37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mevan_0131 on replicon NC_009634
Organism: Methanococcus vannielii SB



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  100 
 
 		 411 aa  849    Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  52.94 
 
 		 421 aa  461  9.999999999999999e-129  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  31.94 
 
 		 454 aa  194  2e-48  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.45 
 
 		 405 aa  111  2.0000000000000002e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 371 aa  110  6e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  24.54 
 
 		 394 aa  100  6e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 434 aa  93.2  7e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  25.15 
 
 		 434 aa  91.3  3e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  23.64 
 
 		 405 aa  90.5  5e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 400 aa  90.1  6e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  21.36 
 
 		 437 aa  87.4  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  23.63 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  23.62 
 
 		 390 aa  82.4  0.00000000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  22.8 
 
 		 428 aa  80.9  0.00000000000004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  23.72 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  22.93 
 
 		 435 aa  77.8  0.0000000000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  22.5 
 
 		 389 aa  73.6  0.000000000006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  22.91 
 
 		 401 aa  73.6  0.000000000006  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  23.27 
 
 		 397 aa  72.8  0.00000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  27.6 
 
 		 385 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  21.36 
 
 		 414 aa  69.7  0.00000000009  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  21.94 
 
 		 380 aa  68.6  0.0000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  24.16 
 
 		 374 aa  67.8  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  20.06 
 
 		 396 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  23.03 
 
 		 442 aa  66.6  0.0000000008  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  22.98 
 
 		 379 aa  66.2  0.000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  20.69 
 
 		 398 aa  60.8  0.00000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  19.61 
 
 		 393 aa  57.4  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.45 
 
 		 391 aa  54.7  0.000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  24.16 
 
 		 435 aa  48.9  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0988  glycoside hydrolase family 10  54 
 
 		 975 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.661558  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  20.38 
 
 		 335 aa  48.9  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0625  glycoside hydrolase family protein  39.44 
 
 		 710 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2945  putative iron transport system substrate-binding protein  24.02 
 
 		 308 aa  46.2  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3141  substrate-binding protein of ABC transporter  24.29 
 
 		 308 aa  45.1  0.003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  22.22 
 
 		 331 aa  44.3  0.004  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5058  periplasmic binding protein  21.7 
 
 		 331 aa  43.1  0.009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.22765  normal  0.328912 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>