More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_52174 on replicon NC_011680
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
BN001305  ANIA_05406  DNA topoisomerase 2 (EC 5.99.1.3) [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59864]  47.16 
 
 		 1709 aa  1033    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0595729  normal  0.152073 
 
 
-
 
NC_006670  CNA03600  DNA topoisomerase II, putative  52.46 
 
 		 1272 aa  1166    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0488595  n/a   
 
 
-
 
NC_009367  OSTLU_41836  predicted protein  51.04 
 
 		 1292 aa  1155    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.107242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_13581  predicted protein  42.52 
 
 		 1165 aa  893    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_52174  predicted protein  100 
 
 		 1143 aa  2355    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.338516  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_74317  DNA topoisomerase II  46.13 
 
 		 1439 aa  1027    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.303106  normal  1 
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2768  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  27.96 
 
 		 650 aa  174  6.999999999999999e-42  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  27.19 
 
 		 645 aa  167  8e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  24.89 
 
 		 649 aa  163  2e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1622  DNA gyrase, B subunit  27.16 
 
 		 786 aa  161  7e-38  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  25.15 
 
 		 646 aa  160  1e-37  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2996  DNA gyrase, B subunit  27.65 
 
 		 666 aa  160  2e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.39538  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.13 
 
 		 633 aa  159  2e-37  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  25.66 
 
 		 637 aa  159  3e-37  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  25.92 
 
 		 642 aa  159  3e-37  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  24.48 
 
 		 628 aa  158  5.0000000000000005e-37  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  27.71 
 
 		 643 aa  157  1e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  27.17 
 
 		 655 aa  157  1e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2173  DNA topoisomerase IV subunit B  26.24 
 
 		 678 aa  156  2e-36  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  27.07 
 
 		 649 aa  156  2e-36  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  25.67 
 
 		 636 aa  155  2.9999999999999998e-36  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  24.43 
 
 		 636 aa  155  4e-36  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  25.27 
 
 		 648 aa  155  5e-36  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  24.43 
 
 		 636 aa  154  7e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  25.43 
 
 		 633 aa  154  8.999999999999999e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  26.01 
 
 		 644 aa  154  1e-35  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  26.76 
 
 		 658 aa  153  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2278  DNA topoisomerase IV subunit B  25.6 
 
 		 660 aa  152  3e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0782  DNA topoisomerase IV subunit B  25.81 
 
 		 674 aa  152  4e-35  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000186449  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3440  DNA topoisomerase IV subunit B  26.62 
 
 		 685 aa  152  5e-35  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.910743 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0442  DNA gyrase, B subunit  26.66 
 
 		 634 aa  152  5e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  26.55 
 
 		 652 aa  152  5e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  24.78 
 
 		 656 aa  152  5e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3119  DNA topoisomerase IV subunit B  26.62 
 
 		 701 aa  151  6e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3316  DNA topoisomerase IV subunit B  26.94 
 
 		 647 aa  151  7e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.492562  normal  0.69961 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1026  DNA topoisomerase IV subunit B  28.8 
 
 		 674 aa  151  7e-35  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2794  DNA topoisomerase IV subunit B  25.19 
 
 		 631 aa  151  7e-35  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197709  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  26.07 
 
 		 632 aa  150  9e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  26.28 
 
 		 641 aa  150  1.0000000000000001e-34  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0004  DNA gyrase, B subunit  25.92 
 
 		 821 aa  150  1.0000000000000001e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2381  DNA topoisomerase IV subunit B  25.51 
 
 		 660 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  26.67 
 
 		 627 aa  149  2.0000000000000003e-34  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1748  DNA topoisomerase IV subunit B  25.51 
 
 		 660 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2360  DNA topoisomerase IV subunit B  25.51 
 
 		 660 aa  150  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  26.89 
 
 		 643 aa  150  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3355  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 654 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000033182  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3304  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 654 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418623  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3608  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 654 aa  149  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  8.88333e-33 
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  26.05 
 
 		 654 aa  148  5e-34  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2247  DNA topoisomerase IV subunit B  26.29 
 
 		 654 aa  148  5e-34  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000227299  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3392  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 654 aa  148  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00614907  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3657  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 654 aa  148  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.0000134084  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  25.44 
 
 		 655 aa  148  6e-34  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3617  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 654 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000282926  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3624  DNA topoisomerase IV subunit B  26 
 
 		 654 aa  148  7.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.0000000439989  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  25.89 
 
 		 635 aa  147  8.000000000000001e-34  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  26.47 
 
 		 659 aa  147  8.000000000000001e-34  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2396  DNA topoisomerase IV subunit B  25.45 
 
 		 660 aa  147  8.000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  23.93 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  23.93 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  23.93 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3307  DNA topoisomerase IV subunit B  26.5 
 
 		 684 aa  147  1e-33  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  23.93 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0919  DNA topoisomerase IV subunit B  25.07 
 
 		 660 aa  147  1e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0180456 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  25.83 
 
 		 647 aa  147  1e-33  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  23.93 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  23.93 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  23.93 
 
 		 630 aa  147  1e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  23.93 
 
 		 630 aa  146  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  27.08 
 
 		 772 aa  146  2e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  24.44 
 
 		 634 aa  146  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  25.76 
 
 		 655 aa  147  2e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  25.89 
 
 		 655 aa  146  2e-33  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  25.68 
 
 		 651 aa  145  3e-33  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5699  DNA topoisomerase IV subunit B  25.22 
 
 		 660 aa  145  3e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  23.85 
 
 		 644 aa  146  3e-33  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3285  DNA topoisomerase IV subunit B  26.96 
 
 		 654 aa  145  3e-33  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.014971  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2559  DNA topoisomerase IV subunit B  26.09 
 
 		 659 aa  145  3e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  27.14 
 
 		 650 aa  145  4e-33  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  23.76 
 
 		 630 aa  145  4e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0004  DNA gyrase, B subunit  26.73 
 
 		 796 aa  145  4e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.783567 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  25.33 
 
 		 644 aa  145  5e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  24.59 
 
 		 651 aa  145  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1003  DNA topoisomerase IV subunit B  26.31 
 
 		 686 aa  145  6e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.674809  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  25.86 
 
 		 660 aa  145  6e-33  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  25.3 
 
 		 650 aa  145  6e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_00040  DNA gyrase subunit B  25.65 
 
 		 806 aa  144  7e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  24.59 
 
 		 630 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  24.59 
 
 		 630 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0087  DNA gyrase subunit B  27.29 
 
 		 650 aa  144  8e-33  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  24.59 
 
 		 630 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  24.59 
 
 		 630 aa  144  8e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3339  DNA topoisomerase IV subunit B  25.64 
 
 		 661 aa  144  9e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0006  DNA gyrase, B subunit  26.08 
 
 		 871 aa  144  9e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.44586  hitchhiker  0.00403609 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1740  DNA topoisomerase IV subunit B  26.18 
 
 		 669 aa  144  9e-33  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  decreased coverage  0.00895559  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  24.71 
 
 		 641 aa  144  9e-33  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  25.22 
 
 		 644 aa  143  9.999999999999999e-33  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  25.34 
 
 		 675 aa  144  9.999999999999999e-33  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  24.59 
 
 		 630 aa  144  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2558  DNA topoisomerase IV subunit B  25.79 
 
 		 645 aa  143  1.9999999999999998e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>