More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene ANIA_05406 on replicon BN001305
Organism: Aspergillus nidulans FGSC A4



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001305  ANIA_05406  DNA topoisomerase 2 (EC 5.99.1.3) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59864]  100 
 
 
1709 aa  3506    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0595729  normal  0.152073 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03600  DNA topoisomerase II, putative  55.6 
 
 
1272 aa  1290    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488595  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13581  predicted protein  39.44 
 
 
1165 aa  810    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52174  predicted protein  47.16 
 
 
1143 aa  1038    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338516  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74317  DNA topoisomerase II  49.38 
 
 
1439 aa  1223    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303106  normal 
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41836  predicted protein  49.91 
 
 
1292 aa  1117    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107242  normal 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2768  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.76 
 
 
650 aa  150  2.0000000000000003e-34  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0319  DNA gyrase, B subunit  27.53 
 
 
814 aa  150  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3554  DNA topoisomerase IV subunit B  26.28 
 
 
632 aa  149  3e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.31863  normal  0.0483936 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  28.55 
 
 
786 aa  146  3e-33  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0004  DNA gyrase subunit B  26.35 
 
 
813 aa  145  5e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.0791906 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  27.66 
 
 
636 aa  144  9.999999999999999e-33  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  26.42 
 
 
636 aa  144  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2972  DNA gyrase, B subunit  28.41 
 
 
858 aa  142  7e-32  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0506352 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3310  DNA gyrase subunit B  27.75 
 
 
835 aa  140  2e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0004  DNA gyrase subunit B  25.79 
 
 
813 aa  140  2e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0771659  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0005  DNA gyrase subunit B  25.96 
 
 
813 aa  140  3.0000000000000003e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.974369 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4174  DNA gyrase subunit B  26.14 
 
 
804 aa  139  5e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.274174  normal  0.0336166 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0004  DNA gyrase subunit B  26.14 
 
 
804 aa  139  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0005  DNA gyrase subunit B  26.62 
 
 
813 aa  139  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0004  DNA gyrase subunit B  26.19 
 
 
813 aa  139  5e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4150  DNA gyrase subunit B  26.14 
 
 
804 aa  139  5e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0128391  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0035  DNA gyrase subunit B  26.47 
 
 
804 aa  139  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.373833  normal  0.195519 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0004  DNA gyrase, B subunit  28.21 
 
 
801 aa  138  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0231697  decreased coverage  0.000608059 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0003  DNA gyrase, B subunit  28.21 
 
 
800 aa  139  7.000000000000001e-31  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0004  DNA gyrase subunit B  26.28 
 
 
813 aa  138  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  25.87 
 
 
649 aa  137  9.999999999999999e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  25.61 
 
 
654 aa  138  9.999999999999999e-31  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  27.21 
 
 
650 aa  138  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  24.64 
 
 
636 aa  137  9.999999999999999e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0041  DNA gyrase, B subunit  27.18 
 
 
634 aa  138  9.999999999999999e-31  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2509  DNA gyrase, B subunit  27.76 
 
 
815 aa  137  9.999999999999999e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.684538 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  26.77 
 
 
649 aa  137  9.999999999999999e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0004  DNA gyrase, B subunit  27.46 
 
 
818 aa  137  1.9999999999999998e-30  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.215685  normal  0.853499 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2043  DNA topoisomerase IV subunit B  24.84 
 
 
641 aa  137  1.9999999999999998e-30  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1905  DNA gyrase, B subunit  28.65 
 
 
821 aa  136  3e-30  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.222448 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.61 
 
 
641 aa  136  3e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0005  DNA gyrase subunit B  26.15 
 
 
804 aa  137  3e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.645478  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0004  DNA gyrase subunit B  25.76 
 
 
805 aa  136  3.9999999999999996e-30  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2800  DNA gyrase, B subunit  27.24 
 
 
815 aa  136  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.376674  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2577  DNA gyrase, B subunit  27.24 
 
 
815 aa  135  6e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0788764  normal  0.769823 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3220  DNA gyrase subunit B  26.12 
 
 
811 aa  135  6e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  26.21 
 
 
643 aa  135  6.999999999999999e-30  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0004  DNA gyrase, B subunit  26.42 
 
 
810 aa  135  7.999999999999999e-30  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.311816 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  26.86 
 
 
655 aa  135  7.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1753  DNA topoisomerase IV, B subunit  24.14 
 
 
638 aa  134  1.0000000000000001e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl006  DNA gyrase subunit B  26.77 
 
 
635 aa  134  1.0000000000000001e-29  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0004  DNA gyrase subunit B  26.41 
 
 
805 aa  134  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000624139  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0006  DNA gyrase subunit B  27.17 
 
 
811 aa  134  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000311968 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  26.96 
 
 
627 aa  134  1.0000000000000001e-29  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00177  DNA topoisomerase IV subunit B  25.52 
 
 
629 aa  134  2.0000000000000002e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.771486  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  25.32 
 
 
629 aa  134  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1224  DNA gyrase, B subunit  27.93 
 
 
807 aa  134  2.0000000000000002e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.060887  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  24.27 
 
 
631 aa  133  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0819  DNA gyrase, B subunit  27.39 
 
 
817 aa  133  3e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.829459  normal  0.98352 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0006  DNA gyrase subunit B  27.14 
 
 
812 aa  133  3e-29  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  26.3 
 
 
644 aa  132  4.0000000000000003e-29  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5333  DNA gyrase, B subunit  26.76 
 
 
808 aa  132  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.248882  normal  0.0644472 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  25.34 
 
 
796 aa  132  5.0000000000000004e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2689  DNA gyrase, B subunit  26.33 
 
 
808 aa  132  5.0000000000000004e-29  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000692964  decreased coverage  0.000240377 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0976  DNA topoisomerase IV subunit B  24.77 
 
 
661 aa  132  6e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00669448  normal  0.174537 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0004  DNA gyrase subunit B  25.78 
 
 
806 aa  132  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727488  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0006  DNA gyrase subunit B  25.45 
 
 
806 aa  132  7.000000000000001e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  26.28 
 
 
650 aa  132  7.000000000000001e-29  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3355  DNA gyrase subunit B  26.49 
 
 
805 aa  132  7.000000000000001e-29  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.784759 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  25.62 
 
 
655 aa  132  8.000000000000001e-29  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0004  DNA gyrase subunit B  25.93 
 
 
805 aa  132  8.000000000000001e-29  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.477519 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  25.76 
 
 
642 aa  131  9.000000000000001e-29  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  25.35 
 
 
637 aa  130  1.0000000000000001e-28  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  26.48 
 
 
674 aa  131  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1346  DNA gyrase subunit B  27.68 
 
 
811 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.427072  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0015  DNA gyrase subunit B  27.68 
 
 
811 aa  130  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0013  DNA gyrase subunit B  25.27 
 
 
806 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.571026  unclonable  0.0000003087 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4176  DNA topoisomerase IV subunit B  25.27 
 
 
628 aa  130  2.0000000000000002e-28  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.599957  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  24.25 
 
 
631 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03685  DNA topoisomerase IV subunit B  24.29 
 
 
631 aa  130  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  25.54 
 
 
658 aa  130  2.0000000000000002e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5854  DNA gyrase, B subunit  26.47 
 
 
808 aa  130  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  25.64 
 
 
642 aa  130  2.0000000000000002e-28  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  25.96 
 
 
644 aa  130  2.0000000000000002e-28  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0004  DNA gyrase subunit B  25.27 
 
 
806 aa  130  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.045671  normal  0.178752 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  24.4 
 
 
635 aa  130  3e-28  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0004  DNA gyrase, B subunit  25.59 
 
 
796 aa  130  3e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0004  DNA gyrase, B subunit  26.28 
 
 
807 aa  130  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0012  DNA gyrase, B subunit  25.67 
 
 
813 aa  130  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00964713  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0612  DNA topoisomerase IV subunit B  24.76 
 
 
629 aa  130  3e-28  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0564  DNA topoisomerase IV subunit B  24.76 
 
 
629 aa  130  3e-28  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82908  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0012  DNA gyrase subunit B  25 
 
 
805 aa  129  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.100397  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03480  DNA gyrase subunit B  25.55 
 
 
814 aa  129  4.0000000000000003e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0095  DNA gyrase, B subunit  25.65 
 
 
814 aa  129  4.0000000000000003e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0142901  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  25.41 
 
 
634 aa  129  4.0000000000000003e-28  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  27.11 
 
 
642 aa  129  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3946  DNA gyrase subunit B  25.19 
 
 
811 aa  129  4.0000000000000003e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.273076  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  25.75 
 
 
643 aa  129  4.0000000000000003e-28  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0004  DNA gyrase, B subunit  25.52 
 
 
821 aa  129  4.0000000000000003e-28  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0899  DNA topoisomerase IV subunit B  24.42 
 
 
692 aa  129  4.0000000000000003e-28  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.712246  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2094  DNA topoisomerase IV subunit B  24.96 
 
 
628 aa  129  5e-28  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.104639  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0009  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  25.6 
 
 
813 aa  129  5e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.983538  hitchhiker  0.00000000705515 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0013  DNA gyrase subunit B  25.19 
 
 
811 aa  129  5e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  26.77 
 
 
644 aa  129  6e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>