32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TDE0748 on replicon NC_002967
Organism: Treponema denticola ATCC 35405



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002967  TDE0748  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein, putative  100 
 
 		 385 aa  782    Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0277  periplasmic binding protein  32.76 
 
 		 371 aa  198  1.0000000000000001e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0800726  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_24460  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system, periplasmic component  28.24 
 
 		 405 aa  145  1e-33  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1519  periplasmic binding protein  25.64 
 
 		 435 aa  107  4e-22  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    unclonable  0.0000000000588293 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1256  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  23.42 
 
 		 374 aa  104  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5372  periplasmic binding protein  24.48 
 
 		 390 aa  93.2  6e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0118  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  27.69 
 
 		 454 aa  93.2  8e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1954  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 428 aa  92.8  9e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0336724  hitchhiker  2.0036600000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1299  periplasmic binding protein  22.95 
 
 		 414 aa  92.8  1e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1003  periplasmic binding protein  25 
 
 		 405 aa  92.4  1e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0182612  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2136  periplasmic binding protein  24.22 
 
 		 442 aa  92  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1093  periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 428 aa  87  4e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  decreased coverage  0.00000816511  hitchhiker  0.00387756 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0161  periplasmic binding protein  26.67 
 
 		 400 aa  80.1  0.00000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2248  periplasmic binding protein  25.74 
 
 		 434 aa  76.3  0.0000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226593  normal  0.029127 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3086  periplasmic binding protein  25.77 
 
 		 434 aa  75.5  0.000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.074128 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0131  periplasmic binding protein  27.6 
 
 		 411 aa  72  0.00000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.400899  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0277  periplasmic binding protein  23.3 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.035667  normal  0.0566476 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3541  periplasmic binding protein  23.93 
 
 		 398 aa  65.5  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3336  periplasmic binding protein  21.22 
 
 		 389 aa  64.7  0.000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12513  periplasmic-binding protein of ABC transporter  22.13 
 
 		 378 aa  63.9  0.000000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1024  putative iron complex transport system substrate-binding protein  23.62 
 
 		 397 aa  62.8  0.00000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264421  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0670  putative lipoprotein  20.45 
 
 		 379 aa  57.8  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.174257 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0083  periplasmic binding protein  23 
 
 		 380 aa  57.4  0.0000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.622653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0344  periplasmic binding protein  23.1 
 
 		 437 aa  53.9  0.000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1006  putative iron complex transport system substrate-binding protein  21.67 
 
 		 396 aa  50.4  0.00006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.568283  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1042  periplasmic binding protein  24.64 
 
 		 354 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3498  periplasmic binding protein  24.03 
 
 		 401 aa  48.5  0.0002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.194312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1185  periplasmic binding protein  25.36 
 
 		 354 aa  47.4  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.306422  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5230  ABC-type Fe3+-hydroxamate transport system periplasmic component-like protein  20.7 
 
 		 414 aa  44.7  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1296  putative iron complex transport system substrate-binding protein  21.89 
 
 		 393 aa  43.9  0.005  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.220074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0111  periplasmic binding protein  21.55 
 
 		 421 aa  43.5  0.006  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0528  periplasmic binding protein  23.68 
 
 		 361 aa  42.7  0.01  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.147263  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>