61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Clim_1003 on replicon NC_010803
Organism: Chlorobium limicola DSM 245



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  100 
 
 		 405 aa  816    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  57.18 
 
 		 414 aa  443  1e-123  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  39.19 
 
 		 390 aa  293  5e-78  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  38.26 
 
 		 389 aa  273  4.0000000000000004e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  35.77 
 
 		 400 aa  266  5e-70  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  40.44 
 
 		 434 aa  244  1.9999999999999999e-63  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  36.44 
 
 		 394 aa  241  1e-62  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  39.62 
 
 		 434 aa  239  9e-62  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  33.15 
 
 		 380 aa  232  1e-59  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  35.74 
 
 		 378 aa  231  2e-59  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  36.36 
 
 		 398 aa  223  4.9999999999999996e-57  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  38.42 
 
 		 401 aa  218  2e-55  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  35.93 
 
 		 437 aa  206  5e-52  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  34.72 
 
 		 414 aa  204  2e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  31.29 
 
 		 391 aa  188  1e-46  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.45 
 
 		 397 aa  181  2e-44  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  32.08 
 
 		 379 aa  171  3e-41  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.49 
 
 		 393 aa  170  5e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.16 
 
 		 396 aa  167  4e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  30.45 
 
 		 371 aa  134  3e-30  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  29.41 
 
 		 435 aa  123  6e-27  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  29.46 
 
 		 428 aa  113  7.000000000000001e-24  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 428 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 442 aa  110  3e-23  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  26.89 
 
 		 405 aa  108  1e-22  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.29 
 
 		 385 aa  95.5  2e-18  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  25 
 
 		 454 aa  94.4  3e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  23.64 
 
 		 411 aa  90.5  4e-17  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  24.53 
 
 		 421 aa  84.3  0.000000000000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  25.2 
 
 		 435 aa  77.4  0.0000000000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.47 
 
 		 374 aa  72  0.00000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  20.57 
 
 		 456 aa  56.6  0.0000008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  27.54 
 
 		 317 aa  55.1  0.000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1115  iron compound ABC transporter, iron-binding protein  25.13 
 
 		 305 aa  52.4  0.00001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1296  iron chelate ABC transporter solute-binding protein  24.61 
 
 		 305 aa  50.4  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.478734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  26.72 
 
 		 299 aa  50.1  0.00006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  27.82 
 
 		 323 aa  49.7  0.00009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2367  periplasmic binding protein  24.44 
 
 		 322 aa  49.3  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  23.2 
 
 		 335 aa  49.3  0.0001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  28 
 
 		 688 aa  48.5  0.0002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0362  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 315 aa  48.5  0.0002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  23.11 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0759  periplasmic binding protein  28.65 
 
 		 358 aa  48.1  0.0003  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00294843  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  27.43 
 
 		 689 aa  48.1  0.0003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  25.65 
 
 		 396 aa  47.4  0.0004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1679  periplasmic binding protein  22.45 
 
 		 363 aa  47.8  0.0004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  25.96 
 
 		 289 aa  47.8  0.0004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2735  putative iron complex transport system substrate-binding protein  32.5 
 
 		 427 aa  46.6  0.0007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0180927  decreased coverage  0.0000609348 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  28.12 
 
 		 358 aa  47  0.0007  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1218  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 358 aa  46.6  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.0017043  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  23.75 
 
 		 339 aa  46.6  0.0008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1151  hypothetical protein  25.52 
 
 		 333 aa  45.1  0.002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4396  periplasmic binding protein  31.85 
 
 		 325 aa  45.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0547  periplasmic binding protein  27.84 
 
 		 359 aa  44.7  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0053  periplasmic binding protein  25.38 
 
 		 298 aa  44.7  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  24.21 
 
 		 293 aa  44.3  0.004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3296  periplasmic binding protein  28 
 
 		 319 aa  43.9  0.005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.155082  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0757  periplasmic binding protein  26.82 
 
 		 273 aa  43.9  0.006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  36.49 
 
 		 339 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  29.7 
 
 		 483 aa  43.5  0.007  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2627  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 301 aa  42.7  0.01  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.358639  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>