154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CNB04640 on replicon NC_006684
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
BN001308  ANIA_01367  Ribosome biogenesis protein erb1 (Eukaryotic ribosome biogenesis protein 1) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BDL3]  48.12 
 
 
799 aa  635    Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  decreased coverage  0.000573535  normal  0.686963 
 
 
-
 
NC_006684  CNB04640  rRNA processing-related protein, putative  100 
 
 
830 aa  1701    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_32792  predicted protein  48.51 
 
 
768 aa  660    Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.980986  normal  0.0911162 
 
 
-
 
NC_011696  PHATRDRAFT_16814  predicted protein  40.18 
 
 
662 aa  494  9.999999999999999e-139  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.728956  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119515  Ribosome biogenesis protein BOP1 (Block of proliferation 1 protein), probable  29.89 
 
 
577 aa  293  9e-78  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1556  ribosome assembly protein 4 (RSA4)  23.71 
 
 
1652 aa  83.2  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.123778  normal  0.225056 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3153  metallophosphoesterase  22.25 
 
 
1831 aa  82  0.00000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.479673  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1167  WD-40 repeat protein  21.59 
 
 
1163 aa  78.2  0.0000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0112  WD-40 repeat protein  25.35 
 
 
1236 aa  73.9  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0636944 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3079  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  22.62 
 
 
1760 aa  74.3  0.00000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.606691  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4792  WD-40 repeat protein  23.57 
 
 
1363 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3245  WD-40 repeat protein  23.73 
 
 
947 aa  72.8  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011737  PCC7424_5394  WD-40 repeat protein  23.57 
 
 
1247 aa  72.4  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2817  WD-40 repeat-containing protein  24.56 
 
 
1196 aa  70.9  0.00000000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.230726 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3078  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  23.26 
 
 
1711 aa  69.7  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.771707  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3275  pentapeptide repeat-containing protein  23.01 
 
 
1474 aa  69.3  0.0000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.918383  normal  0.348051 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4295  WD-40 repeat-containing protein  27.27 
 
 
1399 aa  69.7  0.0000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1234  WD-40 repeat protein  23.03 
 
 
1188 aa  69.3  0.0000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.593825 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2183  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.16 
 
 
1557 aa  66.2  0.000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.150849  normal 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08468  NACHT and WD40 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_7G08500)  24.91 
 
 
1364 aa  66.2  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.109375 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4855  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.42 
 
 
676 aa  65.5  0.000000004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000172521 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0892  WD-40 repeat-containing protein  26.24 
 
 
696 aa  63.9  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  decreased coverage  0.000103056  unclonable  0.0000205441 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3023  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  27.92 
 
 
1267 aa  62  0.00000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.164436 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3846  pentapeptide repeat protein  23.01 
 
 
1443 aa  61.2  0.00000008  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0633  WD-40 repeat protein  26.97 
 
 
1183 aa  60.8  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1814  NB-ARC domain protein  23.51 
 
 
1454 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04226  small nucleolar ribonucleoprotein complex subunit (SOF1), putative (AFU_orthologue; AFUA_1G06290)  24.23 
 
 
447 aa  58.9  0.0000004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1921  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.26 
 
 
642 aa  58.5  0.0000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0364982  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_48514  predicted protein  29.37 
 
 
931 aa  58.5  0.0000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1418  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  25.53 
 
 
1607 aa  58.2  0.0000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3532  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.45 
 
 
1072 aa  58.2  0.0000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.397828  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3600  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.45 
 
 
1072 aa  57.8  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0132  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.23 
 
 
682 aa  57.8  0.0000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.876477  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3099  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  23.14 
 
 
1599 aa  57.4  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.392467 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4813  WD-40 repeat-containing protein  23.34 
 
 
1477 aa  57  0.000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.974814 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1480  pentapeptide repeat-containing protein  24.43 
 
 
1807 aa  57  0.000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.811465  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3379  protein kinase  22.4 
 
 
1242 aa  57.4  0.000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.280356  decreased coverage  0.000456668 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_17300  predicted protein  23.05 
 
 
439 aa  57.4  0.000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0056  WD-40 repeat-containing tyrosine protein kinase  22.87 
 
 
742 aa  56.6  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.718605  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0039  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.09 
 
 
1686 aa  56.2  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0781722  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2132  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.16 
 
 
596 aa  56.6  0.000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4789  WD-40 repeat protein  23.05 
 
 
1193 aa  55.8  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  unclonable  0.00121677  normal  0.726129 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2975  WD40 repeatdomain-containing protein-like protein  22.51 
 
 
1901 aa  55.5  0.000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32006  WD domain protein  24.55 
 
 
367 aa  55.5  0.000004  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2629  Fis family transcriptional regulator  23.35 
 
 
1221 aa  55.1  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0193255  normal 
 
 
-
 
NC_006670  CNA07530  57.7 kda trp-asp repeats containing protein, putative  29.69 
 
 
523 aa  55.1  0.000006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.585793  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4252  WD-40 repeat protein  24.16 
 
 
1209 aa  54.7  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.23422  hitchhiker  0.00156947 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2588  WD-40 repeat protein  20.55 
 
 
1188 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.994241 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7190  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  26.42 
 
 
675 aa  53.5  0.00001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0635785 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3932  WD-40 repeat-containing protein  49.02 
 
 
914 aa  54.3  0.00001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.237365  unclonable  0.0000634097 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_08505  conserved hypothetical protein  29.11 
 
 
954 aa  53.5  0.00002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.546968  normal  0.0214915 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2104  WD-40 repeat-containing protein  22.34 
 
 
1552 aa  53.1  0.00002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.581911  normal  0.024962 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0065  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.85 
 
 
930 aa  53.1  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011677  PHATRDRAFT_27518  predicted protein  27.97 
 
 
962 aa  53.1  0.00002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3450  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  22.76 
 
 
1076 aa  52.4  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.88473  n/a   
 
 
-
 
NC_011683  PHATRDRAFT_21929  predicted protein  26.44 
 
 
1270 aa  52.4  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_29608  PolyAdenylation factor subunit 1  22.44 
 
 
402 aa  52.8  0.00003  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.275441  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3478  WD-40 repeat protein  23.48 
 
 
1208 aa  52  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.590785 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1160  WD40 repeat, subgroup  25.77 
 
 
1217 aa  51.6  0.00005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3456  Serine/threonine protein kinase-related protein  20.33 
 
 
1262 aa  51.6  0.00006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.23554  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2851  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  21.38 
 
 
677 aa  51.6  0.00006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_2326  predicted protein  25 
 
 
363 aa  51.6  0.00006  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1581  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  35.38 
 
 
636 aa  51.6  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00979942 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1451  WD-40 repeat protein  38.18 
 
 
756 aa  51.6  0.00007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4025  NB-ARC domain-containing protein  25 
 
 
1523 aa  51.6  0.00007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.284567  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04518  WD repeat protein (AFU_orthologue; AFUA_2G03080)  24.06 
 
 
1289 aa  51.2  0.00008  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006684  CNB05570  ER to Golgi transport-related protein, putative  28 
 
 
829 aa  51.2  0.00008  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.0446639  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2471  peptidase C14, caspase catalytic subunit p20  24.83 
 
 
1481 aa  51.2  0.00008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.420848  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0717  WD-40 repeat protein  24.01 
 
 
1348 aa  51.2  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.635775 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_87280  predicted protein  25.86 
 
 
1204 aa  51.2  0.00009  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0864133  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4408  WD-40 repeat protein  27.22 
 
 
1177 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.760311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4614  WD40 repeat-domain-containing protein-like protein  23.16 
 
 
919 aa  50.8  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.334314  normal  0.398797 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2033  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  23.32 
 
 
733 aa  50.4  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0914422 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2226  WD-40 repeat-containing protein  25.89 
 
 
464 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.797248  normal  0.32606 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_56432  predicted protein  25 
 
 
407 aa  50.8  0.0001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491701  normal  0.770378 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0582  WD-40 repeat protein  22.55 
 
 
1264 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1908  WD-40 repeat protein  23.91 
 
 
365 aa  50.4  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0565  WD-40 repeat protein  22.55 
 
 
1264 aa  50.8  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006680  CNK02380  nucleus protein, putative  43.75 
 
 
1275 aa  49.7  0.0002  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3451  WD40 repeat, subgroup  23.63 
 
 
1357 aa  49.7  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001301  ANIA_06960  conserved hypothetical protein  23.63 
 
 
1878 aa  49.3  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.94406 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0067  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  21.24 
 
 
622 aa  49.3  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0173  WD-40 repeat-containing protein  21.56 
 
 
346 aa  48.9  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00199639  normal  0.0808498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3042  serine/threonine protein kinase with WD40 repeats  26.92 
 
 
1004 aa  48.9  0.0004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00005148 
 
 
-
 
BN001306  ANIA_03026  Coatomer alpha subunit [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:O59946]  25.31 
 
 
1205 aa  48.9  0.0004  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.107466 
 
 
-
 
NC_006693  CNH00940  transcription initiation factor tfiid 90 kda subunit (tafii-90), putative  23.87 
 
 
813 aa  48.5  0.0004  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.152566  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0703  WD-40 repeat protein  20.82 
 
 
1190 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3419  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  29.53 
 
 
898 aa  48.9  0.0004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2355  WD-40 repeat-containing protein  41.54 
 
 
316 aa  48.9  0.0004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.861794  n/a   
 
 
-
 
NC_011885  Cyan7425_0027  WD-40 repeat protein  20.44 
 
 
1213 aa  48.9  0.0004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3599  WD-40 repeat-containing protein  23.58 
 
 
1211 aa  48.5  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000373823 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4625  WD-40 repeat-containing protein  24.57 
 
 
1510 aa  48.5  0.0005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3383  protein kinase  23.72 
 
 
1330 aa  48.5  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.088412  normal  0.011818 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3896  serine/threonine protein kinase  29.17 
 
 
687 aa  48.5  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND02590  conserved hypothetical protein  26.95 
 
 
418 aa  48.5  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE03830  general transcriptional repressor, putative  37.14 
 
 
564 aa  48.5  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2673  WD-40 repeat-containing protein  26.82 
 
 
335 aa  48.1  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009048  PICST_64717  TFIID and SAGA subunit  40.68 
 
 
782 aa  48.1  0.0007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0491121  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2862  WD-40 repeat-containing protein  22.05 
 
 
1229 aa  47.8  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.411367  normal  0.0157624 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3867  WD-40 repeat-containing serine/threonin protein kinase  20.91 
 
 
576 aa  47.8  0.0008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>