206 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Adeg_0277 on replicon NC_013385
Organism: Ammonifex degensii KC4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  100 
 
 		 371 aa  752    Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  31.97 
 
 		 385 aa  201  9.999999999999999e-51  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  32.97 
 
 		 374 aa  185  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  35.77 
 
 		 428 aa  181  2.9999999999999997e-44  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  35.26 
 
 		 428 aa  179  7e-44  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  36.11 
 
 		 435 aa  178  2e-43  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  33.8 
 
 		 442 aa  176  7e-43  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.75 
 
 		 454 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  28.72 
 
 		 400 aa  164  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  30.18 
 
 		 390 aa  158  1e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  29.41 
 
 		 405 aa  159  1e-37  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  30.14 
 
 		 434 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  30.84 
 
 		 394 aa  148  1.0000000000000001e-34  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  30.03 
 
 		 434 aa  144  3e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  29.06 
 
 		 389 aa  139  1e-31  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  31.81 
 
 		 414 aa  135  9.999999999999999e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  30 
 
 		 405 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  28.23 
 
 		 397 aa  134  3e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  27.39 
 
 		 380 aa  130  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  31.13 
 
 		 437 aa  128  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  32.34 
 
 		 401 aa  125  9e-28  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  28.11 
 
 		 398 aa  125  1e-27  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  26.61 
 
 		 396 aa  120  3.9999999999999996e-26  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  27.59 
 
 		 379 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  27.2 
 
 		 378 aa  114  2.0000000000000002e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  30.1 
 
 		 414 aa  110  3e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  25.67 
 
 		 411 aa  110  5e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  25.59 
 
 		 421 aa  100  3e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0296  periplasmic binding protein  27.37 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.143105  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  25.29 
 
 		 315 aa  91.3  2e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  25.32 
 
 		 393 aa  89.7  8e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.23 
 
 		 391 aa  79  0.0000000000001  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  24.36 
 
 		 331 aa  77  0.0000000000005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  22.55 
 
 		 335 aa  74.7  0.000000000002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1644  copper amine oxidase domain protein  27.08 
 
 		 483 aa  73.6  0.000000000005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0382967  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  24.52 
 
 		 435 aa  73.2  0.000000000008  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5271  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 274 aa  70.1  0.00000000006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  24.7 
 
 		 379 aa  67.8  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1645  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 354 aa  67.8  0.0000000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.399451  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0560  periplasmic binding protein  24.02 
 
 		 339 aa  67  0.0000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4030  ABC transporter, periplasmic ligand binding protein  23.97 
 
 		 288 aa  65.1  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0135159  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0114  periplasmic binding protein  27.64 
 
 		 271 aa  63.5  0.000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2212  periplasmic binding protein  25.07 
 
 		 318 aa  63.2  0.000000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3249  periplasmic binding protein  22.79 
 
 		 322 aa  62.8  0.000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000036127  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2060  periplasmic binding protein  24.79 
 
 		 309 aa  63.2  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.182535  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4715  periplasmic binding protein  28.86 
 
 		 264 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  25.62 
 
 		 682 aa  62  0.00000002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1216  copper amine oxidase domain-containing protein  25.69 
 
 		 478 aa  61.6  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000673824  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 321 aa  60.1  0.00000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3389  periplasmic binding protein  27.31 
 
 		 350 aa  59.7  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.47835 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2741  periplasmic binding protein  23.41 
 
 		 296 aa  59.7  0.00000007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3315  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.000205912  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2098  periplasmic binding protein  23.65 
 
 		 402 aa  59.3  0.0000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1597  periplasmic binding protein  24 
 
 		 409 aa  58.5  0.0000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.465677  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3324  periplasmic binding protein  27.68 
 
 		 350 aa  58.9  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1995  periplasmic binding protein  25 
 
 		 360 aa  57.4  0.0000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.203895 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  25.87 
 
 		 361 aa  57.8  0.0000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 682 aa  57.4  0.0000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3396  periplasmic binding protein  26.74 
 
 		 350 aa  57.8  0.0000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4146  periplasmic binding protein  24.08 
 
 		 288 aa  57.4  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0746656  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.42 
 
 		 266 aa  57.4  0.0000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1145  periplasmic binding protein  27.13 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.676996  normal  0.936441 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2202  periplasmic binding protein  25.5 
 
 		 318 aa  57.4  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.134078  normal  0.0623252 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1196  putaive vitamin B12 transport protein  23.44 
 
 		 332 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2326  periplasmic binding protein  23.23 
 
 		 346 aa  57  0.0000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.300944 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1041  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.44 
 
 		 310 aa  57  0.0000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.111406  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0416  periplasmic binding protein  24.32 
 
 		 318 aa  56.6  0.0000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0231  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 723 aa  56.6  0.0000006  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.999715  normal  0.640564 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0693  vitamin B12 transport protein BtuF, putative  23.44 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.387352  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3395  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.182926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0444  periplasmic binding protein  24.25 
 
 		 356 aa  56.6  0.0000007  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2320  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.44 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.169217  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2967  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.44 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.956046  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1035  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.44 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.439367  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1632  cobalamin ABC transporter, periplasmic cobalamin-binding protein  23.44 
 
 		 310 aa  56.6  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.41754  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2656  periplasmic binding protein  25 
 
 		 269 aa  56.2  0.0000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0241  periplasmic binding protein  23.27 
 
 		 310 aa  55.8  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.44 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  3.3382899999999997e-20  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0670  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  24.44 
 
 		 321 aa  54.7  0.000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.07774e-37 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2660  periplasmic binding protein  24.9 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.166696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0890  ABC-transporter periplasmic-binding component  27.03 
 
 		 344 aa  55.1  0.000002  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00338938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  26.55 
 
 		 354 aa  55.1  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  26.62 
 
 		 354 aa  55.5  0.000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18990  periplasmic binding protein  28.4 
 
 		 318 aa  55.5  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0760  periplasmic binding protein  21.49 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0777  periplasmic binding protein  21.49 
 
 		 342 aa  55.1  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0525  iron(III) dicitrate ABC transporter, periplasmic protein  24.44 
 
 		 321 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000000268482  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0373  periplasmic binding protein  23.86 
 
 		 723 aa  54.7  0.000003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.390993 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1720  periplasmic binding protein  25 
 
 		 257 aa  54.3  0.000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.740964  normal  0.935147 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1195  periplasmic binding protein  27.27 
 
 		 374 aa  54.7  0.000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0581  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.44 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0000000673134  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0615  iron compound ABC transporter iron compound-binding protein  24.44 
 
 		 321 aa  53.9  0.000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000000282355  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3307  periplasmic binding protein  27.56 
 
 		 357 aa  53.5  0.000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.182474  hitchhiker  0.00128182 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5751  periplasmic binding protein  21.86 
 
 		 313 aa  53.5  0.000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.48327  hitchhiker  0.000000000101276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1547  ligand binding protein  21.51 
 
 		 363 aa  53.1  0.000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1673  ferrichrome-binding periplasmic protein  22.13 
 
 		 353 aa  53.1  0.000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.723004  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3454  periplasmic binding protein  24.69 
 
 		 294 aa  53.1  0.000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0575769  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1593  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 372 aa  52.8  0.000009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0653353  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0467  Fe(III) dicitrate ABC transporter, permease  21.56 
 
 		 384 aa  52.8  0.00001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3341  Fe ABC transporter  23.18 
 
 		 335 aa  52.4  0.00001  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>