33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Paes_1296 on replicon NC_011059
Organism: Prosthecochloris aestuarii DSM 271



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  100 
 
 
393 aa  819    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  60.11 
 
 
396 aa  466  9.999999999999999e-131  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  36.39 
 
 
397 aa  261  1e-68  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  28.93 
 
 
400 aa  193  4e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  30.13 
 
 
390 aa  188  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  32.55 
 
 
434 aa  179  1e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  31.38 
 
 
434 aa  177  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  30.47 
 
 
394 aa  176  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  30.46 
 
 
414 aa  172  6.999999999999999e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  31.13 
 
 
405 aa  170  3e-41  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  28.01 
 
 
389 aa  160  4e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  26.2 
 
 
380 aa  154  2e-36  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  25.51 
 
 
378 aa  137  3.0000000000000003e-31  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  25.66 
 
 
398 aa  130  4.0000000000000003e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  27.37 
 
 
379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  24.29 
 
 
437 aa  119  7.999999999999999e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  25.64 
 
 
401 aa  119  9.999999999999999e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG0648  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  24.27 
 
 
391 aa  115  1.0000000000000001e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.515203 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.8 
 
 
414 aa  110  4.0000000000000004e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  25.24 
 
 
371 aa  95.9  1e-18  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2110  periplasmic binding protein  24.23 
 
 
435 aa  87.8  3e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.529465  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  21.02 
 
 
421 aa  76.3  0.0000000000008  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  24.84 
 
 
374 aa  75.5  0.000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  21.47 
 
 
454 aa  69.3  0.0000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  27.42 
 
 
405 aa  61.2  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  19.61 
 
 
411 aa  60.5  0.00000006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  22.66 
 
 
442 aa  58.2  0.0000003  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  22.06 
 
 
435 aa  54.7  0.000003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1148  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.76 
 
 
304 aa  52.4  0.00001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.998455  normal  0.564215 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  23.02 
 
 
428 aa  51.6  0.00002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  22.31 
 
 
428 aa  50.8  0.00004  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1007  iron-compound ABC transporter, iron-compound-binding protein  22.9 
 
 
342 aa  48.1  0.0002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00224248  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  20.98 
 
 
385 aa  48.5  0.0002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>