80 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2248 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  83.41 
 
 		 434 aa  696    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  100 
 
 		 434 aa  894    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  50.67 
 
 		 400 aa  429  1e-119  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  48.85 
 
 		 394 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  47.14 
 
 		 437 aa  332  7.000000000000001e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  41.64 
 
 		 390 aa  308  8e-83  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  43.96 
 
 		 398 aa  308  1.0000000000000001e-82  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  43.56 
 
 		 401 aa  297  2e-79  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  39.07 
 
 		 414 aa  286  7e-76  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  40.97 
 
 		 389 aa  275  1.0000000000000001e-72  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  38.79 
 
 		 380 aa  258  2e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  38.66 
 
 		 414 aa  257  2e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  40.44 
 
 		 405 aa  244  3e-63  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  33.33 
 
 		 378 aa  235  1.0000000000000001e-60  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  35.82 
 
 		 391 aa  200  5e-50  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  31.23 
 
 		 397 aa  191  2e-47  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  32.65 
 
 		 379 aa  184  3e-45  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  33.19 
 
 		 435 aa  181  2.9999999999999997e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  32.81 
 
 		 396 aa  179  1e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  32.26 
 
 		 393 aa  172  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  30.7 
 
 		 371 aa  143  5e-33  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  28.31 
 
 		 454 aa  119  9.999999999999999e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  28.15 
 
 		 435 aa  103  8e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.79 
 
 		 374 aa  97.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_48322  predicted protein  26.15 
 
 		 456 aa  97.1  6e-19  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  25.08 
 
 		 411 aa  93.2  9e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  24.68 
 
 		 442 aa  87.4  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.3 
 
 		 405 aa  86.7  7e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  23.05 
 
 		 421 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  24.1 
 
 		 428 aa  83.6  0.000000000000006  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  23.38 
 
 		 428 aa  81.3  0.00000000000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  25.74 
 
 		 385 aa  75.9  0.000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1374  MoxR-like ATPases-like  26 
 
 		 331 aa  64.7  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.896938  hitchhiker  0.000595014 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0025  periplasmic binding protein  28.14 
 
 		 289 aa  62.8  0.00000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_27076  predicted protein  24.64 
 
 		 505 aa  57.8  0.0000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.000736705  hitchhiker  0.0000360443 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0867  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 297 aa  56.6  0.0000008  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2363  periplasmic binding protein  26.85 
 
 		 289 aa  56.6  0.0000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0844  periplasmic binding protein  23.99 
 
 		 299 aa  56.2  0.000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0227  periplasmic binding protein  24.42 
 
 		 682 aa  55.1  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0299459  normal  0.536447 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1283  periplasmic binding protein  30.69 
 
 		 409 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.907  normal  0.591849 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0493  periplasmic binding protein  29.44 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.328857 
 
 
-
 
NC_002936  DET0650  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, periplasmic binding protein, putative  25.42 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000661971  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0684  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport system, periplasmic binding protein, putative  25.42 
 
 		 338 aa  54.3  0.000004  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.0151926  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0377  periplasmic binding protein  24.81 
 
 		 682 aa  53.9  0.000005  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.786135  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_588  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, periplasmic component  25.74 
 
 		 338 aa  53.5  0.000007  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000378985  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1578  putative vitamin B12 transport protein  36.96 
 
 		 317 aa  53.5  0.000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1372  hypothetical protein  21.16 
 
 		 335 aa  51.6  0.00002  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000217326 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0978  periplasmic binding protein  23.51 
 
 		 689 aa  51.6  0.00003  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  0.194046 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0059  periplasmic binding protein  24.14 
 
 		 688 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.932595  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0260  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 321 aa  50.8  0.00005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.495398  normal  0.417174 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.28 
 
 		 354 aa  50.4  0.00006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0620  periplasmic binding protein  24.73 
 
 		 337 aa  50.1  0.00007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.0000000216594  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0983  periplasmic binding protein  26.94 
 
 		 351 aa  49.3  0.0001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.750238  normal  0.171605 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0555  periplasmic binding protein  26.16 
 
 		 317 aa  49.3  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1424  periplasmic binding protein  25.1 
 
 		 374 aa  49.3  0.0002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.813522  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0661  periplasmic binding protein  24.18 
 
 		 300 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1662  hypothetical protein  51.72 
 
 		 416 aa  47.8  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0038  periplasmic binding protein  26.09 
 
 		 293 aa  47.4  0.0005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000608499  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0409  periplasmic binding protein  27.01 
 
 		 375 aa  46.6  0.0008  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.14115  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0257  periplasmic binding protein  23.17 
 
 		 296 aa  46.6  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000185774  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1934  periplasmic binding protein  24.91 
 
 		 315 aa  46.2  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0138  periplasmic binding protein  26.04 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.5 
 
 		 354 aa  45.8  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3896  periplasmic binding protein  27.36 
 
 		 263 aa  45.8  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00316656  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1466  periplasmic binding protein  23.78 
 
 		 369 aa  45.1  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0440112  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0972  periplasmic binding protein  23.87 
 
 		 429 aa  44.7  0.003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21280  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  24.37 
 
 		 336 aa  45.1  0.003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.318454 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1099  periplasmic binding protein  34.57 
 
 		 296 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.576505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1596  periplasmic binding protein  25 
 
 		 339 aa  44.3  0.004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.691704  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1056  hypothetical protein  25.84 
 
 		 265 aa  44.7  0.004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0428  periplasmic binding protein  25.24 
 
 		 375 aa  44.3  0.005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0735  periplasmic binding protein  29.82 
 
 		 358 aa  43.9  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000243949  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06845  predicted ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  21.84 
 
 		 266 aa  43.9  0.006  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0226932  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_11530  hypothetical protein  23.78 
 
 		 265 aa  43.9  0.006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2146  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  26.52 
 
 		 297 aa  43.5  0.007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.543136  normal  0.254057 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0388  periplasmic binding protein  26.73 
 
 		 396 aa  43.5  0.007  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1421  periplasmic binding protein  20.97 
 
 		 379 aa  43.5  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1015  periplasmic binding protein  34.94 
 
 		 296 aa  43.1  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1430  periplasmic binding protein  22.89 
 
 		 300 aa  43.1  0.009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4685  iron compound ABC transporter, iron compound-binding protein  34.65 
 
 		 322 aa  43.1  0.01  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0132289  hitchhiker  2.7045999999999996e-21 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>