45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_0118 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  100 
 
 
454 aa  934    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  35.52 
 
 
421 aa  213  7.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  31.94 
 
 
411 aa  194  2e-48  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  30.75 
 
 
371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  29.91 
 
 
442 aa  150  4e-35  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  30.48 
 
 
435 aa  150  4e-35  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  29.06 
 
 
428 aa  147  4.0000000000000006e-34  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  27.03 
 
 
428 aa  143  7e-33  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  28.92 
 
 
434 aa  126  1e-27  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  26.05 
 
 
380 aa  120  3e-26  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  28.31 
 
 
434 aa  119  9.999999999999999e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  29.1 
 
 
400 aa  117  6e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  27.44 
 
 
394 aa  115  2.0000000000000002e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  26.75 
 
 
414 aa  113  8.000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  28.4 
 
 
390 aa  103  6e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  24.38 
 
 
378 aa  102  2e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  25.41 
 
 
398 aa  100  6e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  24.07 
 
 
437 aa  99.8  1e-19  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.24 
 
 
374 aa  97.1  6e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  25 
 
 
405 aa  94  5e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
389 aa  93.6  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  27.69 
 
 
385 aa  93.2  1e-17  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  26.11 
 
 
401 aa  91.7  2e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  20.92 
 
 
414 aa  87.4  4e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  24.92 
 
 
396 aa  85.1  0.000000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.79 
 
 
405 aa  83.2  0.000000000000009  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  22.57 
 
 
391 aa  78.6  0.0000000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  23.68 
 
 
397 aa  77  0.0000000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  22.15 
 
 
379 aa  70.5  0.00000000006  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  26.27 
 
 
435 aa  70.1  0.00000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  21.47 
 
 
393 aa  67.4  0.0000000006  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal 
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  23.68 
 
 
456 aa  49.7  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  21.79 
 
 
339 aa  46.2  0.001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1591  periplasmic binding protein  23.42 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0970823  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.58 
 
 
379 aa  45.1  0.002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  23.48 
 
 
300 aa  45.1  0.003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2879  cellulosome enzyme, dockerin type I  33.33 
 
 
511 aa  44.7  0.004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.42565  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4636  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.53 
 
 
324 aa  43.1  0.009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.471711  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1754  periplasmic binding protein  24.89 
 
 
318 aa  43.5  0.009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000000128267  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4264  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.53 
 
 
324 aa  43.1  0.009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  22.94 
 
 
315 aa  43.1  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  22.51 
 
 
315 aa  43.1  0.01  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4641  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  23.53 
 
 
324 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4766  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.53 
 
 
324 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00286539  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4424  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  23.53 
 
 
324 aa  43.1  0.01  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000518711  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>