More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene TK90_2768 on replicon NC_013930
Organism: Thioalkalivibrio sp. K90mix



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013930  TK90_2768  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  100 
 
 		 650 aa  1335    Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1393  DNA gyrase, B subunit  47.02 
 
 		 628 aa  561  1e-158  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1702  DNA gyrase, B subunit  46.34 
 
 		 654 aa  553  1e-156  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.118209 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2717  DNA gyrase, B subunit  45.63 
 
 		 649 aa  552  1e-156  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1044  DNA gyrase, B subunit  44.74 
 
 		 675 aa  550  1e-155  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.248456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0006  DNA gyrase, B subunit  45.75 
 
 		 650 aa  546  1e-154  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.00000273734  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0094  DNA gyrase, B subunit  44.17 
 
 		 636 aa  543  1e-153  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000363706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0005  DNA gyrase subunit B  45.45 
 
 		 644 aa  543  1e-153  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.375435  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0094  DNA gyrase, B subunit  44.01 
 
 		 636 aa  544  1e-153  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000129942  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0005  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.84 
 
 		 633 aa  539  9.999999999999999e-153  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0419  DNA gyrase subunit B  45.33 
 
 		 632 aa  536  1e-151  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11740  DNA gyrase, B subunit  45.09 
 
 		 637 aa  533  1e-150  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00171708  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0132  DNA gyrase, B subunit  44.24 
 
 		 637 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.312038  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1213  DNA gyrase subunit B  44.56 
 
 		 655 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_00050  DNA gyrase subunit B  44.62 
 
 		 645 aa  529  1e-149  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0377504  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06825  DNA gyrase subunit B  43.03 
 
 		 645 aa  530  1e-149  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1048  DNA gyrase, B subunit  42.77 
 
 		 665 aa  531  1e-149  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.903378  normal  0.436385 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0130  DNA gyrase, B subunit  45.78 
 
 		 636 aa  529  1e-149  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.95821  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_20881  DNA gyrase subunit B  44.26 
 
 		 655 aa  530  1e-149  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0006  DNA gyrase, B subunit  44.7 
 
 		 648 aa  528  1e-148  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  unclonable  0.000000466462  hitchhiker  0.000000932752 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0051  DNA gyrase, B subunit  46.17 
 
 		 640 aa  523  1e-147  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0133  DNA gyrase subunit B  44.89 
 
 		 655 aa  524  1e-147  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.879154  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1407  DNA gyrase, B subunit  44.74 
 
 		 656 aa  523  1e-147  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.68269  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2254  DNA gyrase, B subunit  43.83 
 
 		 646 aa  523  1e-147  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0005  DNA gyrase, B subunit  44.77 
 
 		 635 aa  522  1e-147  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1547  DNA gyrase, B subunit  45.3 
 
 		 635 aa  519  1e-146  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.00189026  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_18251  DNA gyrase subunit B  43.53 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_18231  DNA gyrase subunit B  43.28 
 
 		 655 aa  520  1e-146  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.654486  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2376  DNA gyrase subunit B  45.5 
 
 		 641 aa  521  1e-146  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_17611  DNA gyrase subunit B  43.88 
 
 		 658 aa  516  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.616229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2805  DNA gyrase subunit B  44.69 
 
 		 633 aa  518  1.0000000000000001e-145  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.035041  hitchhiker  0.00161489 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2271  DNA gyrase, B subunit  44.88 
 
 		 644 aa  517  1.0000000000000001e-145  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0087  DNA gyrase subunit B  45.11 
 
 		 655 aa  518  1.0000000000000001e-145  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4986  DNA gyrase, B subunit  44.31 
 
 		 651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.639656  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0007  DNA gyrase subunit B  44.84 
 
 		 640 aa  515  1.0000000000000001e-145  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.630363  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0306  DNA gyrase, B subunit  45.17 
 
 		 643 aa  516  1.0000000000000001e-145  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.337431  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_18441  DNA gyrase subunit B  43.07 
 
 		 655 aa  517  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.768958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_01571  DNA gyrase subunit B  44.89 
 
 		 655 aa  518  1.0000000000000001e-145  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1109  hypothetical protein  43.25 
 
 		 651 aa  512  1e-144  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.432981 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2729  DNA gyrase, B subunit  44.96 
 
 		 641 aa  514  1e-144  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.739794  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1727  DNA gyrase subunit B  42.47 
 
 		 655 aa  513  1e-144  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.22827  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0015  DNA gyrase, B subunit  44.15 
 
 		 644 aa  513  1e-144  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000155334 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0009  DNA gyrase subunit B  44.38 
 
 		 633 aa  514  1e-144  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000695632  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0335  DNA gyrase, B subunit  45 
 
 		 645 aa  510  1e-143  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.457317 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0006  DNA gyrase subunit B  46.36 
 
 		 661 aa  512  1e-143  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.60604  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0007  DNA gyrase, B subunit  44.19 
 
 		 642 aa  511  1e-143  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000235506  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0403  DNA gyrase, B subunit  43.4 
 
 		 659 aa  511  1e-143  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0412  DNA gyrase subunit B  42.9 
 
 		 651 aa  509  1e-143  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  decreased coverage  0.000264952  decreased coverage  0.0001901 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0820  DNA gyrase, B subunit  43.94 
 
 		 644 aa  508  9.999999999999999e-143  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.929877  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00050  DNA gyrase subunit B  43.41 
 
 		 648 aa  506  9.999999999999999e-143  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.000300089  hitchhiker  0.00265407 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2491  DNA gyrase subunit B  46.42 
 
 		 645 aa  507  9.999999999999999e-143  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00434823 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0007  DNA gyrase, B subunit  42.41 
 
 		 634 aa  508  9.999999999999999e-143  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000328066  unclonable  0.0000000130354 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1413  DNA gyrase subunit B  43.67 
 
 		 652 aa  508  9.999999999999999e-143  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.805897  normal  0.136461 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0671  DNA gyrase, B subunit  43.71 
 
 		 627 aa  506  9.999999999999999e-143  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.958816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0984  DNA gyrase subunit B  46.17 
 
 		 651 aa  508  9.999999999999999e-143  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1453  DNA gyrase, B subunit  43.75 
 
 		 658 aa  508  9.999999999999999e-143  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0966  DNA gyrase, B subunit  43.67 
 
 		 650 aa  503  1e-141  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0006  DNA gyrase, B subunit  44.77 
 
 		 649 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0995  DNA gyrase, B subunit  44.96 
 
 		 645 aa  505  1e-141  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0005  DNA gyrase, B subunit  46.15 
 
 		 636 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0007  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.48 
 
 		 647 aa  501  1e-140  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2748  DNA gyrase, B subunit  41.52 
 
 		 637 aa  501  1e-140  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000339515  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0177  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  42.97 
 
 		 641 aa  502  1e-140  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.724108  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0862  DNA gyrase, B subunit  43.96 
 
 		 652 aa  501  1e-140  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00557988 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0006  DNA gyrase B subunit  43.77 
 
 		 656 aa  499  1e-140  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.381905 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0015  DNA gyrase, B subunit  43.26 
 
 		 644 aa  500  1e-140  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000401037  normal  0.862842 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3685  DNA gyrase, B subunit  42.02 
 
 		 636 aa  498  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.50658  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0005  DNA gyrase subunit B  44.57 
 
 		 649 aa  497  1e-139  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0005  DNA gyrase, B subunit  43.61 
 
 		 642 aa  498  1e-139  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0006  DNA gyrase, B subunit  45.2 
 
 		 645 aa  497  1e-139  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.0161215 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1260  DNA gyrase, B subunit  42.08 
 
 		 660 aa  497  1e-139  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf800  DNA gyrase subunit B  42.7 
 
 		 647 aa  498  1e-139  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0006  DNA gyrase, B subunit  43.28 
 
 		 647 aa  496  1e-139  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0546  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.95 
 
 		 711 aa  498  1e-139  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  decreased coverage  0.0000277761  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0005  DNA gyrase, B subunit  43.65 
 
 		 644 aa  498  1e-139  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00336478  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0005  DNA gyrase subunit B  44.84 
 
 		 640 aa  496  1e-139  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0004  DNA gyrase subunit B  44.39 
 
 		 642 aa  498  1e-139  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00060  DNA gyrase, B subunit  44.62 
 
 		 642 aa  498  1e-139  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0036  DNA gyrase subunit B  43.45 
 
 		 643 aa  498  1e-139  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0008  DNA gyrase, B subunit  44.58 
 
 		 719 aa  496  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.107754  hitchhiker  0.00597045 
 
 
-
 
NC_002936  DET0004  DNA gyrase, B subunit  43.5 
 
 		 642 aa  493  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0005  DNA gyrase, B subunit  43.19 
 
 		 633 aa  493  9.999999999999999e-139  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0006  DNA gyrase subunit B  45.02 
 
 		 647 aa  493  9.999999999999999e-139  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.195447  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0006  DNA gyrase, B subunit  43.55 
 
 		 635 aa  495  9.999999999999999e-139  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.98095 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_4  DNA gyrase, B subunit  43.57 
 
 		 642 aa  492  9.999999999999999e-139  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2816  DNA gyrase subunit B  45.02 
 
 		 645 aa  494  9.999999999999999e-139  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0322238  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0005  DNA gyrase subunit B  44.65 
 
 		 640 aa  493  9.999999999999999e-139  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00215329  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5315  DNA gyrase subunit B  44.74 
 
 		 640 aa  494  9.999999999999999e-139  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.021698  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2993  DNA gyrase subunit B  44.01 
 
 		 645 aa  495  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0016  DNA gyrase, B subunit  43.78 
 
 		 649 aa  494  9.999999999999999e-139  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00028541  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1273  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.91 
 
 		 648 aa  495  9.999999999999999e-139  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.804783  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0007  DNA gyrase, B subunit  44.74 
 
 		 648 aa  493  9.999999999999999e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000647413 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0005  DNA gyrase subunit B  44.27 
 
 		 640 aa  490  1e-137  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2927  DNA topoisomerase (ATP-hydrolyzing)  44.44 
 
 		 643 aa  489  1e-137  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.192259 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0003  DNA gyrase subunit B  45.77 
 
 		 772 aa  490  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1282  DNA gyrase subunit B  44.69 
 
 		 641 aa  492  1e-137  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0015  DNA gyrase, B subunit  43.49 
 
 		 643 aa  491  1e-137  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00473367  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0005  DNA gyrase subunit B  44.27 
 
 		 640 aa  489  1e-137  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.204678  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0005  DNA gyrase subunit B  44.27 
 
 		 640 aa  489  1e-137  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0006  DNA gyrase, B subunit  42.88 
 
 		 642 aa  491  1e-137  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.965796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>