  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1784  M3 family oligoendopeptidase  26.51 
 
 		 548 aa  44.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0212975  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0145  oligopeptidase A  21.48 
 
 		 679 aa  44.3  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.491748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1295  peptidase M3B, oligoendopeptidase-related clade 3  28.4 
 
 		 612 aa  44.3  0.007  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000104369  hitchhiker  0.000569902 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1592  peptidyl-dipeptidase Dcp  24.02 
 
 		 715 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.24522 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4032  Peptidyl-dipeptidase Dcp  21.99 
 
 		 695 aa  43.9  0.008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2212  peptidyl-dipeptidase Dcp  21.17 
 
 		 720 aa  43.9  0.009  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.198958 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3974  peptidase M3B, oligoendopeptidase-like clade 3  27.72 
 
 		 626 aa  43.9  0.009  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.221188  normal  0.896374 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2973  peptidyl-dipeptidase  27.7 
 
 		 673 aa  43.9  0.009  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2852  peptidyl-dipeptidase Dcp  23.42 
 
 		 711 aa  43.9  0.01  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0181  Peptidyl-dipeptidase Dcp  23.21 
 
 		 718 aa  43.9  0.01  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.585787 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>