170 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_43371 on replicon NC_009043
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009043  PICST_43371  part of small (ribosomal) subunit (SSU) processosome (contains U3 snoRNA)  100 
 
 		 533 aa  1099    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04456  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G07500)  31.92 
 
 		 625 aa  243  6e-63  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.715839  normal  1 
 
 
-
 
NC_006679  CNJ02290  conserved hypothetical protein  30.21 
 
 		 546 aa  226  1e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.827515  n/a   
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_3069  predicted protein  25.11 
 
 		 409 aa  138  2e-31  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  hitchhiker  0.00421566  normal  0.0506785 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17974  predicted protein  29.72 
 
 		 475 aa  124  6e-27  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0964806  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  23.62 
 
 		 1188 aa  72.4  0.00000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.12 
 
 		 1247 aa  67.4  0.0000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3206  WD-40 repeat-containing protein  23.72 
 
 		 728 aa  66.2  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.772589  normal  0.197804 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  23.21 
 
 		 1163 aa  65.1  0.000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3363  WD-40 repeat protein  29.33 
 
 		 826 aa  64.7  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.84 
 
 		 1454 aa  64.3  0.000000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.02 
 
 		 947 aa  63.5  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  28.09 
 
 		 1330 aa  62.8  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  25.93 
 
 		 742 aa  60.8  0.00000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  30.43 
 
 		 1474 aa  60.1  0.00000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  26.24 
 
 		 1552 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.16 
 
 		 1760 aa  59.7  0.0000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.3 
 
 		 1686 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  21.75 
 
 		 1652 aa  59.3  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  23.25 
 
 		 1196 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5032  pentapeptide repeat-containing protein  22 
 
 		 1190 aa  58.9  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.234505 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.15 
 
 		 1711 aa  58.5  0.0000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  23 
 
 		 1523 aa  58.2  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.95 
 
 		 930 aa  58.2  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.01 
 
 		 642 aa  58.2  0.0000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.7 
 
 		 676 aa  58.2  0.0000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  20.82 
 
 		 564 aa  57.8  0.0000005  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.86 
 
 		 1481 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.4 
 
 		 698 aa  57.8  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  23.88 
 
 		 1262 aa  57.4  0.0000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.18 
 
 		 682 aa  57  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1508  WD-40 repeat protein  21.69 
 
 		 1373 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000517344 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3681  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.38 
 
 		 664 aa  56.2  0.000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  19.91 
 
 		 1213 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  29.08 
 
 		 1411 aa  56.6  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  21.9 
 
 		 1193 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  22.22 
 
 		 1510 aa  56.2  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  22.34 
 
 		 1236 aa  55.8  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1541  WD-40 repeat-containing protein  27.15 
 
 		 589 aa  55.1  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.67824  normal  0.0621069 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  22.54 
 
 		 1657 aa  55.5  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  23.25 
 
 		 1831 aa  55.5  0.000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.28 
 
 		 636 aa  54.7  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.8 
 
 		 1363 aa  54.7  0.000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.61 
 
 		 733 aa  54.7  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1325  WD40 repeat, subgroup  24.03 
 
 		 1484 aa  54.3  0.000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.237461  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  21.19 
 
 		 1161 aa  53.9  0.000007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3070  WD-40 repeat protein  27.73 
 
 		 438 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.444201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0546  WD repeat-containing protein  21.05 
 
 		 505 aa  53.5  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.46 
 
 		 1684 aa  53.1  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  25.37 
 
 		 687 aa  53.1  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  21.19 
 
 		 1161 aa  52.8  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3771  WD-40 repeat-containing protein  26.36 
 
 		 1858 aa  52.8  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.0182471 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21 
 
 		 740 aa  53.5  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06505  transcriptional corepressor (Eurofung)  26.05 
 
 		 574 aa  52.8  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.772298  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2499  WD-40 repeat-containing protein  25.41 
 
 		 778 aa  52.4  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.55178 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0840  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  22.39 
 
 		 1868 aa  52.8  0.00002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  22.58 
 
 		 696 aa  52.4  0.00002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2844  WD-40 repeat-containing protein  26.89 
 
 		 440 aa  52.4  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  27.54 
 
 		 1214 aa  52  0.00002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.93 
 
 		 1072 aa  52.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1435  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.15 
 
 		 1626 aa  52  0.00003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.6 
 
 		 630 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3869  WD-40 repeat-containing protein  28.21 
 
 		 1553 aa  52  0.00003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.113625  normal  0.0582417 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2062  WD40 domain-containing protein  26.05 
 
 		 774 aa  52  0.00003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.483098  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  21.05 
 
 		 919 aa  51.6  0.00004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.41 
 
 		 1004 aa  51.2  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  26.12 
 
 		 1188 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  24.15 
 
 		 1443 aa  50.8  0.00005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2962  cytochrome c class I  25.21 
 
 		 448 aa  51.2  0.00005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.832203  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  22.63 
 
 		 657 aa  51.2  0.00005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.93 
 
 		 1072 aa  50.8  0.00006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6751  WD-40 repeat-containing protein  24.39 
 
 		 540 aa  50.8  0.00006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.136114 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0561  WD-40 repeat protein  22.43 
 
 		 1344 aa  50.4  0.00007  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0971599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3594  WD-40 repeat protein  28.21 
 
 		 1164 aa  50.4  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0139951 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.41 
 
 		 1599 aa  50.4  0.00007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2184  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.52 
 
 		 1240 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.653337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  27.91 
 
 		 677 aa  50.4  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  20.75 
 
 		 367 aa  50.4  0.00008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.37 
 
 		 1217 aa  50.4  0.00008  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_25989  predicted protein  28.57 
 
 		 215 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009364  OSTLU_50593  predicted protein  19.79 
 
 		 617 aa  50.4  0.00008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.594901  normal  0.592668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4060  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  25.42 
 
 		 792 aa  50.4  0.00009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.602409  hitchhiker  0.000910651 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5500  cytochrome c class I  26.15 
 
 		 431 aa  50.4  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20 
 
 		 1557 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1423  WD-40 repeat protein  23.35 
 
 		 344 aa  49.7  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4682  WD-40 repeat-containing protein  22.33 
 
 		 443 aa  50.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1213  NACHT nucleoside triphosphatase  20.42 
 
 		 1416 aa  50.1  0.0001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.349149  hitchhiker  0.000475649 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.96 
 
 		 1076 aa  49.7  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  21.76 
 
 		 464 aa  49.7  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  28.1 
 
 		 316 aa  50.1  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.41 
 
 		 596 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1354  WD-40 repeat protein  22.18 
 
 		 437 aa  49.7  0.0001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0105276  hitchhiker  0.000000574581 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  21.19 
 
 		 359 aa  49.3  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  23.78 
 
 		 344 aa  49.3  0.0002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  21.32 
 
 		 1221 aa  48.9  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0213  WD-40 repeat-containing protein  25.74 
 
 		 316 aa  49.7  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000259833  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1024  hypothetical protein  20.91 
 
 		 1026 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  decreased coverage  0.0000341432  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2489  WD-40 repeat protein  21.77 
 
 		 565 aa  49.3  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3194  cytochrome c class I  23.94 
 
 		 428 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  24.24 
 
 		 1183 aa  49.3  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>