More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OSTLU_41836 on replicon NC_009367
Organism: Ostreococcus lucimarinus CCE9901



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05406  DNA topoisomerase 2 (EC 5.99.1.3) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59864]  48.95 
 
 		 1709 aa  1108    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0595729  normal  0.152073 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03600  DNA topoisomerase II, putative  55.84 
 
 		 1272 aa  1310    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488595  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74317  DNA topoisomerase II  48.68 
 
 		 1439 aa  1147    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13581  predicted protein  46.25 
 
 		 1165 aa  988    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52174  predicted protein  51.04 
 
 		 1143 aa  1145    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338516  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41836  predicted protein  100 
 
 		 1292 aa  2684    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107242  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2544  DNA topoisomerase IV subunit B  27.14 
 
 		 626 aa  169  2.9999999999999998e-40  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  26.04 
 
 		 636 aa  163  2e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  26.91 
 
 		 636 aa  163  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  26.55 
 
 		 635 aa  161  7e-38  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  28.23 
 
 		 629 aa  159  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0004  DNA gyrase subunit B  28.22 
 
 		 803 aa  158  7e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428577  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  25.67 
 
 		 630 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  25.67 
 
 		 630 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  25.67 
 
 		 630 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  25.67 
 
 		 630 aa  157  9e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  27.43 
 
 		 637 aa  157  9e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  25.67 
 
 		 630 aa  157  1e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  27.23 
 
 		 632 aa  157  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 630 aa  156  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  25.84 
 
 		 631 aa  157  2e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1753  DNA topoisomerase IV, B subunit  26.7 
 
 		 638 aa  156  2e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 630 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  26.33 
 
 		 630 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 630 aa  156  2.9999999999999998e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 630 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  29.08 
 
 		 633 aa  156  2.9999999999999998e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  26.33 
 
 		 630 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 630 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  26.33 
 
 		 630 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2768  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  24.74 
 
 		 650 aa  155  5e-36  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 631 aa  155  5.9999999999999996e-36  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  26.84 
 
 		 636 aa  154  8e-36  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  25.53 
 
 		 628 aa  154  8.999999999999999e-36  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  26.17 
 
 		 630 aa  154  1e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2043  DNA topoisomerase IV subunit B  26.67 
 
 		 641 aa  154  1e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  26.75 
 
 		 659 aa  154  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  27.1 
 
 		 804 aa  153  2e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  26.75 
 
 		 645 aa  154  2e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  27.51 
 
 		 804 aa  152  3e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  27.51 
 
 		 804 aa  152  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  25.93 
 
 		 654 aa  152  3e-35  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03526  hypothetical protein  27.51 
 
 		 804 aa  152  3e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  27.51 
 
 		 804 aa  152  3e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  27.51 
 
 		 804 aa  152  3e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  27.51 
 
 		 804 aa  152  3e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  27.08 
 
 		 813 aa  152  4e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  27.73 
 
 		 804 aa  152  4e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5127  DNA gyrase subunit B  27.91 
 
 		 805 aa  152  4e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.271851 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  27.82 
 
 		 643 aa  152  4e-35  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  26.34 
 
 		 628 aa  152  5e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0947  DNA topoisomerase IV subunit B  26.05 
 
 		 630 aa  151  6e-35  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.798803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  27.51 
 
 		 633 aa  151  6e-35  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  26.61 
 
 		 651 aa  151  7e-35  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00177  DNA topoisomerase IV subunit B  27.79 
 
 		 629 aa  151  7e-35  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771486  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00006  DNA gyrase subunit B  27.82 
 
 		 806 aa  151  7e-35  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00261354  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  26.98 
 
 		 804 aa  151  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4176  DNA topoisomerase IV subunit B  26.77 
 
 		 628 aa  151  9e-35  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599957  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  26.98 
 
 		 804 aa  151  9e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  26.05 
 
 		 626 aa  151  9e-35  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  26.98 
 
 		 804 aa  151  9e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2094  DNA topoisomerase IV subunit B  27.93 
 
 		 628 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.104639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2414  DNA topoisomerase IV subunit B  27.65 
 
 		 628 aa  150  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.752872 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  26.66 
 
 		 644 aa  150  1.0000000000000001e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4047  DNA gyrase subunit B  27.8 
 
 		 804 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4227  DNA gyrase subunit B  27.8 
 
 		 804 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4063  DNA gyrase subunit B  27.8 
 
 		 804 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795543  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  27.48 
 
 		 649 aa  150  2.0000000000000003e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  27.8 
 
 		 804 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4169  DNA gyrase subunit B  27.8 
 
 		 804 aa  150  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.994459  normal  0.269221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0004  DNA gyrase subunit B  27.29 
 
 		 803 aa  150  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  28.23 
 
 		 786 aa  149  2.0000000000000003e-34  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2867  DNA topoisomerase IV subunit B  26.2 
 
 		 707 aa  149  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.018602 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0623  DNA gyrase subunit B  27.97 
 
 		 650 aa  149  4.0000000000000006e-34  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00302751  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  25.67 
 
 		 631 aa  149  4.0000000000000006e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0599  DNA topoisomerase IV subunit B  25.2 
 
 		 630 aa  149  4.0000000000000006e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3443  DNA topoisomerase IV subunit B  25.76 
 
 		 630 aa  149  4.0000000000000006e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.211337 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  25.24 
 
 		 626 aa  148  5e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  26.96 
 
 		 637 aa  148  6e-34  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  27.45 
 
 		 643 aa  148  7.0000000000000006e-34  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0746  DNA topoisomerase IV subunit B  26.34 
 
 		 626 aa  148  8.000000000000001e-34  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0010  DNA gyrase, B subunit  27.47 
 
 		 644 aa  147  9e-34  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000291276  normal  0.113655 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  25.48 
 
 		 628 aa  147  1e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0820  DNA topoisomerase IV subunit B  25.76 
 
 		 628 aa  147  1e-33  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.676318  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  26.97 
 
 		 647 aa  147  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  25.96 
 
 		 631 aa  147  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  25.96 
 
 		 631 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0499  DNA topoisomerase IV subunit B  26.11 
 
 		 635 aa  147  1e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0029  DNA gyrase, B subunit  26.82 
 
 		 637 aa  147  1e-33  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.65 
 
 		 641 aa  147  1e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2255  DNA topoisomerase IV subunit B  28.25 
 
 		 629 aa  147  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0005  DNA gyrase, B subunit  26.19 
 
 		 884 aa  147  1e-33  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000126845  hitchhiker  0.0000000317646 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  25.04 
 
 		 684 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  25.96 
 
 		 631 aa  147  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2509  DNA gyrase, B subunit  28.41 
 
 		 815 aa  146  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0727  DNA topoisomerase IV subunit B  26.34 
 
 		 626 aa  146  2e-33  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  25.58 
 
 		 636 aa  146  2e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43480  DNA topoisomerase IV subunit B  26.44 
 
 		 630 aa  147  2e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0004  DNA gyrase subunit B  27.99 
 
 		 804 aa  146  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.083955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  25.56 
 
 		 636 aa  147  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>