75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rxyl_3178 on replicon NC_008148
Organism: Rubrobacter xylanophilus DSM 9941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008148  Rxyl_3178  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  100 
 
 		 528 aa  1053    Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0781  hypothetical protein  27.64 
 
 		 504 aa  84  0.000000000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.199341  normal  0.117376 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1180  oligoendopeptidase F-like  24.2 
 
 		 540 aa  82.8  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.539248  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2544  peptidyl-dipeptidase A  23.81 
 
 		 612 aa  81.3  0.00000000000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.174016 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_26975  possible metalloendopeptidase  23.5 
 
 		 624 aa  81.3  0.00000000000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2053  peptidyl-dipeptidase A  23.52 
 
 		 634 aa  79  0.0000000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.10811  normal  0.434811 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2314  peptidase M3A and M3B, thimet/oligopeptidase F  27.82 
 
 		 570 aa  78.6  0.0000000000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1467  peptidyl-dipeptidase A  24.95 
 
 		 617 aa  76.6  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  decreased coverage  0.000834106  normal  0.0509695 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02324  zinc-dependent metallopeptidase  23 
 
 		 606 aa  75.1  0.000000000003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000183943  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1887  peptidyl-dipeptidase A  21.36 
 
 		 613 aa  73.6  0.000000000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.90705  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2057  peptidyl-dipeptidase A  22.98 
 
 		 611 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  decreased coverage  0.0000365175  normal  0.118156 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2396  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  26.06 
 
 		 619 aa  72.8  0.00000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.953299  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2024  peptidyl-dipeptidase A  23.36 
 
 		 614 aa  72.4  0.00000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2881  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.5 
 
 		 622 aa  72.4  0.00000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2117  peptidyl-dipeptidase A  21.33 
 
 		 612 aa  71.6  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.00000679972  n/a   
 
 
-
 
NC_009035  Sbal_4532  hypothetical protein  20.72 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2246  peptidyl-dipeptidase A  20.72 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2170  peptidyl-dipeptidase A  20.72 
 
 		 621 aa  70.9  0.00000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.200935  normal  0.311175 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2051  peptidyl-dipeptidase A  22.45 
 
 		 620 aa  70.1  0.00000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0115163  normal  0.257719 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1468  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.07 
 
 		 618 aa  69.7  0.0000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1854  Peptidyl-dipeptidase A  22.77 
 
 		 614 aa  69.7  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2156  peptidase M2, peptidyl-dipeptidase A  22.45 
 
 		 619 aa  70.1  0.0000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0251377  normal  0.793528 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2125  peptidyl-dipeptidase A  21.37 
 
 		 621 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.061143  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1785  peptidyl-dipeptidase A  25.69 
 
 		 622 aa  68.9  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.44307 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2259  Peptidyl-dipeptidase A  20.72 
 
 		 621 aa  69.3  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205408 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1939  Peptidyl-dipeptidase A  22.77 
 
 		 614 aa  69.3  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1924  peptidyl-dipeptidase A  22.45 
 
 		 620 aa  68.9  0.0000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.000467858  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1817  peptidyl-dipeptidase A  22.52 
 
 		 618 aa  68.2  0.0000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0907882  normal  0.451295 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1581  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  23.95 
 
 		 622 aa  67.8  0.0000000005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.883937  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2494  zinc-dependent metallopeptidase  20.77 
 
 		 619 aa  67.4  0.0000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2340  peptidyl-dipeptidase A  20.68 
 
 		 612 aa  66.6  0.000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.215134  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0184  peptidyl-dipeptidase A  24.41 
 
 		 609 aa  64.3  0.000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2493  peptidase M3A and M3B thimet/oligopeptidase F  24.9 
 
 		 621 aa  64.3  0.000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1585  zinc metallopeptidase family protein  19.75 
 
 		 619 aa  62.4  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.353639  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0604  hypothetical protein  22.76 
 
 		 507 aa  62.4  0.00000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04473  dipeptidyl carboxypeptidase I  28.02 
 
 		 672 aa  61.2  0.00000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.951227  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6422  Peptidyl-dipeptidase A  22.59 
 
 		 621 aa  61.2  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2996  Peptidyl-dipeptidase A  26.89 
 
 		 654 aa  60.8  0.00000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  decreased coverage  0.000459005  normal  0.0414122 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06870  oligopeptidase 1  23.47 
 
 		 615 aa  55.5  0.000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3261  oligoendopeptidase, M3 family  24.69 
 
 		 555 aa  53.9  0.000006  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0456  peptidyl-dipeptidase A  21.56 
 
 		 612 aa  53.9  0.000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1098  carboxypeptidase  26.21 
 
 		 509 aa  53.9  0.000008  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.45111  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1568  putative peptidase  24.63 
 
 		 615 aa  53.5  0.000009  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000239383  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3868  hypothetical protein  30.06 
 
 		 541 aa  52.8  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000887  oligoendopeptidase F  23.08 
 
 		 615 aa  52.8  0.00001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.202971  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2667  peptidyl-dipeptidase A  21.62 
 
 		 620 aa  53.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3784  hypothetical protein  30.06 
 
 		 545 aa  53.1  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0482518  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2583  hypothetical protein  22.55 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2407  hypothetical protein  22.55 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0405022  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2596  hypothetical protein  20.96 
 
 		 563 aa  52.4  0.00002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.10338e-16 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2383  Carboxypeptidase Taq  22.57 
 
 		 500 aa  51.2  0.00005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2771  hypothetical protein  20.96 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.50602  hitchhiker  0.00000000104879 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2554  hypothetical protein  20.96 
 
 		 563 aa  51.2  0.00005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07181  carboxypeptidase Taq (M32) metallopeptidase  26.6 
 
 		 516 aa  50.1  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2831  peptidase M3 family protein  24.88 
 
 		 548 aa  49.3  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000716452 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1920  M3 family oligoendopeptidase  25.55 
 
 		 554 aa  49.3  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.304467  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0069  carboxypeptidase Taq  24.47 
 
 		 490 aa  48.9  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0096  carboxypeptidase Taq  24.07 
 
 		 491 aa  48.5  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.116202  hitchhiker  0.00735546 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3727  hypothetical protein  32.61 
 
 		 544 aa  48.1  0.0004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.620153  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2584  oligoendopeptidase  25.96 
 
 		 548 aa  48.1  0.0004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0258984  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2162  carboxypeptidase Taq  28.38 
 
 		 504 aa  47.4  0.0006  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2853  peptidase M3 family protein  25.85 
 
 		 548 aa  46.2  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.162979  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2361  oligoendopeptidase F  21.05 
 
 		 563 aa  46.2  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000498179  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0755  hypothetical protein  21.05 
 
 		 572 aa  46.2  0.001  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2397  M3 family oligoendopeptidase  20.96 
 
 		 563 aa  45.4  0.002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2874  peptidase M3 family protein  25.48 
 
 		 548 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0132987  n/a   
 
 
-
 
NC_011697  PHATRDRAFT_24006  predicted protein  21.56 
 
 		 749 aa  45.1  0.003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1755  oligoendopeptidase, M3 family  22.64 
 
 		 564 aa  45.1  0.004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2825  peptidase M3 family protein  24.39 
 
 		 548 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2999  peptidase M32, carboxypeptidase Taq metallopeptidase  24.15 
 
 		 501 aa  44.7  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2634  peptidase M3 family protein  24.39 
 
 		 548 aa  44.7  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.052399  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2819  carboxypeptidase Taq  24.06 
 
 		 501 aa  43.9  0.008  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1375  carboxypeptidase  25.17 
 
 		 497 aa  43.9  0.008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0861  oligoendopeptidase, M3 family  21.91 
 
 		 564 aa  43.9  0.008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000179561  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1023  oligoendopeptidase, M3 family  22.22 
 
 		 565 aa  43.5  0.009  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>