230 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CND00990 on replicon NC_006686
Organism: Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006686  CND00990  phosphatidate cytidylyltransferase, putative  100 
 
 		 646 aa  1340    Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.736712  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05166  phosphatidate cytidylyltransferase (AFU_orthologue; AFUA_1G07010)  51.52 
 
 		 450 aa  432  1e-119  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.422511  normal  1 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_78259  predicted protein  41.71 
 
 		 437 aa  349  1e-94  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.120102  normal  0.0812781 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_32481  predicted protein  36.54 
 
 		 478 aa  236  9e-61  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0640896  decreased coverage  0.0098144 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_7678  predicted protein  35.23 
 
 		 134 aa  92  3e-17  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.208787  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3955  phosphatidate cytidylyltransferase  27.86 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.704173  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06040  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.96 
 
 		 310 aa  67.4  0.0000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl286  CDP-diglyceride synthetase  27.75 
 
 		 351 aa  67.4  0.0000000009  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000989718  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5541  phosphatidate cytidylyltransferase  28.64 
 
 		 309 aa  65.9  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0005  phosphatidate cytidylyltransferase  30 
 
 		 310 aa  65.5  0.000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0664  phosphatidate cytidylyltransferase  28.16 
 
 		 295 aa  64.7  0.000000005  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1008  phosphatidate cytidylyltransferase  28.98 
 
 		 289 aa  63.5  0.00000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3704  phosphatidate cytidylyltransferase  26.11 
 
 		 260 aa  62.8  0.00000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0101996  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0630  Phosphatidate cytidylyltransferase  25.13 
 
 		 475 aa  63.2  0.00000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.529859  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2049  phosphatidate cytidylyltransferase  25.5 
 
 		 252 aa  61.6  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.536953  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0713  CDP-diglyceride synthase  28.34 
 
 		 285 aa  61.6  0.00000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00713923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3655  phosphatidate cytidylyltransferase  29.44 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.627135 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2598  phosphatidate cytidylyltransferase  27.68 
 
 		 296 aa  61.6  0.00000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0593  phosphatidate cytidylyltransferase  29.52 
 
 		 381 aa  60.8  0.00000007  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_07921  phosphatidate cytidylyltransferase  29.41 
 
 		 246 aa  60.8  0.00000008  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.111396  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1184  phosphatidate cytidylyltransferase  26.14 
 
 		 302 aa  60.8  0.00000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1675  phosphatidate cytidylyltransferase  24.16 
 
 		 296 aa  60.5  0.0000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0828  phosphatidate cytidylyltransferase  28.49 
 
 		 260 aa  59.3  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  decreased coverage  0.00232392  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0512  phosphatidate cytidylyltransferase  29.52 
 
 		 275 aa  58.9  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.248492  normal  0.282224 
 
 
-
 
NC_002950  PG0046  phosphatidate cytidylyltransferase  30.81 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23570  CDP-diglyceride synthetase  25.71 
 
 		 284 aa  58.9  0.0000003  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.300811 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1536  phosphatidate cytidylyltransferase  29.24 
 
 		 241 aa  58.5  0.0000004  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.575461  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2112  phosphatidate cytidylyltransferase  26.97 
 
 		 297 aa  58.5  0.0000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.591828  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1347  phosphatidate cytidylyltransferase  28.49 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00448682  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4663  phosphatidate cytidylyltransferase  29.59 
 
 		 317 aa  58.2  0.0000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1321  phosphatidate cytidylyltransferase  28.49 
 
 		 260 aa  57.8  0.0000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1000  phosphatidate cytidylyltransferase  29.31 
 
 		 278 aa  57.8  0.0000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000130421  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0592  phosphatidate cytidylyltransferase  26.25 
 
 		 306 aa  57.4  0.0000007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1949  phosphatidate cytidylyltransferase  25.69 
 
 		 267 aa  57.4  0.0000007  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1667  phosphatidate cytidylyltransferase  25.69 
 
 		 264 aa  57.8  0.0000007  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.114415  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1613  phosphatidate cytidylyltransferase  26.74 
 
 		 280 aa  57  0.0000009  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1386  phosphatidate cytidylyltransferase  28.49 
 
 		 270 aa  57.4  0.0000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000372175  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_11751  phosphatidate cytidylyltransferase  27.06 
 
 		 285 aa  56.6  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.616404  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3429  CDP-diglyceride synthase  30.81 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00445067  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1019  CDP-diglyceride synthase  30.81 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000480748  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1432  phosphatidate cytidylyltransferase  27.91 
 
 		 270 aa  56.2  0.000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1072  CDP-diglyceride synthase  30.81 
 
 		 282 aa  55.8  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00432402  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1164  phosphatidate cytidylyltransferase  28.57 
 
 		 319 aa  55.8  0.000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1346  phosphatidate cytidylyltransferase  28.65 
 
 		 241 aa  56.6  0.000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.584231  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3934  phosphatidate cytidylyltransferase  26.32 
 
 		 280 aa  55.5  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1182  phosphatidate cytidylyltransferase  26.7 
 
 		 290 aa  55.5  0.000003  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2044  phosphatidate cytidylyltransferase  27.17 
 
 		 286 aa  55.1  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.127944 
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_37424  predicted protein  27.62 
 
 		 364 aa  55.1  0.000004  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.198138  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1916  phosphatidate cytidylyltransferase  24.33 
 
 		 233 aa  54.7  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1446  phosphatidate cytidylyltransferase  27.62 
 
 		 275 aa  54.7  0.000005  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1096  phosphatidate cytidylyltransferase  27.5 
 
 		 285 aa  54.3  0.000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0340  phosphatidate cytidylyltransferase  25.15 
 
 		 342 aa  54.3  0.000007  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.221138  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0517  phosphatidate cytidylyltransferase  27.11 
 
 		 272 aa  53.9  0.000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0947  CDP-diglyceride synthase  29.71 
 
 		 285 aa  53.9  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00468877  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2084  phosphatidate cytidylyltransferase  26.98 
 
 		 286 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.652517  normal  0.236711 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1591  phosphatidate cytidylyltransferase  27.17 
 
 		 268 aa  53.5  0.00001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3159  Phosphatidate cytidylyltransferase  29.21 
 
 		 285 aa  53.5  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0555993  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1536  phosphatidate cytidylyltransferase  28.65 
 
 		 242 aa  53.5  0.00001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2005  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 284 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1535  phosphatidate cytidylyltransferase  27.27 
 
 		 294 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2051  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 284 aa  53.9  0.00001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.674126  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1986  phosphatidate cytidylyltransferase  31.25 
 
 		 284 aa  53.5  0.00001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.293164  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0526  phosphatidate cytidylyltransferase  24.51 
 
 		 208 aa  52.8  0.00002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6184  phosphatidate cytidylyltransferase  29.38 
 
 		 309 aa  52.8  0.00002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.366901 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0125  phosphatidate cytidylyltransferase  29.49 
 
 		 251 aa  53.1  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.447274  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2358  phosphatidate cytidylyltransferase  26.98 
 
 		 286 aa  52.8  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.213318 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_11911  phosphatidate cytidylyltransferase  26.25 
 
 		 285 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1146  Phosphatidate cytidylyltransferase  23.96 
 
 		 264 aa  53.1  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00301357  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_11921  phosphatidate cytidylyltransferase  27.5 
 
 		 285 aa  52.4  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.664589  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3354  CDP-diglyceride synthase  31.15 
 
 		 285 aa  52.8  0.00002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141568  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4512  phosphatidate cytidylyltransferase  48.89 
 
 		 289 aa  52.8  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.353478  normal  0.71378 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0572  phosphatidate cytidylyltransferase  25.77 
 
 		 328 aa  52.4  0.00003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.22414  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1634  phosphatidate cytidylyltransferase  27.33 
 
 		 254 aa  52  0.00003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1275  phosphatidate cytidylyltransferase  25.68 
 
 		 285 aa  52  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.118666  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0245  phosphatidate cytidylyltransferase (CDP-diglyceride synthase)  29.09 
 
 		 264 aa  52.4  0.00003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00172  hypothetical protein  30.25 
 
 		 249 aa  52  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0666446  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2971  phosphatidate cytidylyltransferase  25.24 
 
 		 283 aa  52.4  0.00003  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.309867  normal  0.92756 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3445  phosphatidate cytidylyltransferase  27.27 
 
 		 285 aa  52  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.182672  normal  0.481873 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00173  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0579105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3428  Phosphatidate cytidylyltransferase  30.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000894621  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2887  phosphatidate cytidylyltransferase  28.93 
 
 		 298 aa  51.6  0.00005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.423828  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3276  phosphatidate cytidylyltransferase  26.51 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00000594072  hitchhiker  0.000341805 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0177  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000261651  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0168  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00227409  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3263  phosphatidate cytidylyltransferase  50 
 
 		 282 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2852  phosphatidate cytidylyltransferase  35.9 
 
 		 282 aa  51.2  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.14681  normal  0.466722 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0185  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000611994  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0179  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000236154  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6363  phosphatidate cytidylyltransferase  28.75 
 
 		 309 aa  51.6  0.00005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.459085  normal  0.173645 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3485  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  51.2  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00144411  normal  0.0353407 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0814  phosphatidate cytidylyltransferase  28.92 
 
 		 259 aa  51.2  0.00006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000421661  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1655  phosphatidate cytidylyltransferase  40.32 
 
 		 259 aa  51.2  0.00006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0567  phosphatidate cytidylyltransferase  26.09 
 
 		 265 aa  50.8  0.00007  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0186  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.00007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00459839  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3784  CDP-diglyceride synthase  27.87 
 
 		 282 aa  50.8  0.00007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0388384  hitchhiker  0.0021179 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0805  phosphatidate cytidylyltransferase  43.14 
 
 		 343 aa  50.8  0.00007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01126  phosphatidate cytidylyltransferase  27.91 
 
 		 270 aa  50.8  0.00007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.188617  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2232  phosphatidate cytidylyltransferase  26.37 
 
 		 295 aa  50.8  0.00008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0247  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.748652 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0260  CDP-diglyceride synthase  30.25 
 
 		 285 aa  50.8  0.00008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.451367 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>