35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_5230 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 		 414 aa  830    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  49.74 
 
 		 437 aa  390  1e-107  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  47.7 
 
 		 401 aa  382  1e-105  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  48.04 
 
 		 398 aa  378  1e-103  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  38.04 
 
 		 434 aa  293  3e-78  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  38.9 
 
 		 400 aa  290  3e-77  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  39.07 
 
 		 434 aa  288  1e-76  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  37.32 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  30.81 
 
 		 390 aa  218  2e-55  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  32.57 
 
 		 405 aa  208  1e-52  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  35.91 
 
 		 389 aa  207  3e-52  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  33.05 
 
 		 380 aa  197  4.0000000000000005e-49  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  33.14 
 
 		 414 aa  194  3e-48  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  31.23 
 
 		 378 aa  177  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  27.53 
 
 		 391 aa  153  5e-36  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  30.15 
 
 		 379 aa  149  1.0000000000000001e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  27.01 
 
 		 397 aa  143  5e-33  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  29.38 
 
 		 435 aa  137  3.0000000000000003e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  30.1 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  23.01 
 
 		 393 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.48 
 
 		 396 aa  101  3e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  21.2 
 
 		 454 aa  86.7  7e-16  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  31.2 
 
 		 428 aa  84.7  0.000000000000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  31.62 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 442 aa  83.6  0.000000000000006  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  25.41 
 
 		 435 aa  79.7  0.00000000000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  25.79 
 
 		 405 aa  73.9  0.000000000004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  21.36 
 
 		 411 aa  68.6  0.0000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.6 
 
 		 374 aa  52.4  0.00001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_10170  iron-enterobactin transporter periplasmic binding protein  29.15 
 
 		 301 aa  47  0.0006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00368836  normal  1 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  21.45 
 
 		 456 aa  45.8  0.001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25 
 
 		 305 aa  44.3  0.004  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  26.64 
 
 		 338 aa  44.3  0.004  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.7 
 
 		 385 aa  43.5  0.006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  25.7 
 
 		 305 aa  43.5  0.007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>