52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pisl_1954 on replicon NC_008701
Organism: Pyrobaculum islandicum DSM 4184



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  93.87 
 
 		 428 aa  783    Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  100 
 
 		 428 aa  857    Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  61.01 
 
 		 442 aa  550  1e-155  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  62.92 
 
 		 435 aa  526  1e-148  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  35.77 
 
 		 371 aa  181  2.9999999999999997e-44  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  27.03 
 
 		 454 aa  143  7e-33  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 405 aa  110  3e-23  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 400 aa  110  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  29.74 
 
 		 414 aa  107  3e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 437 aa  102  1e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  29.8 
 
 		 401 aa  97.4  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  27.82 
 
 		 394 aa  97.4  4e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.67 
 
 		 374 aa  95.1  2e-18  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.22 
 
 		 385 aa  92.8  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.96 
 
 		 397 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 390 aa  89.7  9e-17  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  28.46 
 
 		 398 aa  86.3  9e-16  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.54 
 
 		 405 aa  85.5  0.000000000000001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  31.2 
 
 		 414 aa  84.7  0.000000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 434 aa  81.3  0.00000000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  22.8 
 
 		 411 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  26.83 
 
 		 379 aa  80.1  0.00000000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 380 aa  78.6  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  25.14 
 
 		 389 aa  76.6  0.0000000000007  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 434 aa  73.6  0.000000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  22.38 
 
 		 421 aa  72.4  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  29.37 
 
 		 354 aa  68.9  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  22.59 
 
 		 378 aa  68.2  0.0000000003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  27.03 
 
 		 339 aa  63.5  0.000000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.7 
 
 		 391 aa  63.5  0.000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  25.9 
 
 		 435 aa  63.5  0.000000007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.06 
 
 		 396 aa  63.5  0.000000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  28.62 
 
 		 354 aa  62.8  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0840  periplasmic binding protein  26.61 
 
 		 304 aa  56.6  0.0000007  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.62088  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  26.79 
 
 		 318 aa  55.8  0.000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 354 aa  54.3  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1317  periplasmic binding protein  27.35 
 
 		 307 aa  52  0.00002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  25.71 
 
 		 309 aa  51.2  0.00003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.77 
 
 		 379 aa  51.2  0.00004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 322 aa  49.7  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  22.94 
 
 		 335 aa  49.7  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  29.85 
 
 		 293 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  22.31 
 
 		 393 aa  47.4  0.0006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 315 aa  47  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  27.75 
 
 		 296 aa  46.2  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  24.3 
 
 		 305 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.3 
 
 		 305 aa  46.2  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  24 
 
 		 483 aa  44.3  0.005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  26.13 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.2 
 
 		 374 aa  43.1  0.009  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 688 aa  43.1  0.009  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  23.11 
 
 		 402 aa  43.1  0.01  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>