82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pars_2136 on replicon NC_009376
Organism: Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  100 
 
 		 442 aa  884    Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  61.01 
 
 		 428 aa  550  1e-155  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  63.93 
 
 		 428 aa  541  1e-153  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  58.55 
 
 		 435 aa  488  1e-136  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  33.8 
 
 		 371 aa  176  9.999999999999999e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.91 
 
 		 454 aa  150  4e-35  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  31.07 
 
 		 414 aa  119  9.999999999999999e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 405 aa  110  7.000000000000001e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 394 aa  103  8e-21  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 400 aa  101  3e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 437 aa  100  5e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  27.89 
 
 		 374 aa  95.5  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  28.17 
 
 		 379 aa  92.4  1e-17  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  27.42 
 
 		 434 aa  92.4  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.22 
 
 		 385 aa  92  2e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.43 
 
 		 397 aa  92  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  24.61 
 
 		 380 aa  91.7  2e-17  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.69 
 
 		 405 aa  91.3  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 401 aa  90.1  7e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 434 aa  87.8  4e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  26.49 
 
 		 390 aa  86.7  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  24.59 
 
 		 378 aa  85.5  0.000000000000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.06 
 
 		 414 aa  83.2  0.000000000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  22.17 
 
 		 421 aa  73.2  0.000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.97 
 
 		 391 aa  67  0.0000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  23.03 
 
 		 411 aa  66.6  0.0000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.55 
 
 		 338 aa  64.7  0.000000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.07 
 
 		 396 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 337 aa  63.2  0.00000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 354 aa  61.2  0.00000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  24.28 
 
 		 304 aa  59.7  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  24.66 
 
 		 318 aa  60.1  0.00000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  22.77 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  22.77 
 
 		 338 aa  58.9  0.0000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  24.11 
 
 		 335 aa  58.2  0.0000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 339 aa  58.2  0.0000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000005  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  25.63 
 
 		 723 aa  57.4  0.0000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  24.78 
 
 		 435 aa  57.4  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1203  putative periplasmic iron siderophore binding protein of ABC transporter  24.46 
 
 		 347 aa  55.8  0.000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 315 aa  55.5  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 315 aa  55.1  0.000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23.21 
 
 		 331 aa  55.1  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  28.57 
 
 		 354 aa  53.9  0.000005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  28.89 
 
 		 289 aa  53.5  0.000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  24.39 
 
 		 363 aa  53.5  0.000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  29.3 
 
 		 271 aa  53.1  0.000009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  29.76 
 
 		 274 aa  53.1  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0029  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 287 aa  52.8  0.00001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  26.91 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.1 
 
 		 354 aa  52.4  0.00002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  22.66 
 
 		 393 aa  52  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3557  periplasmic binding protein  27.83 
 
 		 276 aa  52.4  0.00002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000210628  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 309 aa  51.2  0.00004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  25.79 
 
 		 322 aa  51.2  0.00004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  24.48 
 
 		 351 aa  50.4  0.00006  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  25 
 
 		 682 aa  49.7  0.00009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0166  periplasmic binding protein  26.53 
 
 		 323 aa  49.7  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  34.17 
 
 		 384 aa  48.5  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25 
 
 		 682 aa  48.9  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3024  periplasmic binding protein  23.77 
 
 		 269 aa  48.1  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2350  periplasmic binding protein  27.7 
 
 		 323 aa  47.8  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.048634  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2324  periplasmic binding protein  26.98 
 
 		 288 aa  47.4  0.0005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0524222  normal  0.815768 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.93 
 
 		 483 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  22.52 
 
 		 379 aa  47  0.0007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 318 aa  47  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2879  periplasmic binding protein  23.11 
 
 		 270 aa  46.6  0.0008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1499  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 382 aa  46.2  0.001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2734  periplasmic binding protein  26.58 
 
 		 363 aa  45.8  0.002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.148787  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4203  periplasmic binding protein  29.1 
 
 		 291 aa  45.1  0.003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.564967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27 
 
 		 293 aa  44.7  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  30.48 
 
 		 478 aa  44.3  0.004  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2134  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 296 aa  43.9  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.342061  normal  0.620791 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1056  periplasmic binding protein  22.71 
 
 		 341 aa  43.9  0.006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2307  Iron(III) dicitrate-binding protein  31.1 
 
 		 300 aa  43.5  0.007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0557705  normal  0.931308 
 
 
-
 
NC_002936  DET0250  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  24.39 
 
 		 356 aa  43.5  0.008  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0491648  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  23.53 
 
 		 322 aa  43.1  0.009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5522  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 361 aa  43.1  0.009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.0605852 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  26.11 
 
 		 296 aa  43.1  0.009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1541  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 324 aa  43.1  0.01  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>