More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0900 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010084  Bmul_0919  DNA topoisomerase IV subunit B  75.9 
 
 		 660 aa  1052    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0180456 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0976  DNA topoisomerase IV subunit B  77.73 
 
 		 661 aa  1057    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.00669448  normal  0.174537 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0829  DNA topoisomerase IV subunit B  79.21 
 
 		 661 aa  1078    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.849515  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5085  DNA topoisomerase IV subunit B  71.65 
 
 		 660 aa  958    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0556284  normal  0.0388476 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2208  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2928  DNA topoisomerase IV subunit B  62.18 
 
 		 662 aa  815    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1867  DNA topoisomerase IV subunit B  57.55 
 
 		 662 aa  754    Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.0719699  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2358  DNA topoisomerase IV subunit B  79.09 
 
 		 663 aa  1063    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00684569  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1205  DNA topoisomerase IV subunit B  75.49 
 
 		 661 aa  1040    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1300  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.317996  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2635  DNA topoisomerase IV subunit B  71.19 
 
 		 658 aa  975    Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5699  DNA topoisomerase IV subunit B  75 
 
 		 660 aa  1039    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2526  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0941  DNA topoisomerase IV subunit B  94.71 
 
 		 662 aa  1291    Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0900  DNA topoisomerase IV subunit B  79.51 
 
 		 661 aa  1081    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.573565  normal  0.687535 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0940  DNA topoisomerase IV subunit B  75.45 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0156854  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2278  DNA topoisomerase IV subunit B  75 
 
 		 660 aa  1040    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2642  DNA topoisomerase IV subunit B  72.05 
 
 		 656 aa  964    Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482586  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1694  DNA topoisomerase IV subunit B  54.6 
 
 		 656 aa  709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.505047  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3165  DNA topoisomerase IV subunit B  74.43 
 
 		 659 aa  989    Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.229588 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3339  DNA topoisomerase IV subunit B  75.19 
 
 		 661 aa  1035    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2544  DNA topoisomerase IV subunit B  51.75 
 
 		 626 aa  637    Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2381  DNA topoisomerase IV subunit B  75.3 
 
 		 660 aa  1046    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2521  DNA topoisomerase IV subunit B  78.52 
 
 		 690 aa  1033    Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.504609  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2124  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 661 aa  1045    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.275267 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1748  DNA topoisomerase IV subunit B  75.3 
 
 		 660 aa  1046    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0900  DNA topoisomerase IV subunit B  100 
 
 		 662 aa  1356    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2086  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2396  DNA topoisomerase IV subunit B  75 
 
 		 660 aa  1042    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2559  DNA topoisomerase IV subunit B  72.44 
 
 		 659 aa  989    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2029  DNA topoisomerase IV subunit B  54.6 
 
 		 656 aa  709    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1137  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.802508  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1145  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0778193  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2360  DNA topoisomerase IV subunit B  75.3 
 
 		 660 aa  1046    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0928  DNA topoisomerase IV subunit B  72.92 
 
 		 660 aa  965    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.449359  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3428  DNA topoisomerase IV subunit B  72.88 
 
 		 665 aa  981    Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.920156  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2794  DNA topoisomerase IV subunit B  51.54 
 
 		 631 aa  636    Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.197709  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1340  DNA topoisomerase IV subunit B  71.65 
 
 		 660 aa  949    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.205803  normal  0.718893 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1199  DNA topoisomerase IV subunit B  73.85 
 
 		 659 aa  978    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1014  DNA topoisomerase IV subunit B  72.92 
 
 		 660 aa  965    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0694  DNA topoisomerase IV subunit B  75.6 
 
 		 660 aa  1048    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1664  DNA topoisomerase IV subunit B  73.09 
 
 		 661 aa  983    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.306618 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0319  DNA topoisomerase IV subunit B  49.47 
 
 		 631 aa  632  1e-180  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0328  DNA topoisomerase IV subunit B  49.47 
 
 		 631 aa  632  1e-180  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.934863  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0730  DNA topoisomerase IV subunit B  49.62 
 
 		 628 aa  632  1e-180  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000493764 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2101  DNA topoisomerase IV, B subunit  51.15 
 
 		 628 aa  630  1e-179  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.846279 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0364  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 		 628 aa  631  1e-179  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0435  DNA topoisomerase IV subunit B  48.93 
 
 		 629 aa  628  1e-179  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.636054  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2123  DNA topoisomerase IV subunit B  50.53 
 
 		 640 aa  631  1e-179  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.59022  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3614  DNA topoisomerase IV subunit B  49.32 
 
 		 631 aa  631  1e-179  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0549  DNA topoisomerase IV subunit B  50 
 
 		 628 aa  625  1e-178  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.249219 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4190  DNA topoisomerase IV subunit B  48.77 
 
 		 631 aa  625  1e-178  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.218544 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0578  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 631 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03685  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 631 aa  623  1e-177  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3432  DNA topoisomerase IV subunit B  48.78 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0374  DNA topoisomerase IV subunit B  49.69 
 
 		 631 aa  622  1e-177  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0659  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 631 aa  623  1e-177  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.59712  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3534  DNA topoisomerase IV subunit B  48.78 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3772  DNA topoisomerase IV subunit B  49.16 
 
 		 631 aa  622  1e-177  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0279  DNA topoisomerase IV subunit B  49.09 
 
 		 631 aa  623  1e-177  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3362  DNA topoisomerase IV subunit B  48.78 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.967466  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3439  DNA topoisomerase IV subunit B  48.78 
 
 		 630 aa  623  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.909016  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0132  DNA topoisomerase IV subunit B  48.05 
 
 		 636 aa  620  1e-176  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000115849  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4263  DNA topoisomerase IV subunit B  48.93 
 
 		 631 aa  621  1e-176  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00013039 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3558  DNA topoisomerase IV subunit B  48.24 
 
 		 631 aa  620  1e-176  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.236932  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3367  DNA topoisomerase IV subunit B  48.78 
 
 		 630 aa  621  1e-176  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00875  DNA topoisomerase IV subunit B  48.86 
 
 		 626 aa  621  1e-176  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3231  DNA topoisomerase IV subunit B  49.46 
 
 		 628 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.821467  hitchhiker  0.00000484218 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0758  DNA topoisomerase IV subunit B  49.46 
 
 		 628 aa  619  1e-176  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.220488  hitchhiker  0.00186834 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2043  DNA topoisomerase IV subunit B  48.05 
 
 		 641 aa  619  1e-176  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02902  DNA topoisomerase IV subunit B  48.63 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0670  DNA topoisomerase IV, B subunit  48.63 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43480  DNA topoisomerase IV subunit B  50.08 
 
 		 630 aa  615  1e-175  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0820  DNA topoisomerase IV subunit B  49.85 
 
 		 628 aa  618  1e-175  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.676318  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3899  DNA topoisomerase IV subunit B  49.16 
 
 		 628 aa  616  1e-175  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3494  DNA topoisomerase IV subunit B  48.63 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3208  DNA topoisomerase IV subunit B  48.63 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02852  hypothetical protein  48.63 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3325  DNA topoisomerase IV subunit B  48.48 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.707036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4344  DNA topoisomerase IV subunit B  48.63 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0667  DNA topoisomerase IV subunit B  48.63 
 
 		 630 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.428879  decreased coverage  0.00919443 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65660  DNA topoisomerase IV subunit B  50 
 
 		 629 aa  617  1e-175  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3463  DNA topoisomerase IV subunit B  48.48 
 
 		 630 aa  616  1e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3043  DNA topoisomerase IV subunit B  49.46 
 
 		 628 aa  617  1e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5696  DNA topoisomerase IV subunit B  50 
 
 		 629 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.976581  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0604  DNA topoisomerase IV subunit B  49.85 
 
 		 632 aa  615  9.999999999999999e-175  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4963  DNA topoisomerase IV, B subunit  49.32 
 
 		 634 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0779  DNA topoisomerase IV subunit B  48.31 
 
 		 628 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.257119  hitchhiker  0.0000000426246 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3443  DNA topoisomerase IV subunit B  48.48 
 
 		 630 aa  615  9.999999999999999e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.411939  normal  0.211337 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0811  DNA topoisomerase IV subunit B  49 
 
 		 628 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000000000501954 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0551  DNA topoisomerase IV subunit B  49.39 
 
 		 634 aa  613  9.999999999999999e-175  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0773  DNA topoisomerase IV subunit B  49.46 
 
 		 628 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.95291  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0818  DNA topoisomerase IV subunit B  49 
 
 		 628 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.30526 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2008  DNA topoisomerase IV subunit B  48.4 
 
 		 626 aa  614  9.999999999999999e-175  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000820641  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0612  DNA topoisomerase IV subunit B  48.1 
 
 		 629 aa  612  9.999999999999999e-175  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3573  DNA topoisomerase IV subunit B  49 
 
 		 628 aa  613  9.999999999999999e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1983  DNA topoisomerase IV subunit B  49.25 
 
 		 636 aa  613  9.999999999999999e-175  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.267905  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2670  DNA topoisomerase IV subunit B  47.63 
 
 		 626 aa  610  1e-173  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0564  DNA topoisomerase IV subunit B  48.1 
 
 		 629 aa  611  1e-173  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.82908  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1446  DNA topoisomerase IV subunit B  49.46 
 
 		 629 aa  610  1e-173  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0951751  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>