98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_32792 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01367  Ribosome biogenesis protein erb1 (Eukaryotic ribosome biogenesis protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDL3]  52.66 
 
 
799 aa  745    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000573535  normal  0.686963 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04640  rRNA processing-related protein, putative  45.41 
 
 
830 aa  670    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32792  predicted protein  100 
 
 
768 aa  1573    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.980986  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16814  predicted protein  39.44 
 
 
662 aa  452  1e-125  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.728956  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119515  Ribosome biogenesis protein BOP1 (Block of proliferation 1 protein), probable  30.72 
 
 
577 aa  272  2e-71  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  25.12 
 
 
1831 aa  88.2  5e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  25.31 
 
 
1652 aa  73.9  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  24.81 
 
 
1211 aa  68.2  0.0000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  21.07 
 
 
947 aa  67  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  24.82 
 
 
696 aa  67  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  26.82 
 
 
1364 aa  66.6  0.000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  21.99 
 
 
1474 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  21.45 
 
 
1552 aa  64.7  0.000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  23.06 
 
 
1399 aa  63.9  0.00000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.19 
 
 
1163 aa  62.4  0.00000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.43 
 
 
642 aa  58.9  0.0000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  42.25 
 
 
1188 aa  58.5  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  21.45 
 
 
1208 aa  57  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  21.01 
 
 
1557 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  23.87 
 
 
962 aa  55.8  0.000003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.05 
 
 
1267 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5333  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.12 
 
 
1684 aa  55.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.90192  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  20.42 
 
 
1760 aa  53.9  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 
1807 aa  53.9  0.00001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009360  OSTLU_32128  predicted protein  34.72 
 
 
319 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.0599879 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  20.85 
 
 
919 aa  52.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0547  WD-40 repeat protein  40.54 
 
 
477 aa  52.4  0.00003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1786  WD-40 repeat-containing protein  35.23 
 
 
1427 aa  52  0.00004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.441157  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1627  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.5 
 
 
630 aa  52  0.00004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.59765  normal  0.0942713 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09085  U5 snRNP complex subunit, putative (AFU_orthologue; AFUA_7G02280)  24.09 
 
 
359 aa  52  0.00004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.320529  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  20.7 
 
 
1454 aa  51.6  0.00006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  21.76 
 
 
1221 aa  51.2  0.00007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2971  WD-40 repeat-containing protein  23.34 
 
 
1367 aa  51.2  0.00008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  22.87 
 
 
1183 aa  50.8  0.00008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  21.34 
 
 
1363 aa  50.1  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0419  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.11 
 
 
740 aa  50.4  0.0001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  30.99 
 
 
1196 aa  50.1  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4252  WD-40 repeat-containing protein  21.93 
 
 
1424 aa  49.7  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.501692  normal  0.871737 
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  30.59 
 
 
782 aa  48.9  0.0003  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4184  hypothetical protein  22.61 
 
 
1657 aa  48.9  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0532898  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3660  WD repeat-containing protein  35.38 
 
 
1097 aa  48.9  0.0004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.95 
 
 
1004 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
NC_006681  CNL05350  Phospholipase A-2-activating protein, putative  30.25 
 
 
842 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2154  WD-40 repeat-containing protein  35.37 
 
 
1041 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  25.12 
 
 
1190 aa  48.5  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  23.1 
 
 
1209 aa  48.1  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  25.81 
 
 
367 aa  48.1  0.0006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1424  WD-40 repeat protein  21.83 
 
 
344 aa  47.8  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4467  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.38 
 
 
698 aa  47.8  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  29.59 
 
 
756 aa  47.4  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3489  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  40 
 
 
1039 aa  47.4  0.001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.261998  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1807  WD-40 repeat-containing protein  31.94 
 
 
1214 aa  47  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000135295 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  22.74 
 
 
1477 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3256  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.99 
 
 
828 aa  47.4  0.001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.380314  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0095  WD-40 repeat-containing protein  33.85 
 
 
342 aa  47.4  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000200238  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  30.19 
 
 
1242 aa  46.6  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  28.57 
 
 
914 aa  46.6  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  37.1 
 
 
677 aa  47  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  31.33 
 
 
447 aa  46.6  0.002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  32.89 
 
 
1188 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  20.29 
 
 
1236 aa  46.2  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00630  nuclear mRNA splicing, via spliceosome-related protein, putative  22.37 
 
 
870 aa  46.2  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2167  WD-40 repeat protein  26.73 
 
 
316 aa  46.6  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  30.88 
 
 
742 aa  46.6  0.002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  31.25 
 
 
564 aa  46.6  0.002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1470  WD40 repeat, subgroup  41.67 
 
 
181 aa  46.2  0.002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01335  protein transport protein (LST8), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G09560)  24.75 
 
 
393 aa  45.8  0.003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.809459  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  35 
 
 
1443 aa  45.8  0.003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  27.6 
 
 
1348 aa  46.2  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  25 
 
 
1686 aa  46.2  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  22.39 
 
 
1607 aa  45.8  0.003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1993  WD-40 repeat protein  27.59 
 
 
316 aa  46.2  0.003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.697085 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.8 
 
 
576 aa  45.4  0.003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  53.12 
 
 
675 aa  45.4  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4034  WD40 domain-containing protein  34.33 
 
 
657 aa  45.4  0.004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06803  Pfs, NACHT and WD domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G07100)  26.76 
 
 
790 aa  45.4  0.004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.649934  normal  0.339572 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  18.85 
 
 
1330 aa  45.4  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1121  WD40 repeat, subgroup  20.86 
 
 
608 aa  45.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.285866  normal  0.998654 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5355  WD-40 repeat protein  41.03 
 
 
1411 aa  45.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.113671 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  21.63 
 
 
1262 aa  45.1  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  23.04 
 
 
1217 aa  45.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0184  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  33.68 
 
 
608 aa  45.1  0.005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0231807  normal  0.531865 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  27.33 
 
 
1711 aa  45.1  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  25.77 
 
 
316 aa  44.7  0.006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1339  WD-40 repeat-containing protein  34.38 
 
 
504 aa  44.7  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.143259  normal  0.33399 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  19.44 
 
 
622 aa  44.7  0.007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03926  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08380)  46.15 
 
 
522 aa  44.7  0.007  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.413219  normal  0.75025 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2529  WD-40 repeat protein  33.75 
 
 
248 aa  44.7  0.007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00110539  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_12028  predicted protein  27.91 
 
 
618 aa  44.7  0.007  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.400153  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.67 
 
 
596 aa  44.7  0.007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_50173  predicted protein  27.71 
 
 
389 aa  44.3  0.008  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.828985  normal 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06385  transcriptional corepressor (Eurofung)  27.66 
 
 
434 aa  44.3  0.008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.476931  normal 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  30.95 
 
 
682 aa  44.3  0.009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND05530  RNA processing-related protein, putative  31.78 
 
 
511 aa  44.3  0.009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.104569  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  25.82 
 
 
1205 aa  44.3  0.009  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  35.38 
 
 
335 aa  44.3  0.01  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4475  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 
1161 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.416267 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4412  WD-40 repeat protein  22.92 
 
 
1161 aa  44.3  0.01  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>