More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_7678 on replicon NC_011689
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011689  PHATRDRAFT_7678  predicted protein  100 
 
 
134 aa  269  8.000000000000001e-72  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78259  predicted protein  37.79 
 
 
437 aa  97.8  5e-20  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.120102  normal  0.0812781 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05166  phosphatidate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G07010)  37.35 
 
 
450 aa  93.2  1e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422511  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
289 aa  92  3e-18  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  41.91 
 
 
302 aa  91.3  4e-18  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3406  phosphatidate cytidylyltransferase  40.44 
 
 
290 aa  90.9  5e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00609464  n/a   
 
 
-
 
NC_006686  CND00990  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  35.23 
 
 
646 aa  89.7  1e-17  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.736712  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  38.71 
 
 
278 aa  89.7  1e-17  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  39.55 
 
 
284 aa  89  2e-17  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3584  phosphatidate cytidylyltransferase  41.8 
 
 
281 aa  88.6  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3109  phosphatidate cytidylyltransferase  44.8 
 
 
277 aa  87.8  5e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000003676  hitchhiker  0.00451842 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  36.64 
 
 
317 aa  87.8  5e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3650  phosphatidate cytidylyltransferase  39.17 
 
 
281 aa  86.7  9e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  41.41 
 
 
296 aa  86.3  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  34.03 
 
 
351 aa  86.3  1e-16  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3724  Phosphatidate cytidylyltransferase  39.17 
 
 
281 aa  86.7  1e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1388  phosphatidate cytidylyltransferase  38.1 
 
 
322 aa  86.7  1e-16  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000329465 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
331 aa  86.3  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  38.17 
 
 
310 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  39.67 
 
 
298 aa  85.9  2e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
284 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  33.56 
 
 
342 aa  85.1  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 
296 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3705  phosphatidate cytidylyltransferase  42.98 
 
 
277 aa  84.3  4e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  35.11 
 
 
309 aa  84.3  5e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2202  phosphatidate cytidylyltransferase  37.59 
 
 
339 aa  84.3  5e-16  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.497209  normal  0.34108 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3645  phosphatidate cytidylyltransferase  38.81 
 
 
263 aa  84  6e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.177516  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4016  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
318 aa  84  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  39.84 
 
 
246 aa  83.6  8e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0354  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
267 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1234  phosphatidate cytidylyltransferase  42.74 
 
 
441 aa  83.2  0.000000000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00248565 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0691  phosphatidate cytidylyltransferase  35.88 
 
 
261 aa  83.2  0.000000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00000558794  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2014  phosphatidate cytidylyltransferase  41.09 
 
 
280 aa  83.2  0.000000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.132755  hitchhiker  0.00415273 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1533  Phosphatidate cytidylyltransferase  40.5 
 
 
368 aa  82.4  0.000000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.0529885 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1726  phosphatidate cytidylyltransferase  40.15 
 
 
313 aa  82  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3578  phosphatidate cytidylyltransferase  38.76 
 
 
313 aa  82.8  0.000000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09930  CDP-diglyceride synthetase  41.96 
 
 
293 aa  82.4  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.971112  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0358  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthetase)  40.94 
 
 
282 aa  82.4  0.000000000000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3930  phosphatidate cytidylyltransferase  37.4 
 
 
282 aa  82  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.567007  normal  0.131428 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0998  phosphatidate cytidylyltransferase  39.1 
 
 
276 aa  82  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.371374  normal  0.808071 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  36.84 
 
 
260 aa  81.6  0.000000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
295 aa  81.6  0.000000000000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  41.67 
 
 
280 aa  81.6  0.000000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12895  integral membrane phosphatidate cytidylyltransferase cdsA  41.22 
 
 
306 aa  82  0.000000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.778729  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0961  phosphatidate cytidylyltransferase  37.98 
 
 
283 aa  81.6  0.000000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5907  phosphatidate cytidylyltransferase  39.37 
 
 
281 aa  82  0.000000000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.358794  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  37.4 
 
 
264 aa  81.3  0.000000000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2474  phosphatidate cytidylyltransferase  35.38 
 
 
263 aa  81.3  0.000000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000621151  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1811  phosphatidate cytidylyltransferase  39.52 
 
 
261 aa  81.3  0.000000000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000250905  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0372  phosphatidate cytidylyltransferase  35.34 
 
 
267 aa  81.3  0.000000000000005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  37.04 
 
 
310 aa  81.3  0.000000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_11230  CDP-diglyceride synthetase  37.78 
 
 
291 aa  80.9  0.000000000000005  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.254783  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_316  phosphatidate cytidylyltransferase  34.75 
 
 
267 aa  80.9  0.000000000000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2701  putative phosphatidate cytidylyltransferase  36.64 
 
 
311 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1845  phosphatidate cytidylyltransferase  41.94 
 
 
242 aa  80.9  0.000000000000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.153368  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3840  phosphatidate cytidylyltransferase  38.64 
 
 
318 aa  80.1  0.000000000000009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2935  phosphatidate cytidylyltransferase  35.88 
 
 
312 aa  80.1  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219644  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  35.77 
 
 
208 aa  79.7  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1763  phosphatidate cytidylyltransferase  37.9 
 
 
298 aa  79.3  0.00000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.404043  hitchhiker  0.00115025 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0530  phosphatidate cytidylyltransferase  37.96 
 
 
279 aa  79.7  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_31760  putative phosphatidate cytidylyltransferase  35.88 
 
 
311 aa  79.3  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.978332  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0980  CDP-diglyceride synthetase  36.22 
 
 
265 aa  79.7  0.00000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0459166  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1371  phosphatidate cytidylyltransferase  36.51 
 
 
306 aa  79.7  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.593989  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3239  phosphatidate cytidylyltransferase  37.21 
 
 
308 aa  79.7  0.00000000000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1350  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.627911  normal  0.044261 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0485  phosphatidate cytidylyltransferase  40.46 
 
 
296 aa  79  0.00000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.468496  normal  0.270434 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1915  phosphatidate cytidylyltransferase  36.76 
 
 
264 aa  78.6  0.00000000000002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.151014  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1525  putative phosphatidate cytidylyltransferase  34.59 
 
 
307 aa  79.3  0.00000000000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 
264 aa  79.3  0.00000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
260 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  39.68 
 
 
280 aa  79.3  0.00000000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0890  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  37.69 
 
 
260 aa  79  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1867  CDP-diglyceride synthetase-like protein  37.7 
 
 
281 aa  79.3  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.15306 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1372  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
309 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0687684  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  39.85 
 
 
260 aa  79  0.00000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  37.8 
 
 
252 aa  79  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1326  phosphatidate cytidylyltransferase  42.86 
 
 
484 aa  78.6  0.00000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1579  phosphatidate cytidylyltransferase  38.52 
 
 
262 aa  78.2  0.00000000000003  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.118655  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1590  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
298 aa  78.6  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06780  CDP-diglyceride synthetase  38.28 
 
 
278 aa  78.2  0.00000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  decreased coverage  0.000170794  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1250  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
309 aa  78.6  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1488  phosphatidate cytidylyltransferase  37.5 
 
 
280 aa  77.8  0.00000000000004  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal  0.912003 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0448  phosphatidate cytidylyltransferase  38.66 
 
 
275 aa  78.2  0.00000000000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00105416  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4517  phosphatidate cytidylyltransferase  36.22 
 
 
309 aa  78.2  0.00000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.314486  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0595  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 
258 aa  77.8  0.00000000000004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.94345  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2012  phosphatidate cytidylyltransferase  37.1 
 
 
298 aa  77.8  0.00000000000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.486344  normal  0.255286 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
309 aa  77.8  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  43.86 
 
 
294 aa  77.8  0.00000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  40.16 
 
 
233 aa  77.4  0.00000000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  36.67 
 
 
309 aa  77.4  0.00000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0720  phosphatidate cytidylyltransferase  38.46 
 
 
314 aa  77.4  0.00000000000006  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  37.9 
 
 
264 aa  77.4  0.00000000000006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  37.9 
 
 
267 aa  77  0.00000000000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2778  CDP-diglyceride synthetase/phosphatidate cytidylyltransferase  38.58 
 
 
313 aa  77  0.00000000000009  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.642152  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2249  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.335723  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2236  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.25879  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0757  phosphatidate cytidylyl transferase  35.48 
 
 
216 aa  76.3  0.0000000000001  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1492  phosphatidate cytidylyltransferase  36.29 
 
 
298 aa  76.3  0.0000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2222  phosphatidate cytidylyltransferase  37.01 
 
 
292 aa  76.3  0.0000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.226682  normal  0.250157 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>