More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNA03600 on replicon NC_006670
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05406  DNA topoisomerase 2 (EC 5.99.1.3) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59864]  54.91 
 
 		 1709 aa  1289    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0595729  normal  0.152073 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03600  DNA topoisomerase II, putative  100 
 
 		 1272 aa  2633    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488595  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13581  predicted protein  42.03 
 
 		 1165 aa  866    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74317  DNA topoisomerase II  54.06 
 
 		 1439 aa  1323    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52174  predicted protein  52.63 
 
 		 1143 aa  1169    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338516  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41836  predicted protein  55.95 
 
 		 1292 aa  1319    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107242  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  26.87 
 
 		 636 aa  169  2e-40  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  26.57 
 
 		 636 aa  168  5.9999999999999996e-40  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  28.89 
 
 		 642 aa  167  2.0000000000000002e-39  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  28.59 
 
 		 654 aa  166  3e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  27.49 
 
 		 650 aa  165  4.0000000000000004e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  27.18 
 
 		 637 aa  166  4.0000000000000004e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  28.4 
 
 		 654 aa  166  4.0000000000000004e-39  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  28.37 
 
 		 635 aa  164  7e-39  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  26.02 
 
 		 635 aa  164  1e-38  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1609  DNA topoisomerase IV subunit B  28.08 
 
 		 654 aa  164  1e-38  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.00000967673  decreased coverage  0.000000000000694445 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  26.5 
 
 		 628 aa  164  1e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  28.24 
 
 		 634 aa  163  2e-38  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  27.33 
 
 		 636 aa  163  2e-38  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  27.96 
 
 		 637 aa  162  3e-38  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  27.29 
 
 		 655 aa  162  4e-38  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  28.19 
 
 		 644 aa  162  4e-38  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  27.7 
 
 		 649 aa  162  4e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4352  DNA topoisomerase IV subunit B  26.5 
 
 		 682 aa  162  5e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.494271  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3706  DNA topoisomerase IV subunit B  27.93 
 
 		 654 aa  162  5e-38  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000176643  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  28.44 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  28.44 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  28.44 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  28.44 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  28.44 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4757  DNA topoisomerase IV subunit B  26.58 
 
 		 678 aa  160  1e-37  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.125119 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  28.44 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  27.36 
 
 		 655 aa  160  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  28.44 
 
 		 654 aa  160  1e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  25.18 
 
 		 692 aa  160  1e-37  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  28.53 
 
 		 633 aa  160  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0004  DNA gyrase, B subunit  27.66 
 
 		 807 aa  159  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0620606  hitchhiker  0.000000000288479 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  27.05 
 
 		 632 aa  159  3e-37  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  27.09 
 
 		 627 aa  159  3e-37  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0557  DNA topoisomerase IV subunit B  26.19 
 
 		 680 aa  159  3e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0591  DNA topoisomerase IV subunit B  26.27 
 
 		 699 aa  159  4e-37  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  28.67 
 
 		 808 aa  158  5.0000000000000005e-37  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  26.51 
 
 		 701 aa  158  6e-37  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002620  TC0462  DNA gyrase subunit B  29.62 
 
 		 804 aa  158  6e-37  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  26.11 
 
 		 684 aa  158  8e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1062  DNA topoisomerase IV subunit B  25.75 
 
 		 686 aa  157  1e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.388156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  28.61 
 
 		 666 aa  157  1e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  25.48 
 
 		 686 aa  157  1e-36  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  26.51 
 
 		 685 aa  157  1e-36  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  26.42 
 
 		 634 aa  157  1e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  26.83 
 
 		 640 aa  157  1e-36  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  27.61 
 
 		 655 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  26.73 
 
 		 655 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5127  DNA gyrase subunit B  27.56 
 
 		 805 aa  156  2e-36  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.50645  normal  0.271851 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  26.38 
 
 		 666 aa  157  2e-36  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0442115  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  27.3 
 
 		 805 aa  156  2e-36  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3250  DNA topoisomerase IV subunit B  28.01 
 
 		 679 aa  156  2e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.629772  normal  0.680031 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0004  DNA gyrase, B subunit  27.76 
 
 		 802 aa  157  2e-36  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03582  DNA gyrase subunit B  27.56 
 
 		 804 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0004  DNA gyrase, B subunit  27.56 
 
 		 804 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4064  DNA gyrase subunit B  27.56 
 
 		 804 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0861092  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  27.83 
 
 		 806 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03526  hypothetical protein  27.56 
 
 		 804 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0004  DNA gyrase, B subunit  27.39 
 
 		 802 aa  156  2.9999999999999998e-36  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  26.87 
 
 		 648 aa  156  2.9999999999999998e-36  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0004  DNA gyrase, B subunit  27.57 
 
 		 795 aa  156  2.9999999999999998e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.158205  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0004  DNA gyrase subunit B  27.56 
 
 		 804 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.873229  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  27.01 
 
 		 641 aa  156  2.9999999999999998e-36  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4209  DNA gyrase subunit B  27.56 
 
 		 804 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00242077  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3912  DNA gyrase subunit B  27.56 
 
 		 804 aa  156  2.9999999999999998e-36  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.139583  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  26.38 
 
 		 678 aa  155  2.9999999999999998e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  26.53 
 
 		 655 aa  156  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00050  DNA gyrase subunit B  28.02 
 
 		 806 aa  155  4e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4226  DNA gyrase subunit B  27.56 
 
 		 804 aa  155  4e-36  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.765134  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  27.8 
 
 		 796 aa  155  4e-36  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4063  DNA gyrase subunit B  27.99 
 
 		 804 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.795543  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4120  DNA gyrase subunit B  27.99 
 
 		 804 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4227  DNA gyrase subunit B  27.99 
 
 		 804 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4047  DNA gyrase subunit B  27.99 
 
 		 804 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4169  DNA gyrase subunit B  27.99 
 
 		 804 aa  155  5.9999999999999996e-36  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.994459  normal  0.269221 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0004  DNA gyrase subunit B  28.12 
 
 		 803 aa  155  7e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  26.87 
 
 		 640 aa  154  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  27.13 
 
 		 674 aa  154  7e-36  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  28.83 
 
 		 645 aa  154  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  27.64 
 
 		 806 aa  154  8e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  26.24 
 
 		 645 aa  154  8e-36  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  25.72 
 
 		 675 aa  154  8e-36  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  27.64 
 
 		 806 aa  154  8e-36  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0004  DNA gyrase subunit B  27.64 
 
 		 803 aa  154  8e-36  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.428577  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  26.73 
 
 		 813 aa  154  1e-35  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  27.92 
 
 		 651 aa  154  1e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0004  DNA gyrase subunit B  27.64 
 
 		 806 aa  154  1e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727488  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  27.56 
 
 		 796 aa  154  1e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  25.85 
 
 		 636 aa  153  2e-35  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2765  DNA topoisomerase IV subunit B  26.61 
 
 		 683 aa  153  2e-35  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.170843  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2043  DNA topoisomerase IV subunit B  25.85 
 
 		 641 aa  153  2e-35  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2768  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.01 
 
 		 650 aa  153  2e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  26.37 
 
 		 647 aa  153  2e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  29.26 
 
 		 674 aa  153  2e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  27.06 
 
 		 804 aa  153  2e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>