31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shel_24460 on replicon NC_013165
Organism: Slackia heliotrinireducens DSM 20476



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  100 
 
 		 405 aa  831    Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 371 aa  159  1e-37  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  28.24 
 
 		 385 aa  145  1e-33  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  28.45 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  28.85 
 
 		 414 aa  108  2e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  26.89 
 
 		 405 aa  108  2e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  27.18 
 
 		 400 aa  100  5e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  29.17 
 
 		 435 aa  94.7  3e-18  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  25.61 
 
 		 394 aa  91.7  2e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  25.69 
 
 		 442 aa  90.9  4e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  24.37 
 
 		 434 aa  86.3  8e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  25.54 
 
 		 428 aa  85.5  0.000000000000001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  24.72 
 
 		 434 aa  83.2  0.000000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  24.79 
 
 		 454 aa  83.2  0.000000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  28.66 
 
 		 398 aa  82.8  0.00000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  24.84 
 
 		 380 aa  79  0.0000000000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 428 aa  76.6  0.0000000000008  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  26.03 
 
 		 401 aa  73.9  0.000000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  24.05 
 
 		 437 aa  73.6  0.000000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  22.67 
 
 		 389 aa  72.8  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 421 aa  71.6  0.00000000002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  23.89 
 
 		 390 aa  70.9  0.00000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  26.84 
 
 		 379 aa  70.5  0.00000000005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25.37 
 
 		 414 aa  69.3  0.0000000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  22.77 
 
 		 374 aa  68.9  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  24.23 
 
 		 435 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.54 
 
 		 397 aa  61.2  0.00000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  26.11 
 
 		 378 aa  58.9  0.0000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.94 
 
 		 393 aa  56.6  0.0000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.52 
 
 		 396 aa  55.8  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  25 
 
 		 391 aa  50.4  0.00005  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>