More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_74317 on replicon NC_009068
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05406  DNA topoisomerase 2 (EC 5.99.1.3) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59864]  50.24 
 
 		 1709 aa  1219    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0595729  normal  0.152073 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41836  predicted protein  49.14 
 
 		 1292 aa  1155    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107242  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03600  DNA topoisomerase II, putative  54.83 
 
 		 1272 aa  1316    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488595  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13581  predicted protein  39.67 
 
 		 1165 aa  833    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52174  predicted protein  46.42 
 
 		 1143 aa  1031    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338516  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74317  DNA topoisomerase II  100 
 
 		 1439 aa  2952    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  26.77 
 
 		 637 aa  167  2.0000000000000002e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2978  DNA topoisomerase IV subunit B  25.04 
 
 		 684 aa  166  3e-39  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.141952 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  26.24 
 
 		 626 aa  166  3e-39  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2484  DNA topoisomerase IV subunit B  25.04 
 
 		 684 aa  165  6e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.185915 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1328  DNA topoisomerase IV subunit B  26.76 
 
 		 672 aa  164  1e-38  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.070173  normal  0.202878 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  27.6 
 
 		 679 aa  162  4e-38  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0612  DNA topoisomerase IV subunit B  26.75 
 
 		 629 aa  161  1e-37  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0564  DNA topoisomerase IV subunit B  27.2 
 
 		 629 aa  161  1e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82908  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  24.96 
 
 		 682 aa  160  1e-37  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  25.43 
 
 		 684 aa  161  1e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.34 
 
 		 641 aa  159  3e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  26.03 
 
 		 626 aa  159  3e-37  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65660  DNA topoisomerase IV subunit B  24.77 
 
 		 629 aa  159  3e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  26.44 
 
 		 626 aa  159  4e-37  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5696  DNA topoisomerase IV subunit B  24.62 
 
 		 629 aa  159  4e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3980  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 687 aa  159  5.0000000000000005e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  25.08 
 
 		 629 aa  158  6e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  27.13 
 
 		 635 aa  158  8e-37  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4176  DNA topoisomerase IV subunit B  24.92 
 
 		 628 aa  157  1e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599957  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  25.85 
 
 		 686 aa  157  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43480  DNA topoisomerase IV subunit B  24.54 
 
 		 630 aa  157  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  25.81 
 
 		 701 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  24.57 
 
 		 631 aa  156  2.9999999999999998e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  26.69 
 
 		 814 aa  156  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2827  DNA topoisomerase IV subunit B  25.16 
 
 		 685 aa  156  2.9999999999999998e-36  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.116959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0551  DNA topoisomerase IV subunit B  24.1 
 
 		 634 aa  155  5e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  25.3 
 
 		 678 aa  155  5e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4963  DNA topoisomerase IV, B subunit  24.53 
 
 		 634 aa  155  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  25.64 
 
 		 685 aa  155  5.9999999999999996e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  25.12 
 
 		 631 aa  154  8e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  27.2 
 
 		 634 aa  155  8e-36  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2509  DNA gyrase, B subunit  26.76 
 
 		 815 aa  154  8.999999999999999e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  24.88 
 
 		 640 aa  154  8.999999999999999e-36  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0499  DNA topoisomerase IV subunit B  24.81 
 
 		 635 aa  154  1e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  24.46 
 
 		 683 aa  154  1e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  24.73 
 
 		 628 aa  154  1e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  25.94 
 
 		 631 aa  154  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0604  DNA topoisomerase IV subunit B  24.53 
 
 		 632 aa  154  2e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2317  DNA topoisomerase IV subunit B  24.85 
 
 		 683 aa  153  2e-35  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  28.43 
 
 		 650 aa  153  2e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  25.64 
 
 		 647 aa  153  3e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  25.08 
 
 		 815 aa  152  4e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0749  DNA topoisomerase IV subunit B  27.26 
 
 		 654 aa  152  5e-35  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.120428  normal  0.923958 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1664  DNA topoisomerase IV subunit B  28.19 
 
 		 661 aa  152  5e-35  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2800  DNA gyrase, B subunit  25.3 
 
 		 815 aa  152  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376674  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  24.06 
 
 		 628 aa  152  6e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  28.71 
 
 		 640 aa  151  8e-35  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4791  DNA topoisomerase IV subunit B  24.07 
 
 		 634 aa  151  8e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.543353  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  23.89 
 
 		 631 aa  151  9e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2526  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2208  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0694  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1653  DNA topoisomerase IV subunit B  24.64 
 
 		 685 aa  151  1.0000000000000001e-34  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.0034  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1300  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0940  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  150  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0156854  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1145  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0778193  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1137  DNA topoisomerase IV subunit B  26.87 
 
 		 660 aa  151  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802508  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  23.71 
 
 		 631 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  23.71 
 
 		 631 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4915  DNA topoisomerase IV subunit B  24.07 
 
 		 634 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4707  DNA topoisomerase IV subunit B  23.92 
 
 		 634 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.590641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2559  DNA topoisomerase IV subunit B  27.01 
 
 		 659 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  23.71 
 
 		 631 aa  150  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  25.69 
 
 		 630 aa  149  3e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00177  DNA topoisomerase IV subunit B  24.8 
 
 		 629 aa  149  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771486  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2710  DNA topoisomerase IV subunit B  26.66 
 
 		 665 aa  149  4.0000000000000006e-34  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.24442  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2544  DNA topoisomerase IV subunit B  24.27 
 
 		 626 aa  149  4.0000000000000006e-34  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1065  DNA topoisomerase IV subunit B  27.93 
 
 		 644 aa  149  4.0000000000000006e-34  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0137081  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  24.42 
 
 		 630 aa  149  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  24.42 
 
 		 630 aa  149  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  26.59 
 
 		 646 aa  149  5e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  24.42 
 
 		 630 aa  149  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  24.42 
 
 		 630 aa  149  5e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0004  DNA gyrase, B subunit  27.78 
 
 		 810 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3428  DNA topoisomerase IV subunit B  28.21 
 
 		 665 aa  148  7.0000000000000006e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2768  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  24.46 
 
 		 650 aa  148  7.0000000000000006e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  24.42 
 
 		 630 aa  148  8.000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  26.2 
 
 		 632 aa  148  8.000000000000001e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1199  DNA topoisomerase IV subunit B  27.66 
 
 		 659 aa  148  8.000000000000001e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1215  DNA topoisomerase IV subunit B  24.96 
 
 		 691 aa  148  9e-34  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.518041 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3327  DNA topoisomerase IV subunit B  25.27 
 
 		 628 aa  148  9e-34  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.603705  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  26.76 
 
 		 636 aa  147  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  24.55 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  24.22 
 
 		 628 aa  147  1e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3354  DNA topoisomerase IV subunit B  25.47 
 
 		 629 aa  147  1e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.778526  normal  0.0858286 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  23.72 
 
 		 631 aa  147  2e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  24.71 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0900  DNA topoisomerase IV subunit B  24.96 
 
 		 662 aa  147  2e-33  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  26.67 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  23.66 
 
 		 630 aa  147  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0435  DNA topoisomerase IV subunit B  23.91 
 
 		 629 aa  147  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4968  DNA topoisomerase IV subunit B  23.69 
 
 		 634 aa  147  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.713463  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  25.71 
 
 		 699 aa  146  3e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>