96 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_B0161 on replicon NC_007410
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  100 
 
 		 400 aa  830    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  52.75 
 
 		 434 aa  433  1e-120  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  50.67 
 
 		 434 aa  429  1e-119  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  41.82 
 
 		 390 aa  347  2e-94  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  46.89 
 
 		 394 aa  345  7e-94  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  41.78 
 
 		 401 aa  317  2e-85  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  38.17 
 
 		 437 aa  305  9.000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  41.45 
 
 		 389 aa  303  3.0000000000000004e-81  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  39.18 
 
 		 398 aa  294  2e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  38.9 
 
 		 414 aa  289  6e-77  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  38.57 
 
 		 405 aa  264  2e-69  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  36.23 
 
 		 380 aa  250  3e-65  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  36.45 
 
 		 414 aa  250  3e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  32.66 
 
 		 378 aa  232  1e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  32.28 
 
 		 396 aa  204  3e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.76 
 
 		 397 aa  202  9e-51  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  29.82 
 
 		 391 aa  194  3e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  33.04 
 
 		 379 aa  193  4e-48  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.93 
 
 		 393 aa  189  9e-47  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  31.39 
 
 		 435 aa  171  2e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  29.86 
 
 		 371 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  30.52 
 
 		 435 aa  123  4e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  29.1 
 
 		 454 aa  117  5e-25  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  28.34 
 
 		 428 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  28.48 
 
 		 428 aa  110  5e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  29.2 
 
 		 442 aa  101  3e-20  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.18 
 
 		 405 aa  100  5e-20  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 411 aa  90.1  6e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.64 
 
 		 374 aa  87  5e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  23.12 
 
 		 456 aa  84  0.000000000000004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  26.67 
 
 		 385 aa  80.1  0.00000000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 421 aa  79  0.0000000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.18 
 
 		 335 aa  56.6  0.0000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  24.37 
 
 		 338 aa  56.6  0.0000008  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 318 aa  53.9  0.000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  26.64 
 
 		 296 aa  52.8  0.000009  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 682 aa  52.8  0.00001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 289 aa  52.8  0.00001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  22.63 
 
 		 322 aa  52.8  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  29.25 
 
 		 318 aa  52.4  0.00001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  23.66 
 
 		 337 aa  51.6  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  23.83 
 
 		 682 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  24.2 
 
 		 300 aa  50.8  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  25.09 
 
 		 289 aa  51.2  0.00004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  27.11 
 
 		 293 aa  50.1  0.00006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 299 aa  50.1  0.00007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  27.92 
 
 		 297 aa  50.1  0.00007  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0038  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 292 aa  49.7  0.00009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  unclonable  0.000000039007  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  23.49 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  28.64 
 
 		 318 aa  49.7  0.0001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  23.49 
 
 		 338 aa  49.3  0.0001  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0251  periplasmic binding protein  26.06 
 
 		 369 aa  48.5  0.0002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27076  predicted protein  23.42 
 
 		 505 aa  48.5  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000736705  hitchhiker  0.0000360443 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1789  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  26 
 
 		 268 aa  48.5  0.0002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.26216  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  22.64 
 
 		 310 aa  48.5  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.37 
 
 		 297 aa  48.1  0.0003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  21.95 
 
 		 374 aa  47.4  0.0004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  22.79 
 
 		 354 aa  47.4  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1132  periplasmic binding protein  25.34 
 
 		 378 aa  46.6  0.0007  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0148173  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  22.92 
 
 		 688 aa  46.6  0.0007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0213  putative iron chelate uptake ABC transporter, solute-binding protein  25.62 
 
 		 295 aa  46.6  0.0007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  24.31 
 
 		 309 aa  46.6  0.0007  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  22.43 
 
 		 354 aa  46.6  0.0008  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0229  periplasmic binding protein  23.2 
 
 		 293 aa  46.6  0.0008  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2394  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  27.67 
 
 		 313 aa  46.2  0.001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0672231 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  26.22 
 
 		 271 aa  45.8  0.001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0212  putative ferrichrome ABC transporter periplasmic-binding protein  25.62 
 
 		 295 aa  45.8  0.001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  22.16 
 
 		 689 aa  45.4  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1122  substrate-binding periplasmic (PBP) ABC transporter protein  23.05 
 
 		 287 aa  45.1  0.002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.583002  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0601  periplasmic binding protein  23.32 
 
 		 354 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.56983  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2234  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.63 
 
 		 311 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.281475  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1604  hemin ABC transporter, periplasmic hemin-binding protein, putative  26.8 
 
 		 268 aa  44.3  0.004  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  36.59 
 
 		 409 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  21.82 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  23.29 
 
 		 369 aa  44.3  0.004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3535  periplasmic binding protein  24.55 
 
 		 276 aa  44.3  0.004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.862472 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  22.66 
 
 		 257 aa  44.3  0.004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0090  periplasmic binding protein  27.46 
 
 		 331 aa  43.9  0.005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.479217  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  23.7 
 
 		 321 aa  43.9  0.005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3374  periplasmic binding protein  21.21 
 
 		 278 aa  43.9  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.610729  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1044  hypothetical protein  26.02 
 
 		 397 aa  43.9  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  26.63 
 
 		 377 aa  43.9  0.005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0226  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.34 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0245  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.34 
 
 		 266 aa  43.9  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.168683  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01625  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  28.88 
 
 		 308 aa  43.5  0.006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0229  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.34 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0243  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.34 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0227  vitamin B12-transporter protein BtuF  26.34 
 
 		 262 aa  43.5  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.482155  normal  0.717087 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0606  periplasmic binding protein  28.32 
 
 		 303 aa  43.5  0.006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  28.68 
 
 		 315 aa  43.5  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  24.75 
 
 		 358 aa  43.5  0.007  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2782  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.21111  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0251  periplasmic binding protein  40.43 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1460  periplasmic binding protein  31.96 
 
 		 300 aa  43.1  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.77673  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4079  periplasmic binding protein  26.37 
 
 		 276 aa  43.1  0.01  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000203821  normal  0.165112 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 274 aa  43.1  0.01  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>