19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_48322 on replicon NC_011685
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  100 
 
 		 456 aa  935    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  26.1 
 
 		 434 aa  101  3e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  26.15 
 
 		 434 aa  96.7  8e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  24.09 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  23.12 
 
 		 400 aa  82.4  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  23.81 
 
 		 390 aa  78.6  0.0000000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27076  predicted protein  26.62 
 
 		 505 aa  69.7  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000736705  hitchhiker  0.0000360443 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  21.83 
 
 		 401 aa  60.1  0.00000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  25.7 
 
 		 435 aa  60.1  0.00000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  20.67 
 
 		 437 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  22.34 
 
 		 389 aa  58.5  0.0000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  22.08 
 
 		 414 aa  57.8  0.0000004  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  20.57 
 
 		 405 aa  56.2  0.000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  21.63 
 
 		 397 aa  54.7  0.000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.68 
 
 		 454 aa  48.9  0.0002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  25.81 
 
 		 378 aa  47.8  0.0004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  21.68 
 
 		 414 aa  46.2  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  24.11 
 
 		 380 aa  45.4  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  18.45 
 
 		 396 aa  43.1  0.01  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>